MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-12

Total Repeats: 367

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017423	GTT	2	6	66	71	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827927
2	NC_017423	AGA	2	6	165	170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827927
3	NC_017423	TAT	2	6	273	278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827927
4	NC_017423	GAA	2	6	343	348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827927
5	NC_017423	ATG	2	6	464	469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827927
6	NC_017423	CAA	2	6	680	685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827927
7	NC_017423	CTT	2	6	686	691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827927
8	NC_017423	TAG	2	6	708	713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827927
9	NC_017423	AAT	2	6	715	720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827927
10	NC_017423	TCT	2	6	742	747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827927
11	NC_017423	ATA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827927
12	NC_017423	TAA	2	6	852	857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827927
13	NC_017423	GTT	2	6	901	906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827927
14	NC_017423	AGG	2	6	929	934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827927
15	NC_017423	ATG	2	6	1022	1027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827927
16	NC_017423	ATT	2	6	1046	1051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827927
17	NC_017423	GAA	2	6	1159	1164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827927
18	NC_017423	ATG	2	6	1241	1246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827927
19	NC_017423	ATT	2	6	1272	1277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827927
20	NC_017423	GAA	2	6	1316	1321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827928
21	NC_017423	AGA	2	6	1324	1329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827928
22	NC_017423	AGC	2	6	1353	1358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827928
23	NC_017423	ATA	2	6	1431	1436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827928
24	NC_017423	GAA	2	6	1502	1507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827928
25	NC_017423	AGC	2	6	1586	1591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827928
26	NC_017423	GAA	2	6	1850	1855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827928
27	NC_017423	AAG	2	6	1966	1971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827928
28	NC_017423	CAA	2	6	2081	2086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827929
29	NC_017423	TGG	2	6	2149	2154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827929
30	NC_017423	TAG	2	6	2164	2169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827929
31	NC_017423	AAC	2	6	2245	2250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827929
32	NC_017423	GGT	2	6	2273	2278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827929
33	NC_017423	ATA	2	6	2611	2616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827930
34	NC_017423	TGA	2	6	2738	2743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827930
35	NC_017423	AGA	2	6	2888	2893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827930
36	NC_017423	GTG	2	6	2932	2937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827930
37	NC_017423	AAT	2	6	3057	3062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827930
38	NC_017423	AAG	2	6	3083	3088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827930
39	NC_017423	TGA	2	6	3122	3127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827930
40	NC_017423	TTA	2	6	3136	3141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827930
41	NC_017423	TGG	2	6	3152	3157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827930
42	NC_017423	TAA	2	6	3299	3304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827930
43	NC_017423	TGG	3	9	3335	3343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827930
44	NC_017423	AGA	2	6	3414	3419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827931
45	NC_017423	ATC	2	6	3558	3563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827931
46	NC_017423	GGT	2	6	3659	3664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827931
47	NC_017423	CTA	2	6	3714	3719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827931
48	NC_017423	TAA	2	6	3733	3738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827931
49	NC_017423	TAG	2	6	3753	3758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827931
50	NC_017423	TAA	2	6	3799	3804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827931
51	NC_017423	TAA	2	6	3947	3952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827931
52	NC_017423	ATT	2	6	3976	3981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827932
53	NC_017423	TGA	2	6	3982	3987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827932
54	NC_017423	ATT	2	6	3990	3995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827932
55	NC_017423	ATT	2	6	4209	4214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827932
56	NC_017423	TCT	2	6	4250	4255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827932
57	NC_017423	TAA	3	9	4294	4302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827932
58	NC_017423	AGT	2	6	4337	4342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827932
59	NC_017423	TTA	2	6	4356	4361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827932
60	NC_017423	CTT	2	6	4442	4447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827932
61	NC_017423	AGA	2	6	4468	4473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827932
62	NC_017423	GTG	2	6	4482	4487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827932
63	NC_017423	ATG	2	6	4571	4576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827932
64	NC_017423	GCA	3	9	4622	4630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827932
65	NC_017423	GCA	2	6	4637	4642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827932
66	NC_017423	AGT	2	6	4643	4648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827932
