MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp38

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017421	TAAT	2	8	364	371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017421	AGAA	2	8	531	538	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017421	CTTT	2	8	3583	3590	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017421	TTAT	2	8	3605	3612	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017421	TCTT	2	8	3658	3665	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017421	AATT	2	8	3858	3865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017421	TTAT	2	8	4085	4092	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017421	TATT	2	8	4233	4240	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017421	TTTC	2	8	4321	4328	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017421	TTTA	2	8	4405	4412	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017421	CAAA	2	8	4428	4435	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017421	ACCA	2	8	4852	4859	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017421	CTTT	2	8	5223	5230	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017421	TAAA	2	8	5321	5328	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017421	GCTA	2	8	5718	5725	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017421	TAAA	3	12	6795	6806	75 %	25 %	0 %	0 %	387827770
17	NC_017421	AAGG	2	8	6817	6824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017421	TCCT	2	8	6848	6855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017421	TTAA	2	8	6870	6877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017421	TACT	2	8	6968	6975	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017421	TAAT	2	8	7155	7162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017421	ATCT	2	8	7558	7565	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017421	TTAA	2	8	8032	8039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017421	ATGT	2	8	8095	8102	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017421	CAAA	2	8	8244	8251	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017421	GCTT	2	8	8398	8405	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017421	AATA	2	8	8669	8676	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017421	CTAT	2	8	9081	9088	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017421	TATT	2	8	9197	9204	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017421	ATAA	2	8	9211	9218	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017421	TTTA	2	8	9281	9288	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017421	TGAA	2	8	9326	9333	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017421	AAAT	2	8	9340	9347	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017421	TAAA	3	12	9748	9759	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017421	AATA	2	8	9760	9767	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017421	CTTT	2	8	12291	12298	0 %	75 %	0 %	25 %	387827776
37	NC_017421	CCAT	2	8	12443	12450	25 %	25 %	0 %	50 %	387827776
38	NC_017421	TAAA	2	8	12496	12503	75 %	25 %	0 %	0 %	387827776
39	NC_017421	TTCT	2	8	12649	12656	0 %	75 %	0 %	25 %	387827776
40	NC_017421	TTTA	2	8	12665	12672	25 %	75 %	0 %	0 %	387827776
41	NC_017421	TAAT	2	8	13639	13646	50 %	50 %	0 %	0 %	387827777
42	NC_017421	CTTT	2	8	14720	14727	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017421	TTAA	2	8	14868	14875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017421	TATT	2	8	14982	14989	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017421	ATTT	2	8	15291	15298	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017421	ATTT	2	8	15610	15617	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017421	ATTT	2	8	15678	15685	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017421	ATTT	2	8	15821	15828	25 %	75 %	0 %	0 %	387827780
49	NC_017421	TTAA	2	8	16178	16185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017421	ATAA	2	8	16313	16320	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017421	AATA	2	8	16500	16507	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017421	TAAA	2	8	16619	16626	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017421	GTTT	2	8	16661	16668	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017421	ATTT	2	8	16735	16742	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017421	GAAG	2	8	17077	17084	50 %	0 %	50 %	0 %	387827781
56	NC_017421	AAGC	2	8	17256	17263	50 %	0 %	25 %	25 %	387827781
57	NC_017421	AAAG	2	8	17497	17504	75 %	0 %	25 %	0 %	387827781
58	NC_017421	CTTA	2	8	17940	17947	25 %	50 %	0 %	25 %	387827782
59	NC_017421	TTCT	2	8	18445	18452	0 %	75 %	0 %	25 %	387827782
60	NC_017421	GCTT	2	8	18749	18756	0 %	50 %	25 %	25 %	387827783
61	NC_017421	TCTT	2	8	19038	19045	0 %	75 %	0 %	25 %	387827783
62	NC_017421	ATTT	2	8	19342	19349	25 %	75 %	0 %	0 %	387827783
63	NC_017421	AATG	2	8	19827	19834	50 %	25 %	25 %	0 %	387827784
