MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp38

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017421	TAAA	3	12	6795	6806	75 %	25 %	0 %	0 %	387827770
2	NC_017421	CTTT	2	8	12291	12298	0 %	75 %	0 %	25 %	387827776
3	NC_017421	CCAT	2	8	12443	12450	25 %	25 %	0 %	50 %	387827776
4	NC_017421	TAAA	2	8	12496	12503	75 %	25 %	0 %	0 %	387827776
5	NC_017421	TTCT	2	8	12649	12656	0 %	75 %	0 %	25 %	387827776
6	NC_017421	TTTA	2	8	12665	12672	25 %	75 %	0 %	0 %	387827776
7	NC_017421	TAAT	2	8	13639	13646	50 %	50 %	0 %	0 %	387827777
8	NC_017421	ATTT	2	8	15821	15828	25 %	75 %	0 %	0 %	387827780
9	NC_017421	GAAG	2	8	17077	17084	50 %	0 %	50 %	0 %	387827781
10	NC_017421	AAGC	2	8	17256	17263	50 %	0 %	25 %	25 %	387827781
11	NC_017421	AAAG	2	8	17497	17504	75 %	0 %	25 %	0 %	387827781
12	NC_017421	CTTA	2	8	17940	17947	25 %	50 %	0 %	25 %	387827782
13	NC_017421	TTCT	2	8	18445	18452	0 %	75 %	0 %	25 %	387827782
14	NC_017421	GCTT	2	8	18749	18756	0 %	50 %	25 %	25 %	387827783
15	NC_017421	TCTT	2	8	19038	19045	0 %	75 %	0 %	25 %	387827783
16	NC_017421	ATTT	2	8	19342	19349	25 %	75 %	0 %	0 %	387827783
17	NC_017421	AATG	2	8	19827	19834	50 %	25 %	25 %	0 %	387827784
18	NC_017421	GAAA	2	8	20464	20471	75 %	0 %	25 %	0 %	387827785
19	NC_017421	ATAG	2	8	20552	20559	50 %	25 %	25 %	0 %	387827785
20	NC_017421	TATT	2	8	21147	21154	25 %	75 %	0 %	0 %	387827785
21	NC_017421	AATG	2	8	21505	21512	50 %	25 %	25 %	0 %	387827785
22	NC_017421	TCAA	2	8	21941	21948	50 %	25 %	0 %	25 %	387827786
23	NC_017421	TAGG	2	8	22580	22587	25 %	25 %	50 %	0 %	387827787
24	NC_017421	AAAG	2	8	22720	22727	75 %	0 %	25 %	0 %	387827787
25	NC_017421	TAAG	2	8	23738	23745	50 %	25 %	25 %	0 %	387827788
26	NC_017421	AAAT	2	8	24023	24030	75 %	25 %	0 %	0 %	387827788
27	NC_017421	AAAG	2	8	24075	24082	75 %	0 %	25 %	0 %	387827788
28	NC_017421	GCTT	2	8	24357	24364	0 %	50 %	25 %	25 %	387827788
29	NC_017421	TTAT	3	12	25624	25635	25 %	75 %	0 %	0 %	387827789
30	NC_017421	AGAA	2	8	25961	25968	75 %	0 %	25 %	0 %	387827789
31	NC_017421	TATT	2	8	26430	26437	25 %	75 %	0 %	0 %	387827789
32	NC_017421	GCTT	2	8	27511	27518	0 %	50 %	25 %	25 %	387827790
33	NC_017421	GGCT	2	8	27575	27582	0 %	25 %	50 %	25 %	387827790
34	NC_017421	AGCA	2	8	28110	28117	50 %	0 %	25 %	25 %	387827790
35	NC_017421	TTGT	2	8	28176	28183	0 %	75 %	25 %	0 %	387827790
36	NC_017421	TAGG	2	8	30619	30626	25 %	25 %	50 %	0 %	387827792
37	NC_017421	AAAG	2	8	30759	30766	75 %	0 %	25 %	0 %	387827792
38	NC_017421	TAAG	2	8	31773	31780	50 %	25 %	25 %	0 %	387827793
39	NC_017421	AAAT	2	8	32058	32065	75 %	25 %	0 %	0 %	387827793
40	NC_017421	AAAG	2	8	32110	32117	75 %	0 %	25 %	0 %	387827793
41	NC_017421	GCTT	2	8	32392	32399	0 %	50 %	25 %	25 %	387827793
42	NC_017421	TAAA	2	8	34249	34256	75 %	25 %	0 %	0 %	387827795
43	NC_017421	CTAT	2	8	34647	34654	25 %	50 %	0 %	25 %	387827795
44	NC_017421	CAAA	2	8	34716	34723	75 %	0 %	0 %	25 %	387827795
45	NC_017421	GTAA	2	8	35121	35128	50 %	25 %	25 %	0 %	387827796
46	NC_017421	TTGT	2	8	35187	35194	0 %	75 %	25 %	0 %	387827796
47	NC_017421	TAAA	2	8	35210	35217	75 %	25 %	0 %	0 %	387827796
48	NC_017421	AATA	2	8	35375	35382	75 %	25 %	0 %	0 %	387827796
49	NC_017421	TAGC	2	8	35413	35420	25 %	25 %	25 %	25 %	387827796
50	NC_017421	AATT	2	8	35942	35949	50 %	50 %	0 %	0 %	387827797

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.