MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-10

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017424	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	387827799
2	NC_017424	ATTA	2	8	947	954	50 %	50 %	0 %	0 %	387827799
3	NC_017424	TTGC	2	8	1618	1625	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017424	GTTC	2	8	1683	1690	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017424	AAAG	2	8	2384	2391	75 %	0 %	25 %	0 %	387827800
6	NC_017424	ATTT	2	8	2521	2528	25 %	75 %	0 %	0 %	387827800
7	NC_017424	TGCT	2	8	2533	2540	0 %	50 %	25 %	25 %	387827800
8	NC_017424	GCAA	2	8	2681	2688	50 %	0 %	25 %	25 %	387827801
9	NC_017424	ATGT	2	8	3019	3026	25 %	50 %	25 %	0 %	387827801
10	NC_017424	GTAT	2	8	3044	3051	25 %	50 %	25 %	0 %	387827801
11	NC_017424	ATAA	2	8	3126	3133	75 %	25 %	0 %	0 %	387827801
12	NC_017424	CAAT	2	8	3208	3215	50 %	25 %	0 %	25 %	387827801
13	NC_017424	TAAA	2	8	3367	3374	75 %	25 %	0 %	0 %	387827802
14	NC_017424	TTTA	2	8	3894	3901	25 %	75 %	0 %	0 %	387827802
15	NC_017424	AGTA	2	8	4787	4794	50 %	25 %	25 %	0 %	387827803
16	NC_017424	CTAC	2	8	4799	4806	25 %	25 %	0 %	50 %	387827803
17	NC_017424	TCAT	2	8	4846	4853	25 %	50 %	0 %	25 %	387827803
18	NC_017424	TACT	2	8	5155	5162	25 %	50 %	0 %	25 %	387827804
19	NC_017424	AATG	2	8	5401	5408	50 %	25 %	25 %	0 %	387827804
20	NC_017424	AAGT	2	8	6066	6073	50 %	25 %	25 %	0 %	387827806
21	NC_017424	AATT	2	8	6560	6567	50 %	50 %	0 %	0 %	387827807
22	NC_017424	TAAT	2	8	6607	6614	50 %	50 %	0 %	0 %	387827807
23	NC_017424	TTTA	2	8	7003	7010	25 %	75 %	0 %	0 %	387827808
24	NC_017424	AGAA	2	8	7224	7231	75 %	0 %	25 %	0 %	387827808
25	NC_017424	GCTG	2	8	7338	7345	0 %	25 %	50 %	25 %	387827808
26	NC_017424	ATTT	2	8	8501	8508	25 %	75 %	0 %	0 %	387827810
27	NC_017424	TGAG	2	8	8605	8612	25 %	25 %	50 %	0 %	387827810
28	NC_017424	CTTG	2	8	8803	8810	0 %	50 %	25 %	25 %	387827811
29	NC_017424	AATT	2	8	8949	8956	50 %	50 %	0 %	0 %	387827811
30	NC_017424	GTAA	2	8	9429	9436	50 %	25 %	25 %	0 %	387827812
31	NC_017424	TATG	2	8	9461	9468	25 %	50 %	25 %	0 %	387827812
32	NC_017424	AAAT	2	8	9491	9498	75 %	25 %	0 %	0 %	387827812
33	NC_017424	AGGG	2	8	9886	9893	25 %	0 %	75 %	0 %	387827812
34	NC_017424	GACT	2	8	10232	10239	25 %	25 %	25 %	25 %	387827812
35	NC_017424	CTTT	2	8	10249	10256	0 %	75 %	0 %	25 %	387827812
36	NC_017424	AGAA	2	8	10405	10412	75 %	0 %	25 %	0 %	387827813
37	NC_017424	GCAC	2	8	10569	10576	25 %	0 %	25 %	50 %	387827813
38	NC_017424	CTTT	2	8	10716	10723	0 %	75 %	0 %	25 %	387827813
39	NC_017424	TAAT	2	8	10965	10972	50 %	50 %	0 %	0 %	387827813
40	NC_017424	ATTC	2	8	11678	11685	25 %	50 %	0 %	25 %	387827814
41	NC_017424	TCAA	2	8	12185	12192	50 %	25 %	0 %	25 %	387827815
42	NC_017424	GTTT	2	8	12469	12476	0 %	75 %	25 %	0 %	387827815
43	NC_017424	TAAT	2	8	13010	13017	50 %	50 %	0 %	0 %	387827817
44	NC_017424	AGAT	2	8	13689	13696	50 %	25 %	25 %	0 %	387827817
45	NC_017424	TATC	2	8	13901	13908	25 %	50 %	0 %	25 %	387827818
46	NC_017424	AAAC	2	8	14093	14100	75 %	0 %	0 %	25 %	387827818
47	NC_017424	GAAT	2	8	14637	14644	50 %	25 %	25 %	0 %	387827819
48	NC_017424	TATT	2	8	15027	15034	25 %	75 %	0 %	0 %	387827819
49	NC_017424	TCAA	2	8	15666	15673	50 %	25 %	0 %	25 %	387827821
50	NC_017424	AGGA	2	8	15738	15745	50 %	0 %	50 %	0 %	387827821
