MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-12

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017423	ATTA	2	8	942	949	50 %	50 %	0 %	0 %	387827927
2	NC_017423	AAGT	2	8	1857	1864	50 %	25 %	25 %	0 %	387827928
3	NC_017423	AATT	2	8	1888	1895	50 %	50 %	0 %	0 %	387827928
4	NC_017423	CTTA	2	8	2095	2102	25 %	50 %	0 %	25 %	387827929
5	NC_017423	ACAA	2	8	2345	2352	75 %	0 %	0 %	25 %	387827929
6	NC_017423	ATTT	2	8	2508	2515	25 %	75 %	0 %	0 %	387827929
7	NC_017423	TACT	2	8	2849	2856	25 %	50 %	0 %	25 %	387827930
8	NC_017423	ATGT	2	8	3013	3020	25 %	50 %	25 %	0 %	387827930
9	NC_017423	AATG	2	8	3372	3379	50 %	25 %	25 %	0 %	387827931
10	NC_017423	AGTA	2	8	4790	4797	50 %	25 %	25 %	0 %	387827932
11	NC_017423	CTAC	2	8	4802	4809	25 %	25 %	0 %	50 %	387827932
12	NC_017423	TCAT	2	8	4849	4856	25 %	50 %	0 %	25 %	387827932
13	NC_017423	CAAA	2	8	4954	4961	75 %	0 %	0 %	25 %	387827933
14	NC_017423	TTCA	2	8	5013	5020	25 %	50 %	0 %	25 %	387827933
15	NC_017423	ACTT	2	8	6137	6144	25 %	50 %	0 %	25 %	387827935
16	NC_017423	TTAA	2	8	7371	7378	50 %	50 %	0 %	0 %	387827937
17	NC_017423	GATT	2	8	7660	7667	25 %	50 %	25 %	0 %	387827937
18	NC_017423	ACTA	2	8	8149	8156	50 %	25 %	0 %	25 %	387827938
19	NC_017423	ATTT	2	8	8502	8509	25 %	75 %	0 %	0 %	387827939
20	NC_017423	AATA	2	8	8817	8824	75 %	25 %	0 %	0 %	387827940
21	NC_017423	AAAC	2	8	9214	9221	75 %	0 %	0 %	25 %	387827941
22	NC_017423	ACAA	2	8	9553	9560	75 %	0 %	0 %	25 %	387827941
23	NC_017423	AGCA	2	8	9678	9685	50 %	0 %	25 %	25 %	387827941
24	NC_017423	AGTT	2	8	10205	10212	25 %	50 %	25 %	0 %	387827941
25	NC_017423	AAGT	2	8	10873	10880	50 %	25 %	25 %	0 %	387827942
26	NC_017423	ACAT	2	8	11504	11511	50 %	25 %	0 %	25 %	387827943
27	NC_017423	TCAA	2	8	12137	12144	50 %	25 %	0 %	25 %	387827944
28	NC_017423	TTTA	2	8	12422	12429	25 %	75 %	0 %	0 %	387827944
29	NC_017423	ATTG	2	8	12945	12952	25 %	50 %	25 %	0 %	387827946
30	NC_017423	TAAT	2	8	12962	12969	50 %	50 %	0 %	0 %	387827946
31	NC_017423	AAAC	2	8	14044	14051	75 %	0 %	0 %	25 %	387827947
32	NC_017423	ATTT	2	8	14060	14067	25 %	75 %	0 %	0 %	387827947
33	NC_017423	ATCA	2	8	15610	15617	50 %	25 %	0 %	25 %	387827950
34	NC_017423	AGGA	2	8	15683	15690	50 %	0 %	50 %	0 %	387827950
35	NC_017423	ACAT	2	8	15848	15855	50 %	25 %	0 %	25 %	387827951
36	NC_017423	TCAA	2	8	16302	16309	50 %	25 %	0 %	25 %	387827952
37	NC_017423	TTAA	2	8	16739	16746	50 %	50 %	0 %	0 %	387827953
38	NC_017423	TGAT	2	8	17121	17128	25 %	50 %	25 %	0 %	387827953
39	NC_017423	ATTT	2	8	17461	17468	25 %	75 %	0 %	0 %	387827953
40	NC_017423	TTTA	2	8	17500	17507	25 %	75 %	0 %	0 %	387827953
41	NC_017423	AAAT	2	8	18648	18655	75 %	25 %	0 %	0 %	387827954
42	NC_017423	GAAA	2	8	18761	18768	75 %	0 %	25 %	0 %	387827954
43	NC_017423	AAAC	2	8	18804	18811	75 %	0 %	0 %	25 %	387827954
44	NC_017423	TTGA	2	8	19103	19110	25 %	50 %	25 %	0 %	387827955
45	NC_017423	TTTA	2	8	19213	19220	25 %	75 %	0 %	0 %	387827955
46	NC_017423	AAAT	2	8	19335	19342	75 %	25 %	0 %	0 %	387827955
47	NC_017423	TTTA	2	8	19480	19487	25 %	75 %	0 %	0 %	387827955
48	NC_017423	TCAA	2	8	19600	19607	50 %	25 %	0 %	25 %	387827956
49	NC_017423	ATAA	2	8	19795	19802	75 %	25 %	0 %	0 %	387827956
50	NC_017423	AAAG	2	8	20730	20737	75 %	0 %	25 %	0 %	387827957
51	NC_017423	ATTG	2	8	21074	21081	25 %	50 %	25 %	0 %	387827958
52	NC_017423	AGAT	2	8	21160	21167	50 %	25 %	25 %	0 %	387827958
53	NC_017423	ATTA	2	8	21216	21223	50 %	50 %	0 %	0 %	387827958
54	NC_017423	AGAT	2	8	21388	21395	50 %	25 %	25 %	0 %	387827958
55	NC_017423	ATAA	2	8	21863	21870	75 %	25 %	0 %	0 %	387827959
56	NC_017423	AAAG	2	8	21959	21966	75 %	0 %	25 %	0 %	387827959
57	NC_017423	AAAC	2	8	22060	22067	75 %	0 %	0 %	25 %	387827959
58	NC_017423	GTAG	2	8	22091	22098	25 %	25 %	50 %	0 %	387827959
59	NC_017423	AAAT	2	8	22276	22283	75 %	25 %	0 %	0 %	387827959
60	NC_017423	GATG	2	8	22358	22365	25 %	25 %	50 %	0 %	387827959
61	NC_017423	AACT	2	8	22573	22580	50 %	25 %	0 %	25 %	387827959
62	NC_017423	AGAT	2	8	23071	23078	50 %	25 %	25 %	0 %	387827959
63	NC_017423	ATTT	2	8	23824	23831	25 %	75 %	0 %	0 %	387827961
64	NC_017423	AATT	2	8	24227	24234	50 %	50 %	0 %	0 %	387827961
65	NC_017423	TAAA	2	8	24251	24258	75 %	25 %	0 %	0 %	387827961
66	NC_017423	GGTT	2	8	24266	24273	0 %	50 %	50 %	0 %	387827961
67	NC_017423	CAAA	2	8	25542	25549	75 %	0 %	0 %	25 %	387827962
68	NC_017423	CAAA	2	8	26427	26434	75 %	0 %	0 %	25 %	387827964
69	NC_017423	AATT	2	8	26516	26523	50 %	50 %	0 %	0 %	387827964
70	NC_017423	AAAT	2	8	27217	27224	75 %	25 %	0 %	0 %	387827964

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.