MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-12

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017423	AATTC	2	10	1942	1951	40 %	40 %	0 %	20 %	387827928
2	NC_017423	CAAAA	2	10	3775	3784	80 %	0 %	0 %	20 %	387827931
3	NC_017423	TACAA	2	10	4221	4230	60 %	20 %	0 %	20 %	387827932
4	NC_017423	TTCAA	2	10	4387	4396	40 %	40 %	0 %	20 %	387827932
5	NC_017423	AGTTT	2	10	6393	6402	20 %	60 %	20 %	0 %	387827936
6	NC_017423	AAATT	2	10	9901	9910	60 %	40 %	0 %	0 %	387827941
7	NC_017423	ATATA	2	10	11671	11680	60 %	40 %	0 %	0 %	387827943
8	NC_017423	AATTT	2	10	12231	12240	40 %	60 %	0 %	0 %	387827944
9	NC_017423	ACAAT	2	10	12265	12274	60 %	20 %	0 %	20 %	387827944
10	NC_017423	GACTA	2	10	12606	12615	40 %	20 %	20 %	20 %	387827945
11	NC_017423	ACCAC	2	10	13995	14004	40 %	0 %	0 %	60 %	387827947
12	NC_017423	AGAAA	2	10	14114	14123	80 %	0 %	20 %	0 %	387827947
13	NC_017423	ATTCA	2	10	14156	14165	40 %	40 %	0 %	20 %	387827947
14	NC_017423	TAAAA	2	10	14621	14630	80 %	20 %	0 %	0 %	387827948
15	NC_017423	TTATG	2	10	16184	16193	20 %	60 %	20 %	0 %	387827952
16	NC_017423	CAAAA	2	10	16214	16223	80 %	0 %	0 %	20 %	387827952
17	NC_017423	TTTTA	2	10	16837	16846	20 %	80 %	0 %	0 %	387827953
18	NC_017423	CACTT	2	10	17068	17077	20 %	40 %	0 %	40 %	387827953
19	NC_017423	CTAAA	2	10	18081	18090	60 %	20 %	0 %	20 %	387827954
20	NC_017423	ATCTT	2	10	18553	18562	20 %	60 %	0 %	20 %	387827954
21	NC_017423	TAATT	2	10	19908	19917	40 %	60 %	0 %	0 %	387827956
22	NC_017423	AGAAA	2	10	20493	20502	80 %	0 %	20 %	0 %	387827957
23	NC_017423	TTAAT	2	10	20713	20722	40 %	60 %	0 %	0 %	387827957
24	NC_017423	CAAAA	2	10	20755	20764	80 %	0 %	0 %	20 %	387827957
25	NC_017423	GAGTT	2	10	22779	22788	20 %	40 %	40 %	0 %	387827959
26	NC_017423	ATAAA	2	10	23223	23232	80 %	20 %	0 %	0 %	387827960
27	NC_017423	TAAAA	2	10	23626	23635	80 %	20 %	0 %	0 %	387827960
28	NC_017423	CAGTT	2	10	24134	24143	20 %	40 %	20 %	20 %	387827961
29	NC_017423	TATTT	2	10	24308	24317	20 %	80 %	0 %	0 %	387827961
30	NC_017423	ATTTT	2	10	24324	24333	20 %	80 %	0 %	0 %	387827961
31	NC_017423	AAAAG	2	10	25162	25171	80 %	0 %	20 %	0 %	387827962
32	NC_017423	GAGAA	2	10	25599	25608	60 %	0 %	40 %	0 %	387827962

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.