MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-10

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017424	T	6	6	135	140	0 %	100 %	0 %	0 %	387827799
2	NC_017424	T	6	6	629	634	0 %	100 %	0 %	0 %	387827799
3	NC_017424	T	6	6	752	757	0 %	100 %	0 %	0 %	387827799
4	NC_017424	A	8	8	1325	1332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017424	A	6	6	1797	1802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017424	T	6	6	3506	3511	0 %	100 %	0 %	0 %	387827802
7	NC_017424	A	6	6	4098	4103	100 %	0 %	0 %	0 %	387827803
8	NC_017424	A	6	6	4512	4517	100 %	0 %	0 %	0 %	387827803
9	NC_017424	A	6	6	5229	5234	100 %	0 %	0 %	0 %	387827804
10	NC_017424	G	6	6	5300	5305	0 %	0 %	100 %	0 %	387827804
11	NC_017424	T	6	6	6960	6965	0 %	100 %	0 %	0 %	387827808
12	NC_017424	A	7	7	7032	7038	100 %	0 %	0 %	0 %	387827808
13	NC_017424	T	8	8	7154	7161	0 %	100 %	0 %	0 %	387827808
14	NC_017424	A	6	6	7509	7514	100 %	0 %	0 %	0 %	387827808
15	NC_017424	A	7	7	8582	8588	100 %	0 %	0 %	0 %	387827810
16	NC_017424	A	7	7	8788	8794	100 %	0 %	0 %	0 %	387827811
17	NC_017424	A	6	6	9029	9034	100 %	0 %	0 %	0 %	387827812
18	NC_017424	A	6	6	9081	9086	100 %	0 %	0 %	0 %	387827812
19	NC_017424	A	6	6	9138	9143	100 %	0 %	0 %	0 %	387827812
20	NC_017424	A	6	6	9213	9218	100 %	0 %	0 %	0 %	387827812
21	NC_017424	A	6	6	9477	9482	100 %	0 %	0 %	0 %	387827812
22	NC_017424	A	8	8	9894	9901	100 %	0 %	0 %	0 %	387827812
23	NC_017424	A	6	6	10166	10171	100 %	0 %	0 %	0 %	387827812
24	NC_017424	T	6	6	10254	10259	0 %	100 %	0 %	0 %	387827812
25	NC_017424	A	6	6	10371	10376	100 %	0 %	0 %	0 %	387827813
26	NC_017424	A	6	6	10384	10389	100 %	0 %	0 %	0 %	387827813
27	NC_017424	T	6	6	10481	10486	0 %	100 %	0 %	0 %	387827813
28	NC_017424	T	6	6	10539	10544	0 %	100 %	0 %	0 %	387827813
29	NC_017424	A	6	6	11241	11246	100 %	0 %	0 %	0 %	387827814
30	NC_017424	A	7	7	11257	11263	100 %	0 %	0 %	0 %	387827814
31	NC_017424	A	6	6	12128	12133	100 %	0 %	0 %	0 %	387827815
32	NC_017424	A	6	6	12709	12714	100 %	0 %	0 %	0 %	387827816
33	NC_017424	T	8	8	12800	12807	0 %	100 %	0 %	0 %	387827816
34	NC_017424	T	7	7	13030	13036	0 %	100 %	0 %	0 %	387827817
35	NC_017424	T	6	6	13525	13530	0 %	100 %	0 %	0 %	387827817
36	NC_017424	A	8	8	13633	13640	100 %	0 %	0 %	0 %	387827817
37	NC_017424	A	6	6	14145	14150	100 %	0 %	0 %	0 %	387827818
38	NC_017424	A	6	6	14191	14196	100 %	0 %	0 %	0 %	387827818
39	NC_017424	A	6	6	14759	14764	100 %	0 %	0 %	0 %	387827819
40	NC_017424	T	6	6	14909	14914	0 %	100 %	0 %	0 %	387827819
41	NC_017424	A	7	7	15017	15023	100 %	0 %	0 %	0 %	387827819
42	NC_017424	A	6	6	15101	15106	100 %	0 %	0 %	0 %	387827819
43	NC_017424	A	6	6	15225	15230	100 %	0 %	0 %	0 %	387827820
44	NC_017424	A	7	7	15419	15425	100 %	0 %	0 %	0 %	387827820
45	NC_017424	A	6	6	15660	15665	100 %	0 %	0 %	0 %	387827821
46	NC_017424	A	7	7	15699	15705	100 %	0 %	0 %	0 %	387827821
47	NC_017424	T	6	6	15890	15895	0 %	100 %	0 %	0 %	387827822
