Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-10
Total Repeats: 88
S.No. | Genome ID | Motif | Iterations | Length | Start | End | A% | T% | G% | C% | Protein ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | NC_017424 | ATTT | 3 | 12 | 573 | 584 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 387827799 |
2 | NC_017424 | ATTA | 2 | 8 | 947 | 954 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 387827799 |
3 | NC_017424 | AAAG | 2 | 8 | 2384 | 2391 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 387827800 |
4 | NC_017424 | ATTT | 2 | 8 | 2521 | 2528 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 387827800 |
5 | NC_017424 | TGCT | 2 | 8 | 2533 | 2540 | 0 % | 50 % | 25 % | 25 % | 387827800 |
6 | NC_017424 | GCAA | 2 | 8 | 2681 | 2688 | 50 % | 0 % | 25 % | 25 % | 387827801 |
7 | NC_017424 | ATGT | 2 | 8 | 3019 | 3026 | 25 % | 50 % | 25 % | 0 % | 387827801 |
8 | NC_017424 | GTAT | 2 | 8 | 3044 | 3051 | 25 % | 50 % | 25 % | 0 % | 387827801 |
9 | NC_017424 | ATAA | 2 | 8 | 3126 | 3133 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 387827801 |
10 | NC_017424 | CAAT | 2 | 8 | 3208 | 3215 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 387827801 |
11 | NC_017424 | TAAA | 2 | 8 | 3367 | 3374 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 387827802 |
12 | NC_017424 | TTTA | 2 | 8 | 3894 | 3901 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 387827802 |
13 | NC_017424 | AGTA | 2 | 8 | 4787 | 4794 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 387827803 |
14 | NC_017424 | CTAC | 2 | 8 | 4799 | 4806 | 25 % | 25 % | 0 % | 50 % | 387827803 |
15 | NC_017424 | TCAT | 2 | 8 | 4846 | 4853 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 387827803 |
16 | NC_017424 | TACT | 2 | 8 | 5155 | 5162 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 387827804 |
17 | NC_017424 | AATG | 2 | 8 | 5401 | 5408 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 387827804 |
18 | NC_017424 | AAGT | 2 | 8 | 6066 | 6073 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 387827806 |
19 | NC_017424 | AATT | 2 | 8 | 6560 | 6567 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 387827807 |
20 | NC_017424 | TAAT | 2 | 8 | 6607 | 6614 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 387827807 |
21 | NC_017424 | TTTA | 2 | 8 | 7003 | 7010 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 387827808 |
22 | NC_017424 | AGAA | 2 | 8 | 7224 | 7231 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 387827808 |
23 | NC_017424 | GCTG | 2 | 8 | 7338 | 7345 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 387827808 |
24 | NC_017424 | ATTT | 2 | 8 | 8501 | 8508 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 387827810 |
25 | NC_017424 | TGAG | 2 | 8 | 8605 | 8612 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 387827810 |
26 | NC_017424 | CTTG | 2 | 8 | 8803 | 8810 | 0 % | 50 % | 25 % | 25 % | 387827811 |
27 | NC_017424 | AATT | 2 | 8 | 8949 | 8956 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 387827811 |
28 | NC_017424 | GTAA | 2 | 8 | 9429 | 9436 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 387827812 |
29 | NC_017424 | TATG | 2 | 8 | 9461 | 9468 | 25 % | 50 % | 25 % | 0 % | 387827812 |
30 | NC_017424 | AAAT | 2 | 8 | 9491 | 9498 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 387827812 |
31 | NC_017424 | AGGG | 2 | 8 | 9886 | 9893 | 25 % | 0 % | 75 % | 0 % | 387827812 |
32 | NC_017424 | GACT | 2 | 8 | 10232 | 10239 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 387827812 |
33 | NC_017424 | CTTT | 2 | 8 | 10249 | 10256 | 0 % | 75 % | 0 % | 25 % | 387827812 |
34 | NC_017424 | AGAA | 2 | 8 | 10405 | 10412 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 387827813 |
35 | NC_017424 | GCAC | 2 | 8 | 10569 | 10576 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 387827813 |
36 | NC_017424 | CTTT | 2 | 8 | 10716 | 10723 | 0 % | 75 % | 0 % | 25 % | 387827813 |
37 | NC_017424 | TAAT | 2 | 8 | 10965 | 10972 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 387827813 |
38 | NC_017424 | ATTC | 2 | 8 | 11678 | 11685 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 387827814 |
39 | NC_017424 | TCAA | 2 | 8 | 12185 | 12192 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 387827815 |
40 | NC_017424 | GTTT | 2 | 8 | 12469 | 12476 | 0 % | 75 % | 25 % | 0 % | 387827815 |
41 | NC_017424 | TAAT | 2 | 8 | 13010 | 13017 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 387827817 |
42 | NC_017424 | AGAT | 2 | 8 | 13689 | 13696 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 387827817 |
43 | NC_017424 | TATC | 2 | 8 | 13901 | 13908 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 387827818 |
