MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp38

Total Repeats: 16

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017421	TTTATT	2	12	6056	6067	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387827770
2	NC_017421	CAAATT	2	12	6157	6168	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387827770
3	NC_017421	ATCAGA	3	18	6524	6541	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387827770
4	NC_017421	ATTCTG	2	12	6550	6561	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387827770
5	NC_017421	TAAAAC	2	12	11780	11791	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387827775
6	NC_017421	TAAATT	2	12	12358	12369	50 %	50 %	0 %	0 %	387827776
7	NC_017421	TTTTTA	2	12	18513	18524	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387827783
8	NC_017421	GTCTTC	2	12	19175	19186	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387827783
9	NC_017421	CAAAGG	2	12	20050	20061	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387827784
10	NC_017421	GATAAT	2	12	24037	24048	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387827788
11	NC_017421	AGCTTC	2	12	26063	26074	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387827789
12	NC_017421	TATCTC	2	12	28067	28078	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387827790
13	NC_017421	CTTTTC	2	12	28330	28341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827790
14	NC_017421	GATAAT	2	12	32072	32083	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387827793
15	NC_017421	CTTTAT	2	12	35861	35872	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387827797
16	NC_017421	TAAATA	2	12	36086	36097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827797

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.