MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp38

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017421	AGTGG	2	10	86	95	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017421	ATTAT	2	10	400	409	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017421	AGCAA	2	10	1309	1318	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017421	AAAAC	2	10	2281	2290	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017421	AAAAT	2	10	2403	2412	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017421	TCTTT	2	10	3019	3028	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017421	TAATA	2	10	3945	3954	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017421	AGAGG	2	10	4173	4182	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017421	ATAAA	2	10	5115	5124	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017421	AATTA	2	10	8061	8070	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017421	CTTTT	2	10	9256	9265	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017421	CTTAA	2	10	14047	14056	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017421	AATTT	2	10	16131	16140	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017421	TTGTT	2	10	16369	16378	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017421	AATTT	2	10	18473	18482	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017421	CAAAA	2	10	22359	22368	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017421	TATAT	2	10	23312	23321	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017421	TAAAT	2	10	25162	25171	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017421	GAGAG	2	10	27160	27169	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017421	TGTTT	2	10	27189	27198	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017421	ATTTT	2	10	27272	27281	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017421	ATTTA	2	10	29971	29980	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017421	AATTT	2	10	30072	30081	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017421	GTTTT	2	10	30332	30341	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017421	TATAT	2	10	31348	31357	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017421	TGCCT	6	30	33452	33481	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_017421	TAAAA	2	10	34093	34102	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017421	GACTT	2	10	35526	35535	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017421	ATTTA	2	10	36243	36252	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.