64	NC_017421	GAAA	2	8	20464	20471	75 %	0 %	25 %	0 %	387827785
65	NC_017421	ATAG	2	8	20552	20559	50 %	25 %	25 %	0 %	387827785
66	NC_017421	TATT	2	8	21147	21154	25 %	75 %	0 %	0 %	387827785
67	NC_017421	AATG	2	8	21505	21512	50 %	25 %	25 %	0 %	387827785
68	NC_017421	TCAA	2	8	21941	21948	50 %	25 %	0 %	25 %	387827786
69	NC_017421	TAGG	2	8	22580	22587	25 %	25 %	50 %	0 %	387827787
70	NC_017421	AAAG	2	8	22720	22727	75 %	0 %	25 %	0 %	387827787
71	NC_017421	AGAT	2	8	23388	23395	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017421	GATA	2	8	23478	23485	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017421	TAAG	2	8	23738	23745	50 %	25 %	25 %	0 %	387827788
74	NC_017421	AAAT	2	8	24023	24030	75 %	25 %	0 %	0 %	387827788
75	NC_017421	AAAG	2	8	24075	24082	75 %	0 %	25 %	0 %	387827788
76	NC_017421	GCTT	2	8	24357	24364	0 %	50 %	25 %	25 %	387827788
77	NC_017421	TAAA	2	8	24631	24638	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017421	TAAA	2	8	24641	24648	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017421	ACAA	2	8	24698	24705	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017421	CCTT	2	8	24855	24862	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017421	ATAG	2	8	24964	24971	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017421	AAAT	2	8	25448	25455	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017421	AAAT	2	8	25548	25555	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017421	TTAT	3	12	25624	25635	25 %	75 %	0 %	0 %	387827789
85	NC_017421	AGAA	2	8	25961	25968	75 %	0 %	25 %	0 %	387827789
86	NC_017421	TATT	2	8	26430	26437	25 %	75 %	0 %	0 %	387827789
87	NC_017421	ATTT	2	8	26720	26727	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017421	TAAA	2	8	26736	26743	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017421	TAAG	2	8	26988	26995	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017421	GCTT	2	8	27511	27518	0 %	50 %	25 %	25 %	387827790
91	NC_017421	GGCT	2	8	27575	27582	0 %	25 %	50 %	25 %	387827790
92	NC_017421	AGCA	2	8	28110	28117	50 %	0 %	25 %	25 %	387827790
93	NC_017421	TTGT	2	8	28176	28183	0 %	75 %	25 %	0 %	387827790
94	NC_017421	AGCA	2	8	28398	28405	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017421	AGAA	2	8	28773	28780	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017421	CTTA	2	8	28826	28833	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017421	CTTA	2	8	28879	28886	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017421	TTAT	2	8	29029	29036	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017421	TTTC	2	8	29455	29462	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017421	ATTT	2	8	30055	30062	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017421	TAGG	2	8	30619	30626	25 %	25 %	50 %	0 %	387827792
102	NC_017421	AAAG	2	8	30759	30766	75 %	0 %	25 %	0 %	387827792
103	NC_017421	AGAT	2	8	31423	31430	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017421	GATA	2	8	31513	31520	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017421	TAAG	2	8	31773	31780	50 %	25 %	25 %	0 %	387827793
106	NC_017421	AAAT	2	8	32058	32065	75 %	25 %	0 %	0 %	387827793
107	NC_017421	AAAG	2	8	32110	32117	75 %	0 %	25 %	0 %	387827793
108	NC_017421	GCTT	2	8	32392	32399	0 %	50 %	25 %	25 %	387827793
109	NC_017421	ATTA	2	8	32436	32443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017421	TAAA	2	8	32666	32673	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017421	TAAA	2	8	32676	32683	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017421	ACAA	2	8	32733	32740	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017421	AAAT	2	8	33114	33121	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017421	TGTA	2	8	33499	33506	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017421	TATT	2	8	33979	33986	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017421	TAAA	2	8	34249	34256	75 %	25 %	0 %	0 %	387827795
117	NC_017421	CTAT	2	8	34647	34654	25 %	50 %	0 %	25 %	387827795
118	NC_017421	CAAA	2	8	34716	34723	75 %	0 %	0 %	25 %	387827795
119	NC_017421	GTAA	2	8	35121	35128	50 %	25 %	25 %	0 %	387827796
120	NC_017421	TTGT	2	8	35187	35194	0 %	75 %	25 %	0 %	387827796
121	NC_017421	TAAA	2	8	35210	35217	75 %	25 %	0 %	0 %	387827796
122	NC_017421	AATA	2	8	35375	35382	75 %	25 %	0 %	0 %	387827796
123	NC_017421	TAGC	2	8	35413	35420	25 %	25 %	25 %	25 %	387827796
124	NC_017421	AAAT	2	8	35468	35475	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017421	AGCT	2	8	35618	35625	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017421	AAAT	2	8	35627	35634	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017421	AATT	2	8	35942	35949	50 %	50 %	0 %	0 %	387827797
128	NC_017421	TTAT	2	8	36584	36591	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017421	ATCA	2	8	37597	37604	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017421	AAAT	2	8	37837	37844	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.