MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-7

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017422	TCAA	2	8	42	49	50 %	25 %	0 %	25 %	387827904
2	NC_017422	AATT	2	8	306	313	50 %	50 %	0 %	0 %	387827904
3	NC_017422	GTTT	2	8	326	333	0 %	75 %	25 %	0 %	387827904
4	NC_017422	TAAT	2	8	867	874	50 %	50 %	0 %	0 %	387827906
5	NC_017422	AGAT	2	8	1546	1553	50 %	25 %	25 %	0 %	387827906
6	NC_017422	TATC	2	8	1758	1765	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017422	ATTT	2	8	1968	1975	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017422	TAAA	2	8	2261	2268	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017422	GAAT	2	8	2496	2503	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017422	TATT	2	8	2886	2893	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017422	TCAA	2	8	3525	3532	50 %	25 %	0 %	25 %	387827908
12	NC_017422	AGGA	2	8	3597	3604	50 %	0 %	50 %	0 %	387827908
13	NC_017422	CTAT	2	8	3609	3616	25 %	50 %	0 %	25 %	387827908
14	NC_017422	TAAC	2	8	3679	3686	50 %	25 %	0 %	25 %	387827909
15	NC_017422	AGAT	2	8	4675	4682	50 %	25 %	25 %	0 %	387827911
16	NC_017422	TTGT	2	8	5102	5109	0 %	75 %	25 %	0 %	387827912
17	NC_017422	CAAA	2	8	5157	5164	75 %	0 %	0 %	25 %	387827912
18	NC_017422	TCTT	2	8	5578	5585	0 %	75 %	0 %	25 %	387827913
19	NC_017422	CTTG	2	8	5982	5989	0 %	50 %	25 %	25 %	387827913
20	NC_017422	AAGA	3	12	7338	7349	75 %	0 %	25 %	0 %	387827914
21	NC_017422	AATA	2	8	7465	7472	75 %	25 %	0 %	0 %	387827914
22	NC_017422	GAAA	2	8	7531	7538	75 %	0 %	25 %	0 %	387827914
23	NC_017422	AAAT	2	8	7617	7624	75 %	25 %	0 %	0 %	387827914
24	NC_017422	GAAA	2	8	7730	7737	75 %	0 %	25 %	0 %	387827914
25	NC_017422	TTGA	2	8	8072	8079	25 %	50 %	25 %	0 %	387827915
26	NC_017422	AAAT	2	8	8304	8311	75 %	25 %	0 %	0 %	387827915
27	NC_017422	TAAA	2	8	9176	9183	75 %	25 %	0 %	0 %	387827916
28	NC_017422	ATAG	2	8	10146	10153	50 %	25 %	25 %	0 %	387827918
29	NC_017422	ATAA	2	8	10167	10174	75 %	25 %	0 %	0 %	387827918
30	NC_017422	ATAG	2	8	10221	10228	50 %	25 %	25 %	0 %	387827918
31	NC_017422	ATAG	2	8	10254	10261	50 %	25 %	25 %	0 %	387827918
32	NC_017422	GCAA	2	8	10335	10342	50 %	0 %	25 %	25 %	387827918
33	NC_017422	CTTT	2	8	10533	10540	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017422	TTTA	2	8	10657	10664	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017422	TAAG	2	8	11041	11048	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017422	AAAT	2	8	11342	11349	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017422	AATC	2	8	11913	11920	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017422	AGAT	2	8	12137	12144	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017422	ATTA	2	8	12272	12279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017422	AAAT	3	12	12860	12871	75 %	25 %	0 %	0 %	387827920
41	NC_017422	TTTA	2	8	12891	12898	25 %	75 %	0 %	0 %	387827920
42	NC_017422	ACCA	2	8	13244	13251	50 %	0 %	0 %	50 %	387827920
43	NC_017422	TGCA	2	8	13608	13615	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017422	AAGA	2	8	13676	13683	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017422	AATA	2	8	14715	14722	75 %	25 %	0 %	0 %	387827922
46	NC_017422	AAGA	2	8	14806	14813	75 %	0 %	25 %	0 %	387827922
47	NC_017422	CAAA	2	8	15065	15072	75 %	0 %	0 %	25 %	387827922
48	NC_017422	TTAT	2	8	15273	15280	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017422	AATA	2	8	15886	15893	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017422	TAAA	2	8	16378	16385	75 %	25 %	0 %	0 %	387827924
51	NC_017422	AATT	2	8	16424	16431	50 %	50 %	0 %	0 %	387827924
52	NC_017422	CAAA	2	8	16583	16590	75 %	0 %	0 %	25 %	387827925
53	NC_017422	AAAT	2	8	16621	16628	75 %	25 %	0 %	0 %	387827925
54	NC_017422	AATT	2	8	16672	16679	50 %	50 %	0 %	0 %	387827925
55	NC_017422	TGAT	2	8	16986	16993	25 %	50 %	25 %	0 %	387827925
56	NC_017422	AGCA	2	8	17347	17354	50 %	0 %	25 %	25 %	387827925
57	NC_017422	AAAT	2	8	17373	17380	75 %	25 %	0 %	0 %	387827925

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.