67	NC_017423	TAA	2	6	4693	4698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827932
68	NC_017423	AGA	2	6	4702	4707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827932
69	NC_017423	CTA	2	6	4887	4892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827932
70	NC_017423	GAA	2	6	4988	4993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827933
71	NC_017423	ATT	2	6	5262	5267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827933
72	NC_017423	GAA	2	6	5288	5293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827933
73	NC_017423	GTG	2	6	5408	5413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827934
74	NC_017423	TGT	2	6	5496	5501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827934
75	NC_017423	TTA	2	6	5570	5575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827934
76	NC_017423	TAG	2	6	5900	5905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827935
77	NC_017423	CAA	2	6	5927	5932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827935
78	NC_017423	AGC	2	6	6087	6092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827935
79	NC_017423	TTG	2	6	6109	6114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827935
80	NC_017423	AAT	2	6	6236	6241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827936
81	NC_017423	ACT	2	6	6296	6301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827936
82	NC_017423	ATA	2	6	6311	6316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827936
83	NC_017423	ACA	2	6	6337	6342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827936
84	NC_017423	TTA	2	6	6606	6611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827936
85	NC_017423	CAA	2	6	6631	6636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827936
86	NC_017423	AGG	3	9	6693	6701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827936
87	NC_017423	ATT	2	6	6772	6777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827937
88	NC_017423	TAA	2	6	6860	6865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827937
89	NC_017423	CAA	2	6	6911	6916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827937
90	NC_017423	GAA	2	6	6978	6983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827937
91	NC_017423	TAC	2	6	7038	7043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827937
92	NC_017423	TGT	2	6	7067	7072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827937
93	NC_017423	TTA	2	6	7075	7080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827937
94	NC_017423	GAT	2	6	7104	7109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827937
95	NC_017423	TAA	2	6	7136	7141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827937
96	NC_017423	CAA	2	6	7174	7179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827937
97	NC_017423	AAC	2	6	7195	7200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827937
98	NC_017423	TTG	2	6	7237	7242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827937
99	NC_017423	TAA	3	9	7250	7258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827937
100	NC_017423	GCT	2	6	7344	7349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827937
101	NC_017423	TTG	2	6	7357	7362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827937
102	NC_017423	CTT	2	6	7413	7418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827937
103	NC_017423	AAG	2	6	7453	7458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827937
104	NC_017423	ATT	2	6	7524	7529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827937
105	NC_017423	TTA	2	6	7534	7539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827937
106	NC_017423	ATG	2	6	7759	7764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827937
107	NC_017423	TAC	2	6	7778	7783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827937
108	NC_017423	GGT	2	6	7876	7881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827938
109	NC_017423	ACA	2	6	7924	7929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827938
110	NC_017423	ATA	2	6	7966	7971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827938
111	NC_017423	TGA	2	6	8061	8066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827938
112	NC_017423	CTA	2	6	8135	8140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827938
113	NC_017423	ATT	2	6	8143	8148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827938
114	NC_017423	GAA	2	6	8170	8175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827938
115	NC_017423	AAG	2	6	8181	8186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827938
116	NC_017423	TTA	2	6	8276	8281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827939
117	NC_017423	TTA	2	6	8511	8516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827939
118	NC_017423	TTG	2	6	8528	8533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827939
119	NC_017423	TAT	2	6	8535	8540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827939
120	NC_017423	AAT	2	6	8620	8625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827939
121	NC_017423	GAA	2	6	8802	8807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827940
122	NC_017423	AAT	2	6	8834	8839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827940
123	NC_017423	ATG	2	6	8881	8886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827940
124	NC_017423	ATT	2	6	8933	8938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827940
125	NC_017423	TGC	2	6	9012	9017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827941
126	NC_017423	TTA	2	6	9187	9192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827941
127	NC_017423	CTT	2	6	9568	9573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827941
128	NC_017423	AAG	2	6	9602	9607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827941
129	NC_017423	GTG	2	6	9773	9778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827941
130	NC_017423	TGC	2	6	9804	9809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827941
131	NC_017423	TGA	2	6	9813	9818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827941
132	NC_017423	CAA	2	6	9913	9918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827941
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.