44 | NC_017424 | AAAC | 2 | 8 | 14093 | 14100 | 75 % | 0 % | 0 % | 25 % | 387827818 |
45 | NC_017424 | GAAT | 2 | 8 | 14637 | 14644 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 387827819 |
46 | NC_017424 | TATT | 2 | 8 | 15027 | 15034 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 387827819 |
47 | NC_017424 | TCAA | 2 | 8 | 15666 | 15673 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 387827821 |
48 | NC_017424 | AGGA | 2 | 8 | 15738 | 15745 | 50 % | 0 % | 50 % | 0 % | 387827821 |
49 | NC_017424 | CTAT | 2 | 8 | 15750 | 15757 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 387827821 |
50 | NC_017424 | TAAC | 2 | 8 | 15820 | 15827 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 387827822 |
51 | NC_017424 | TAAT | 2 | 8 | 16590 | 16597 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 387827824 |
52 | NC_017424 | TATC | 2 | 8 | 16628 | 16635 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 387827824 |
53 | NC_017424 | ATTT | 2 | 8 | 16905 | 16912 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 387827824 |
54 | NC_017424 | TTTC | 2 | 8 | 16988 | 16995 | 0 % | 75 % | 0 % | 25 % | 387827824 |
55 | NC_017424 | TCTT | 2 | 8 | 17984 | 17991 | 0 % | 75 % | 0 % | 25 % | 387827826 |
56 | NC_017424 | GCTT | 2 | 8 | 18387 | 18394 | 0 % | 50 % | 25 % | 25 % | 387827826 |
57 | NC_017424 | AAGA | 3 | 12 | 19745 | 19756 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 387827827 |
58 | NC_017424 | AATA | 2 | 8 | 19872 | 19879 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 387827827 |
59 | NC_017424 | GAAA | 2 | 8 | 19938 | 19945 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 387827827 |
60 | NC_017424 | AAAT | 2 | 8 | 20024 | 20031 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 387827827 |
61 | NC_017424 | GAAA | 2 | 8 | 20137 | 20144 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 387827827 |
62 | NC_017424 | TTTA | 2 | 8 | 20856 | 20863 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 387827828 |
63 | NC_017424 | TTGC | 2 | 8 | 21027 | 21034 | 0 % | 50 % | 25 % | 25 % | 387827829 |
64 | NC_017424 | TAAA | 2 | 8 | 21232 | 21239 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 387827829 |
65 | NC_017424 | TAAA | 2 | 8 | 21583 | 21590 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 387827829 |
66 | NC_017424 | TAAA | 2 | 8 | 21689 | 21696 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 387827829 |
67 | NC_017424 | ATGG | 2 | 8 | 22657 | 22664 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 387827831 |
68 | NC_017424 | AATC | 2 | 8 | 24321 | 24328 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 387827832 |
69 | NC_017424 | AGAT | 2 | 8 | 24545 | 24552 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 387827832 |
70 | NC_017424 | AAAT | 3 | 12 | 25268 | 25279 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 387827834 |
71 | NC_017424 | TTTA | 2 | 8 | 25299 | 25306 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 387827834 |
72 | NC_017424 | ACCA | 2 | 8 | 25652 | 25659 | 50 % | 0 % | 0 % | 50 % | 387827834 |
73 | NC_017424 | AATT | 2 | 8 | 25701 | 25708 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 387827834 |
74 | NC_017424 | TAAA | 2 | 8 | 25725 | 25732 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 387827834 |
75 | NC_017424 | AAGA | 2 | 8 | 26798 | 26805 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 387827835 |
76 | NC_017424 | AGAA | 2 | 8 | 26814 | 26821 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 387827835 |
77 | NC_017424 | AGAA | 2 | 8 | 26829 | 26836 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 387827835 |
78 | NC_017424 | GTAT | 2 | 8 | 28564 | 28571 | 25 % | 50 % | 25 % | 0 % | 387827837 |
79 | NC_017424 | TAAA | 2 | 8 | 28609 | 28616 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 387827837 |
80 | NC_017424 | CAAG | 2 | 8 | 28634 | 28641 | 50 % | 0 % | 25 % | 25 % | 387827837 |
81 | NC_017424 | AATT | 2 | 8 | 28655 | 28662 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 387827837 |
82 | NC_017424 | CAAA | 2 | 8 | 28814 | 28821 | 75 % | 0 % | 0 % | 25 % | 387827838 |
83 | NC_017424 | AAAT | 2 | 8 | 28852 | 28859 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 387827838 |
84 | NC_017424 | AATT | 2 | 8 | 28903 | 28910 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 387827838 |
85 | NC_017424 | TAGC | 2 | 8 | 29010 | 29017 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 387827838 |
86 | NC_017424 | TGAT | 2 | 8 | 29217 | 29224 | 25 % | 50 % | 25 % | 0 % | 387827838 |
87 | NC_017424 | AGCA | 2 | 8 | 29578 | 29585 | 50 % | 0 % | 25 % | 25 % | 387827838 |
88 | NC_017424 | AAAT | 2 | 8 | 29604 | 29611 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 387827838 |