MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-10

Total Repeats: 432

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017424	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017424	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827799
3	NC_017424	TGC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827799
4	NC_017424	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827799
5	NC_017424	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827799
6	NC_017424	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827799
7	NC_017424	AAT	2	6	459	464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827799
8	NC_017424	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827799
9	NC_017424	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827799
10	NC_017424	AGC	2	6	714	719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827799
11	NC_017424	AAT	2	6	720	725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827799
12	NC_017424	TCT	2	6	747	752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827799
13	NC_017424	AAT	2	6	858	863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827799
14	NC_017424	TTA	2	6	907	912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827799
15	NC_017424	AGG	2	6	934	939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827799
16	NC_017424	ATG	2	6	1027	1032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827799
17	NC_017424	ATT	2	6	1051	1056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827799
18	NC_017424	GAA	2	6	1164	1169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827799
19	NC_017424	AGT	2	6	1233	1238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827799
20	NC_017424	TAA	2	6	1244	1249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827799
21	NC_017424	GAG	2	6	1251	1256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827799
22	NC_017424	ATT	2	6	1277	1282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827799
23	NC_017424	GAA	2	6	1321	1326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017424	TGA	2	6	1466	1471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017424	AGG	2	6	1610	1615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017424	TTC	3	9	1815	1823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017424	AGA	2	6	1860	1865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017424	ATA	2	6	2025	2030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827800
29	NC_017424	TAG	2	6	2174	2179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827800
30	NC_017424	AAC	2	6	2255	2260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827800
31	NC_017424	TGG	3	9	2279	2287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827800
32	NC_017424	TAA	2	6	2571	2576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827800
33	NC_017424	GCT	2	6	2661	2666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827801
34	NC_017424	TGA	2	6	2744	2749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827801
35	NC_017424	GTT	2	6	2824	2829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827801
36	NC_017424	TTA	2	6	3142	3147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827801
37	NC_017424	CCA	2	6	3165	3170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387827801
38	NC_017424	GGT	2	6	3336	3341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827801
39	NC_017424	ATT	2	6	3391	3396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827802
40	NC_017424	AAG	2	6	3415	3420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827802
41	NC_017424	TGA	2	6	3478	3483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827802
42	NC_017424	ATC	2	6	3555	3560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827802
43	NC_017424	TGG	2	6	3652	3657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827802
44	NC_017424	CTA	2	6	3711	3716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827802
45	NC_017424	AAT	2	6	3731	3736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827802
46	NC_017424	TAA	2	6	3796	3801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827802
47	NC_017424	TAA	2	6	3944	3949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827802
48	NC_017424	AGG	2	6	3955	3960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017424	ATT	2	6	3973	3978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827803
50	NC_017424	TGA	2	6	3979	3984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827803
51	NC_017424	ATT	2	6	3987	3992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827803
52	NC_017424	TAT	2	6	4036	4041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827803
53	NC_017424	ACA	2	6	4139	4144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827803
54	NC_017424	ATT	2	6	4206	4211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827803
55	NC_017424	TAA	3	9	4291	4299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827803
56	NC_017424	AGT	2	6	4334	4339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827803
57	NC_017424	TTA	2	6	4353	4358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827803
58	NC_017424	ACT	2	6	4438	4443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827803
59	NC_017424	AGA	2	6	4465	4470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827803
60	NC_017424	CGA	2	6	4549	4554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827803
61	NC_017424	GAT	2	6	4567	4572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827803
62	NC_017424	GCA	3	9	4619	4627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827803
63	NC_017424	AGT	2	6	4640	4645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827803
64	NC_017424	TAA	2	6	4690	4695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827803
65	NC_017424	AGA	2	6	4699	4704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827803
66	NC_017424	TTA	2	6	4770	4775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827803
67	NC_017424	GGT	2	6	4871	4876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827803
68	NC_017424	CTA	2	6	4884	4889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827803
69	NC_017424	GAA	2	6	4986	4991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827804
70	NC_017424	GTT	2	6	5199	5204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827804
71	NC_017424	ATT	2	6	5260	5265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827804
72	NC_017424	TAG	2	6	5270	5275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827804
73	NC_017424	GAA	2	6	5286	5291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827804
74	NC_017424	GGC	2	6	5292	5297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387827804
75	NC_017424	TGT	2	6	5494	5499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827805
76	NC_017424	TTC	2	6	5515	5520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827805
77	NC_017424	TTA	2	6	5568	5573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827805
78	NC_017424	TGG	2	6	5817	5822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827806
79	NC_017424	AAT	2	6	5926	5931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827806
80	NC_017424	TAT	2	6	6020	6025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827806
81	NC_017424	GTA	2	6	6083	6088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827806
82	NC_017424	GCA	2	6	6094	6099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827806
83	NC_017424	TTG	2	6	6107	6112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827806
84	NC_017424	AAT	2	6	6234	6239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827807
85	NC_017424	GCT	2	6	6294	6299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827807
86	NC_017424	ATA	2	6	6309	6314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827807
87	NC_017424	ATA	2	6	6502	6507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827807
88	NC_017424	AGG	2	6	6694	6699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827807
89	NC_017424	TAG	2	6	6759	6764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827808
90	NC_017424	ATT	2	6	6770	6775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827808
91	NC_017424	TAA	2	6	6816	6821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827808
92	NC_017424	TGC	2	6	6825	6830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827808
93	NC_017424	TAA	2	6	6858	6863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827808
94	NC_017424	ACT	2	6	6936	6941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827808
