MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-7

Total Repeats: 183

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017422	ATA	2	6	221	226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827904
2	NC_017422	AAT	2	6	387	392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827905
3	NC_017422	TAA	2	6	407	412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827905
4	NC_017422	TTG	2	6	424	429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827905
5	NC_017422	TGA	2	6	437	442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827905
6	NC_017422	CTC	2	6	499	504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387827905
7	NC_017422	TAA	2	6	610	615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827905
8	NC_017422	ACT	2	6	624	629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827905
9	NC_017422	ACA	2	6	637	642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827905
10	NC_017422	TGA	2	6	802	807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827906
11	NC_017422	ATT	2	6	830	835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827906
12	NC_017422	TCT	2	6	839	844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827906
13	NC_017422	GAA	3	9	857	865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827906
14	NC_017422	TGG	2	6	907	912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827906
15	NC_017422	GCT	2	6	923	928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827906
16	NC_017422	GAA	2	6	932	937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827906
17	NC_017422	TCT	2	6	944	949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827906
18	NC_017422	CTA	2	6	1086	1091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827906
19	NC_017422	AAC	2	6	1138	1143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827906
20	NC_017422	ATT	2	6	1331	1336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827906
21	NC_017422	ATG	2	6	1515	1520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827906
22	NC_017422	CTT	2	6	3113	3118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827907
23	NC_017422	TTC	2	6	3189	3194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827907
24	NC_017422	TTA	2	6	3203	3208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827907
25	NC_017422	TGA	2	6	3382	3387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827908
26	NC_017422	TGA	2	6	3553	3558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827908
27	NC_017422	AAT	2	6	3629	3634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827908
28	NC_017422	GAA	2	6	3816	3821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827909
29	NC_017422	ACA	2	6	3841	3846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827909
30	NC_017422	ATA	2	6	3852	3857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827909
31	NC_017422	CTA	2	6	3982	3987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827910
32	NC_017422	CAC	2	6	4008	4013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387827910
33	NC_017422	AGA	2	6	4029	4034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827910
34	NC_017422	ATT	2	6	4048	4053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827910
35	NC_017422	TAA	2	6	4287	4292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827910
36	NC_017422	CAA	2	6	4432	4437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827911
37	NC_017422	TTA	2	6	4477	4482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827911
38	NC_017422	AAC	2	6	4495	4500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827911
39	NC_017422	AGA	2	6	4744	4749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827911
40	NC_017422	AGA	2	6	4798	4803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827911
41	NC_017422	ATT	2	6	5096	5101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827912
42	NC_017422	AGA	2	6	5195	5200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827912
43	NC_017422	ACA	2	6	5204	5209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827912
44	NC_017422	AGA	2	6	5228	5233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827912
45	NC_017422	ATG	2	6	5335	5340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827912
46	NC_017422	ATG	2	6	5398	5403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827912
47	NC_017422	AAC	2	6	5407	5412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827912
48	NC_017422	GGT	2	6	5432	5437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827912
49	NC_017422	GTG	2	6	5452	5457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827912
50	NC_017422	ACT	2	6	5484	5489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827912
51	NC_017422	TGG	2	6	5501	5506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827912
52	NC_017422	ATC	2	6	5668	5673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827913
53	NC_017422	CAT	3	9	5769	5777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827913
54	NC_017422	TAT	2	6	5811	5816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827913
55	NC_017422	TTA	2	6	5909	5914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827913
56	NC_017422	ATT	2	6	6016	6021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827913
57	NC_017422	TGC	2	6	6031	6036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827913
58	NC_017422	ACA	2	6	6134	6139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827913
59	NC_017422	TAA	2	6	6240	6245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827913
60	NC_017422	TCT	2	6	6335	6340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827913
61	NC_017422	ATT	3	9	6469	6477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827913
62	NC_017422	CAA	2	6	6925	6930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827914
63	NC_017422	TAC	2	6	7124	7129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827914
64	NC_017422	CAA	2	6	7207	7212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827914
65	NC_017422	TAG	2	6	7288	7293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827914
66	NC_017422	TAA	2	6	7318	7323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827914
