MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp38

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017421	AGTGG	2	10	86	95	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017421	ATTAT	2	10	400	409	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017421	AGCAA	2	10	1309	1318	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017421	AAAAC	2	10	2281	2290	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017421	AAAAT	2	10	2403	2412	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017421	TCTTT	2	10	3019	3028	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017421	TAATA	2	10	3945	3954	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017421	AGAGG	2	10	4173	4182	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017421	ATAAA	2	10	5115	5124	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017421	TTAAT	2	10	6316	6325	40 %	60 %	0 %	0 %	387827770
11	NC_017421	ATAAA	2	10	6667	6676	80 %	20 %	0 %	0 %	387827770
12	NC_017421	AATTA	2	10	8061	8070	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017421	CTTTT	2	10	9256	9265	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017421	ATTTT	2	10	12925	12934	20 %	80 %	0 %	0 %	387827777
15	NC_017421	CTTAA	2	10	14047	14056	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017421	AATTT	2	10	16131	16140	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017421	TTGTT	2	10	16369	16378	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017421	TTAAT	2	10	17216	17225	40 %	60 %	0 %	0 %	387827781
19	NC_017421	AACAA	2	10	17570	17579	80 %	0 %	0 %	20 %	387827781
20	NC_017421	TGATT	2	10	17971	17980	20 %	60 %	20 %	0 %	387827782
21	NC_017421	AATTT	2	10	18473	18482	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017421	ATTTT	2	10	18655	18664	20 %	80 %	0 %	0 %	387827783
23	NC_017421	ATCAT	2	10	18947	18956	40 %	40 %	0 %	20 %	387827783
24	NC_017421	TCAAC	2	10	19805	19814	40 %	20 %	0 %	40 %	387827784
25	NC_017421	TAGAA	2	10	20250	20259	60 %	20 %	20 %	0 %	387827784
26	NC_017421	ATATA	2	10	21411	21420	60 %	40 %	0 %	0 %	387827785
27	NC_017421	AGCAA	2	10	21473	21482	60 %	0 %	20 %	20 %	387827785
28	NC_017421	CAAAA	2	10	22359	22368	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017421	ATTTT	2	10	22565	22574	20 %	80 %	0 %	0 %	387827787
30	NC_017421	AAGAC	2	10	22914	22923	60 %	0 %	20 %	20 %	387827787
31	NC_017421	ATATT	2	10	22986	22995	40 %	60 %	0 %	0 %	387827787
32	NC_017421	TATAT	2	10	23312	23321	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017421	TAAAT	2	10	25162	25171	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017421	TTTTC	2	10	25998	26007	0 %	80 %	0 %	20 %	387827789
35	NC_017421	GAGAG	2	10	27160	27169	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017421	TGTTT	2	10	27189	27198	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017421	ATTTT	2	10	27272	27281	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017421	TTTCT	2	10	27643	27652	0 %	80 %	0 %	20 %	387827790
39	NC_017421	ATTTA	2	10	28041	28050	40 %	60 %	0 %	0 %	387827790
40	NC_017421	ATTTA	2	10	29971	29980	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017421	AATTT	2	10	30072	30081	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017421	GTTTT	2	10	30332	30341	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017421	ATTTT	2	10	30604	30613	20 %	80 %	0 %	0 %	387827792
44	NC_017421	AAGAC	2	10	30953	30962	60 %	0 %	20 %	20 %	387827792
45	NC_017421	TATAT	2	10	31348	31357	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017421	TGCCT	6	30	33452	33481	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_017421	TAAAA	2	10	34093	34102	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017421	ATTTA	2	10	34319	34328	40 %	60 %	0 %	0 %	387827795
49	NC_017421	TAATA	2	10	34763	34772	60 %	40 %	0 %	0 %	387827795
50	NC_017421	GACTT	2	10	35526	35535	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017421	GTTTA	2	10	35913	35922	20 %	60 %	20 %	0 %	387827797
52	NC_017421	ATTTA	2	10	36243	36252	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.