51	NC_017424	CTAT	2	8	15750	15757	25 %	50 %	0 %	25 %	387827821
52	NC_017424	TAAC	2	8	15820	15827	50 %	25 %	0 %	25 %	387827822
53	NC_017424	TAAT	2	8	16590	16597	50 %	50 %	0 %	0 %	387827824
54	NC_017424	TATC	2	8	16628	16635	25 %	50 %	0 %	25 %	387827824
55	NC_017424	ATTT	2	8	16905	16912	25 %	75 %	0 %	0 %	387827824
56	NC_017424	TTTC	2	8	16988	16995	0 %	75 %	0 %	25 %	387827824
57	NC_017424	TCTT	2	8	17984	17991	0 %	75 %	0 %	25 %	387827826
58	NC_017424	GCTT	2	8	18387	18394	0 %	50 %	25 %	25 %	387827826
59	NC_017424	AATA	2	8	18922	18929	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017424	AAGA	3	12	19745	19756	75 %	0 %	25 %	0 %	387827827
61	NC_017424	AATA	2	8	19872	19879	75 %	25 %	0 %	0 %	387827827
62	NC_017424	GAAA	2	8	19938	19945	75 %	0 %	25 %	0 %	387827827
63	NC_017424	AAAT	2	8	20024	20031	75 %	25 %	0 %	0 %	387827827
64	NC_017424	GAAA	2	8	20137	20144	75 %	0 %	25 %	0 %	387827827
65	NC_017424	TTTA	2	8	20856	20863	25 %	75 %	0 %	0 %	387827828
66	NC_017424	TTGC	2	8	21027	21034	0 %	50 %	25 %	25 %	387827829
67	NC_017424	TAAA	2	8	21232	21239	75 %	25 %	0 %	0 %	387827829
68	NC_017424	TAAA	2	8	21583	21590	75 %	25 %	0 %	0 %	387827829
69	NC_017424	TAAA	2	8	21689	21696	75 %	25 %	0 %	0 %	387827829
70	NC_017424	ATGG	2	8	22657	22664	25 %	25 %	50 %	0 %	387827831
71	NC_017424	TAAA	2	8	23207	23214	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017424	TATT	2	8	23282	23289	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017424	AATC	2	8	24321	24328	50 %	25 %	0 %	25 %	387827832
74	NC_017424	AGAT	2	8	24545	24552	50 %	25 %	25 %	0 %	387827832
75	NC_017424	ATTA	2	8	24680	24687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017424	AAAT	3	12	25268	25279	75 %	25 %	0 %	0 %	387827834
77	NC_017424	TTTA	2	8	25299	25306	25 %	75 %	0 %	0 %	387827834
78	NC_017424	ACCA	2	8	25652	25659	50 %	0 %	0 %	50 %	387827834
79	NC_017424	AATT	2	8	25701	25708	50 %	50 %	0 %	0 %	387827834
80	NC_017424	TAAA	2	8	25725	25732	75 %	25 %	0 %	0 %	387827834
81	NC_017424	TGCA	2	8	26016	26023	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017424	AAGA	2	8	26084	26091	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017424	AAGA	2	8	26798	26805	75 %	0 %	25 %	0 %	387827835
84	NC_017424	AGAA	2	8	26814	26821	75 %	0 %	25 %	0 %	387827835
85	NC_017424	AGAA	2	8	26829	26836	75 %	0 %	25 %	0 %	387827835
86	NC_017424	TTTA	2	8	27503	27510	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017424	AGTT	2	8	28213	28220	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017424	GTAT	2	8	28564	28571	25 %	50 %	25 %	0 %	387827837
89	NC_017424	TAAA	2	8	28609	28616	75 %	25 %	0 %	0 %	387827837
90	NC_017424	CAAG	2	8	28634	28641	50 %	0 %	25 %	25 %	387827837
91	NC_017424	AATT	2	8	28655	28662	50 %	50 %	0 %	0 %	387827837
92	NC_017424	CAAA	2	8	28814	28821	75 %	0 %	0 %	25 %	387827838
93	NC_017424	AAAT	2	8	28852	28859	75 %	25 %	0 %	0 %	387827838
94	NC_017424	AATT	2	8	28903	28910	50 %	50 %	0 %	0 %	387827838
95	NC_017424	TAGC	2	8	29010	29017	25 %	25 %	25 %	25 %	387827838
96	NC_017424	TGAT	2	8	29217	29224	25 %	50 %	25 %	0 %	387827838
97	NC_017424	AGCA	2	8	29578	29585	50 %	0 %	25 %	25 %	387827838
98	NC_017424	AAAT	2	8	29604	29611	75 %	25 %	0 %	0 %	387827838

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.