48	NC_017424	A	6	6	16396	16401	100 %	0 %	0 %	0 %	387827823
49	NC_017424	A	6	6	17043	17048	100 %	0 %	0 %	0 %	387827824
50	NC_017424	A	6	6	17324	17329	100 %	0 %	0 %	0 %	387827825
51	NC_017424	A	6	6	17355	17360	100 %	0 %	0 %	0 %	387827825
52	NC_017424	A	6	6	17395	17400	100 %	0 %	0 %	0 %	387827825
53	NC_017424	A	6	6	17422	17427	100 %	0 %	0 %	0 %	387827825
54	NC_017424	A	8	8	17676	17683	100 %	0 %	0 %	0 %	387827825
55	NC_017424	T	6	6	17990	17995	0 %	100 %	0 %	0 %	387827826
56	NC_017424	T	7	7	18104	18110	0 %	100 %	0 %	0 %	387827826
57	NC_017424	T	7	7	18222	18228	0 %	100 %	0 %	0 %	387827826
58	NC_017424	T	6	6	18249	18254	0 %	100 %	0 %	0 %	387827826
59	NC_017424	T	7	7	18336	18342	0 %	100 %	0 %	0 %	387827826
60	NC_017424	T	7	7	18357	18363	0 %	100 %	0 %	0 %	387827826
61	NC_017424	T	6	6	18915	18920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017424	T	6	6	18961	18966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017424	A	6	6	18969	18974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017424	A	7	7	18981	18987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017424	T	7	7	19048	19054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017424	A	6	6	19063	19068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017424	T	7	7	19209	19215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017424	A	6	6	19272	19277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017424	A	6	6	19387	19392	100 %	0 %	0 %	0 %	387827827
70	NC_017424	A	6	6	19591	19596	100 %	0 %	0 %	0 %	387827827
71	NC_017424	A	7	7	19634	19640	100 %	0 %	0 %	0 %	387827827
72	NC_017424	A	7	7	19908	19914	100 %	0 %	0 %	0 %	387827827
73	NC_017424	A	7	7	19923	19929	100 %	0 %	0 %	0 %	387827827
74	NC_017424	A	8	8	19949	19956	100 %	0 %	0 %	0 %	387827827
75	NC_017424	A	6	6	19984	19989	100 %	0 %	0 %	0 %	387827827
76	NC_017424	A	7	7	20142	20148	100 %	0 %	0 %	0 %	387827827
77	NC_017424	A	7	7	20214	20220	100 %	0 %	0 %	0 %	387827827
78	NC_017424	A	6	6	20254	20259	100 %	0 %	0 %	0 %	387827827
79	NC_017424	A	6	6	20334	20339	100 %	0 %	0 %	0 %	387827827
80	NC_017424	A	7	7	20342	20348	100 %	0 %	0 %	0 %	387827827
81	NC_017424	A	6	6	20557	20562	100 %	0 %	0 %	0 %	387827828
82	NC_017424	T	6	6	20663	20668	0 %	100 %	0 %	0 %	387827828
83	NC_017424	A	6	6	20688	20693	100 %	0 %	0 %	0 %	387827828
84	NC_017424	T	6	6	20786	20791	0 %	100 %	0 %	0 %	387827828
85	NC_017424	A	7	7	20824	20830	100 %	0 %	0 %	0 %	387827828
86	NC_017424	A	6	6	20949	20954	100 %	0 %	0 %	0 %	387827828
87	NC_017424	A	6	6	21160	21165	100 %	0 %	0 %	0 %	387827829
88	NC_017424	A	7	7	21588	21594	100 %	0 %	0 %	0 %	387827829
89	NC_017424	A	8	8	21794	21801	100 %	0 %	0 %	0 %	387827830
90	NC_017424	A	6	6	21843	21848	100 %	0 %	0 %	0 %	387827830
91	NC_017424	A	6	6	21867	21872	100 %	0 %	0 %	0 %	387827830
92	NC_017424	T	6	6	21878	21883	0 %	100 %	0 %	0 %	387827830