67	NC_017422	ATA	2	6	7326	7331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827914
68	NC_017422	AGA	2	6	7336	7341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827914
69	NC_017422	ATT	2	6	7380	7385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827914
70	NC_017422	AAT	2	6	7388	7393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827914
71	NC_017422	CAG	2	6	7407	7412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827914
72	NC_017422	TAA	2	6	7497	7502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827914
73	NC_017422	ACA	2	6	7566	7571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827914
74	NC_017422	AGA	2	6	7585	7590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827914
75	NC_017422	TAT	2	6	7666	7671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827914
76	NC_017422	CAA	2	6	7751	7756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827914
77	NC_017422	AAC	2	6	7800	7805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827914
78	NC_017422	AGA	2	6	7866	7871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827914
79	NC_017422	ATT	2	6	7912	7917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827914
80	NC_017422	ATA	2	6	7922	7927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827914
81	NC_017422	AGA	2	6	7954	7959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827914
82	NC_017422	ATG	2	6	8117	8122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827915
83	NC_017422	TTG	2	6	8202	8207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827915
84	NC_017422	AAG	2	6	8232	8237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827915
85	NC_017422	TAA	2	6	8292	8297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827915
86	NC_017422	AAT	2	6	8429	8434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827915
87	NC_017422	ACA	2	6	8439	8444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827915
88	NC_017422	AAC	2	6	8475	8480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827915
89	NC_017422	TAA	2	6	8526	8531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827915
90	NC_017422	ATA	2	6	8537	8542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827915
91	NC_017422	ATA	2	6	8554	8559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827915
92	NC_017422	AGA	2	6	8703	8708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827916
93	NC_017422	TAA	2	6	8790	8795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827916
94	NC_017422	TAA	2	6	8835	8840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827916
95	NC_017422	ATA	2	6	8911	8916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827916
96	NC_017422	CAG	2	6	8993	8998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827916
97	NC_017422	AAT	2	6	9075	9080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827916
98	NC_017422	AGA	2	6	9168	9173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827916
99	NC_017422	AAT	2	6	9264	9269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827916
100	NC_017422	ATA	2	6	9328	9333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827917
101	NC_017422	GAA	2	6	9370	9375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827917
102	NC_017422	AAG	2	6	9382	9387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827917
103	NC_017422	CAA	2	6	9415	9420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827917
104	NC_017422	TAT	2	6	9427	9432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827917
105	NC_017422	TTA	2	6	9443	9448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827917
106	NC_017422	AGA	2	6	9594	9599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827917
107	NC_017422	ATT	2	6	9777	9782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827917
108	NC_017422	TAA	2	6	9783	9788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827917
109	NC_017422	AAC	2	6	9827	9832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827917
110	NC_017422	GAG	2	6	9927	9932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827918
111	NC_017422	TTC	2	6	9949	9954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827918
112	NC_017422	AAT	2	6	9992	9997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827918
113	NC_017422	ATA	2	6	10300	10305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827918
114	NC_017422	TAA	2	6	10363	10368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827918
115	NC_017422	TAA	2	6	10406	10411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827918
116	NC_017422	TTA	2	6	12284	12289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827919
117	NC_017422	GTT	2	6	12341	12346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827919
118	NC_017422	ATT	2	6	12362	12367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827919
119	NC_017422	TAT	2	6	12421	12426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827919
120	NC_017422	TAT	2	6	12465	12470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827919
121	NC_017422	ATT	2	6	12491	12496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827919
122	NC_017422	ATT	2	6	12533	12538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827919
123	NC_017422	CAA	2	6	12608	12613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827919
124	NC_017422	AGA	2	6	12762	12767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827920
125	NC_017422	GAA	2	6	12799	12804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827920
126	NC_017422	TTA	2	6	12934	12939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827920
127	NC_017422	TGT	2	6	13136	13141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827920
128	NC_017422	AGA	2	6	13362	13367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827920
129	NC_017422	TTA	2	6	13403	13408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827920
130	NC_017422	TGA	2	6	13414	13419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827920
131	NC_017422	TAA	2	6	13425	13430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827920
132	NC_017422	ATT	2	6	13455	13460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827920
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.