95	NC_017424	GAA	2	6	6976	6981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827808
96	NC_017424	TGT	2	6	7065	7070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827808
97	NC_017424	TTA	2	6	7073	7078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827808
98	NC_017424	GAT	2	6	7099	7104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827808
99	NC_017424	GAT	2	6	7123	7128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827808
100	NC_017424	AAT	2	6	7249	7254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827808
101	NC_017424	TTG	2	6	7355	7360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827808
102	NC_017424	CTT	2	6	7411	7416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827808
103	NC_017424	AAG	2	6	7451	7456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827808
104	NC_017424	ATT	2	6	7522	7527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827808
105	NC_017424	TTA	2	6	7532	7537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827808
106	NC_017424	TTA	2	6	7661	7666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827808
107	NC_017424	TAC	2	6	7776	7781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827808
108	NC_017424	AGG	2	6	7823	7828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017424	TGG	2	6	7874	7879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827809
110	NC_017424	CAA	2	6	7924	7929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827809
111	NC_017424	TAG	2	6	7940	7945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827809
112	NC_017424	TAA	2	6	7966	7971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827809
113	NC_017424	TGA	2	6	8060	8065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827809
114	NC_017424	ACA	2	6	8074	8079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827809
115	NC_017424	ATT	2	6	8142	8147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827809
116	NC_017424	AAG	2	6	8180	8185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827809
117	NC_017424	CTG	2	6	8191	8196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827809
118	NC_017424	AAC	2	6	8253	8258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827809
119	NC_017424	TTA	2	6	8275	8280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827810
120	NC_017424	TTA	2	6	8510	8515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827810
121	NC_017424	TTG	2	6	8527	8532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827810
122	NC_017424	AAT	2	6	8534	8539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827810
123	NC_017424	AAT	2	6	8619	8624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827810
124	NC_017424	TCA	2	6	8694	8699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827810
125	NC_017424	TGC	2	6	9020	9025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827812
126	NC_017424	AAT	2	6	9120	9125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827812
127	NC_017424	GAC	2	6	9298	9303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827812
128	NC_017424	AGC	2	6	9353	9358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827812
129	NC_017424	TTG	2	6	9376	9381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827812
130	NC_017424	TGG	2	6	9440	9445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827812
131	NC_017424	AGA	2	6	9503	9508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827812
132	NC_017424	TAA	2	6	9524	9529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827812
133	NC_017424	AAC	2	6	9607	9612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827812
134	NC_017424	ATG	2	6	9670	9675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827812
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136	NC_017424	AGC	2	6	9710	9715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827812
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138	NC_017424	GTT	2	6	9765	9770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827812
139	NC_017424	TAA	2	6	9928	9933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827812
140	NC_017424	TAA	2	6	10031	10036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827812
141	NC_017424	TGT	2	6	10205	10210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827812
142	NC_017424	AAC	2	6	10266	10271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827812
143	NC_017424	AAT	2	6	10272	10277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827812
144	NC_017424	TGA	2	6	10289	10294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827812
145	NC_017424	AAT	3	9	10353	10361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827813
146	NC_017424	AAT	2	6	10430	10435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827813
147	NC_017424	TAA	2	6	10444	10449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827813
148	NC_017424	GTT	2	6	10588	10593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827813
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150	NC_017424	AAC	2	6	10783	10788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827813
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154	NC_017424	TAA	2	6	11080	11085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827814
155	NC_017424	ACA	2	6	11090	11095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827814
156	NC_017424	TGG	2	6	11318	11323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827814
157	NC_017424	TAG	2	6	11360	11365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827814
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159	NC_017424	ATT	2	6	11454	11459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827814
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162	NC_017424	TGG	2	6	11576	11581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827814
163	NC_017424	AAC	2	6	11627	11632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827814
164	NC_017424	AGA	2	6	11660	11665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827814
165	NC_017424	CAA	2	6	11688	11693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827814
166	NC_017424	ACC	2	6	11820	11825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387827814
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250	NC_017424	ATT	2	6	17912	17917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_017424	AGC	2	6	17926	17931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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255	NC_017424	CAT	3	9	18175	18183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827826
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257	NC_017424	TTA	2	6	18315	18320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827826
258	NC_017424	ATT	2	6	18422	18427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827826
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386	NC_017424	ATA	2	6	27337	27342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827835
387	NC_017424	GTT	2	6	27404	27409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
388	NC_017424	ATG	2	6	27527	27532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827836
389	NC_017424	TGA	2	6	27697	27702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827836
390	NC_017424	TTA	2	6	27738	27743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827836
391	NC_017424	ATA	2	6	27767	27772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827836
392	NC_017424	GGA	2	6	27901	27906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827836
393	NC_017424	TAA	2	6	27913	27918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827836
394	NC_017424	ATT	2	6	27967	27972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827836
395	NC_017424	TAT	2	6	27986	27991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827836
396	NC_017424	TCT	2	6	28018	28023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827836
397	NC_017424	TAA	2	6	28106	28111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
398	NC_017424	ATA	2	6	28115	28120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
399	NC_017424	ATA	2	6	28154	28159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
400	NC_017424	TGA	2	6	28262	28267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827837
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424	NC_017424	ATA	2	6	29835	29840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827838
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.