93	NC_017424	A	7	7	22122	22128	100 %	0 %	0 %	0 %	387827830
94	NC_017424	A	6	6	22261	22266	100 %	0 %	0 %	0 %	387827830
95	NC_017424	A	6	6	22353	22358	100 %	0 %	0 %	0 %	387827831
96	NC_017424	T	6	6	22836	22841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017424	T	6	6	22926	22931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017424	A	6	6	23138	23143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017424	T	7	7	23223	23229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017424	T	6	6	23236	23241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017424	A	6	6	23244	23249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017424	A	6	6	23291	23296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017424	A	6	6	23437	23442	100 %	0 %	0 %	0 %	387827832
104	NC_017424	A	7	7	23790	23796	100 %	0 %	0 %	0 %	387827832
105	NC_017424	T	6	6	23939	23944	0 %	100 %	0 %	0 %	387827832
106	NC_017424	T	6	6	23957	23962	0 %	100 %	0 %	0 %	387827832
107	NC_017424	A	7	7	24134	24140	100 %	0 %	0 %	0 %	387827832
108	NC_017424	A	7	7	24405	24411	100 %	0 %	0 %	0 %	387827832
109	NC_017424	A	6	6	24647	24652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017424	A	7	7	24655	24661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017424	A	6	6	25020	25025	100 %	0 %	0 %	0 %	387827833
112	NC_017424	T	6	6	25320	25325	0 %	100 %	0 %	0 %	387827834
113	NC_017424	T	6	6	25341	25346	0 %	100 %	0 %	0 %	387827834
114	NC_017424	T	6	6	25430	25435	0 %	100 %	0 %	0 %	387827834
115	NC_017424	T	8	8	25520	25527	0 %	100 %	0 %	0 %	387827834
116	NC_017424	A	6	6	25573	25578	100 %	0 %	0 %	0 %	387827834
117	NC_017424	T	6	6	25758	25763	0 %	100 %	0 %	0 %	387827834
118	NC_017424	T	6	6	25777	25782	0 %	100 %	0 %	0 %	387827834
119	NC_017424	A	6	6	25953	25958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017424	A	6	6	26415	26420	100 %	0 %	0 %	0 %	387827835
121	NC_017424	A	7	7	26512	26518	100 %	0 %	0 %	0 %	387827835
122	NC_017424	A	8	8	26667	26674	100 %	0 %	0 %	0 %	387827835
123	NC_017424	A	8	8	26694	26701	100 %	0 %	0 %	0 %	387827835
124	NC_017424	T	7	7	26956	26962	0 %	100 %	0 %	0 %	387827835
125	NC_017424	A	6	6	27109	27114	100 %	0 %	0 %	0 %	387827835
126	NC_017424	A	7	7	27195	27201	100 %	0 %	0 %	0 %	387827835
127	NC_017424	A	6	6	27392	27397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017424	T	7	7	27411	27417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017424	A	6	6	27580	27585	100 %	0 %	0 %	0 %	387827836
130	NC_017424	A	7	7	27630	27636	100 %	0 %	0 %	0 %	387827836
131	NC_017424	A	6	6	27730	27735	100 %	0 %	0 %	0 %	387827836
132	NC_017424	A	8	8	28626	28633	100 %	0 %	0 %	0 %	387827837
133	NC_017424	A	6	6	28737	28742	100 %	0 %	0 %	0 %	387827837
134	NC_017424	A	7	7	28947	28953	100 %	0 %	0 %	0 %	387827838
135	NC_017424	A	7	7	28983	28989	100 %	0 %	0 %	0 %	387827838

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.