MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-12

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017423	TA	3	6	427	432	50 %	50 %	0 %	0 %	387827927
2	NC_017423	AT	3	6	499	504	50 %	50 %	0 %	0 %	387827927
3	NC_017423	TA	3	6	1406	1411	50 %	50 %	0 %	0 %	387827928
4	NC_017423	AG	3	6	1508	1513	50 %	0 %	50 %	0 %	387827928
5	NC_017423	TA	3	6	2963	2968	50 %	50 %	0 %	0 %	387827930
6	NC_017423	TG	3	6	3006	3011	0 %	50 %	50 %	0 %	387827930
7	NC_017423	AT	3	6	5921	5926	50 %	50 %	0 %	0 %	387827935
8	NC_017423	AT	4	8	6413	6420	50 %	50 %	0 %	0 %	387827936
9	NC_017423	TA	3	6	7506	7511	50 %	50 %	0 %	0 %	387827937
10	NC_017423	TA	3	6	8038	8043	50 %	50 %	0 %	0 %	387827938
11	NC_017423	GA	3	6	10381	10386	50 %	0 %	50 %	0 %	387827942
12	NC_017423	AT	3	6	10487	10492	50 %	50 %	0 %	0 %	387827942
13	NC_017423	TA	3	6	10666	10671	50 %	50 %	0 %	0 %	387827942
14	NC_017423	AT	3	6	11189	11194	50 %	50 %	0 %	0 %	387827943
15	NC_017423	TA	3	6	11686	11691	50 %	50 %	0 %	0 %	387827943
16	NC_017423	AC	3	6	11712	11717	50 %	0 %	0 %	50 %	387827943
17	NC_017423	CA	3	6	12075	12080	50 %	0 %	0 %	50 %	387827944
18	NC_017423	TA	3	6	12198	12203	50 %	50 %	0 %	0 %	387827944
19	NC_017423	AT	3	6	12744	12749	50 %	50 %	0 %	0 %	387827945
20	NC_017423	AT	4	8	13136	13143	50 %	50 %	0 %	0 %	387827946
21	NC_017423	AT	3	6	13414	13419	50 %	50 %	0 %	0 %	387827946
22	NC_017423	AT	3	6	13823	13828	50 %	50 %	0 %	0 %	387827947
23	NC_017423	AT	3	6	14020	14025	50 %	50 %	0 %	0 %	387827947
24	NC_017423	AT	3	6	14602	14607	50 %	50 %	0 %	0 %	387827948
25	NC_017423	TA	3	6	14910	14915	50 %	50 %	0 %	0 %	387827948
26	NC_017423	CA	3	6	14935	14940	50 %	0 %	0 %	50 %	387827948
27	NC_017423	TA	4	8	15032	15039	50 %	50 %	0 %	0 %	387827948
28	NC_017423	AT	3	6	16323	16328	50 %	50 %	0 %	0 %	387827952
29	NC_017423	AT	3	6	16334	16339	50 %	50 %	0 %	0 %	387827952
30	NC_017423	AT	3	6	16542	16547	50 %	50 %	0 %	0 %	387827953
31	NC_017423	AC	3	6	16572	16577	50 %	0 %	0 %	50 %	387827953
32	NC_017423	AT	3	6	16766	16771	50 %	50 %	0 %	0 %	387827953
33	NC_017423	CT	3	6	18254	18259	0 %	50 %	0 %	50 %	387827954
34	NC_017423	TA	3	6	19515	19520	50 %	50 %	0 %	0 %	387827955
35	NC_017423	AT	3	6	19763	19768	50 %	50 %	0 %	0 %	387827956
36	NC_017423	TA	3	6	19939	19944	50 %	50 %	0 %	0 %	387827956
37	NC_017423	GA	4	8	20194	20201	50 %	0 %	50 %	0 %	387827956
38	NC_017423	AT	3	6	20307	20312	50 %	50 %	0 %	0 %	387827956
39	NC_017423	AG	3	6	21086	21091	50 %	0 %	50 %	0 %	387827958
40	NC_017423	AT	3	6	21106	21111	50 %	50 %	0 %	0 %	387827958
41	NC_017423	AT	3	6	21193	21198	50 %	50 %	0 %	0 %	387827958
42	NC_017423	AT	3	6	21280	21285	50 %	50 %	0 %	0 %	387827958
43	NC_017423	AT	3	6	21334	21339	50 %	50 %	0 %	0 %	387827958
44	NC_017423	TA	3	6	22188	22193	50 %	50 %	0 %	0 %	387827959
45	NC_017423	CA	3	6	22704	22709	50 %	0 %	0 %	50 %	387827959
46	NC_017423	TG	3	6	23977	23982	0 %	50 %	50 %	0 %	387827961
47	NC_017423	TG	3	6	25956	25961	0 %	50 %	50 %	0 %	387827963
48	NC_017423	AT	3	6	26482	26487	50 %	50 %	0 %	0 %	387827964
49	NC_017423	AT	4	8	26822	26829	50 %	50 %	0 %	0 %	387827964
50	NC_017423	TA	3	6	27139	27144	50 %	50 %	0 %	0 %	387827964
51	NC_017423	AT	3	6	27482	27487	50 %	50 %	0 %	0 %	387827964

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.