MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp38

Total Repeats: 305

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017421	TAA	2	6	1	6	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017421	ATT	3	9	42	50	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017421	AAT	2	6	126	131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017421	TAC	2	6	165	170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017421	CAA	2	6	283	288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017421	TTA	2	6	352	357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017421	ATT	2	6	376	381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017421	TAT	2	6	391	396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017421	AAT	2	6	505	510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017421	TAA	2	6	543	548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017421	TGA	2	6	570	575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017421	AGA	3	9	631	639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017421	CAT	2	6	690	695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017421	ATA	2	6	711	716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017421	CCT	2	6	827	832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_017421	TTA	2	6	885	890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017421	ATT	2	6	962	967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017421	TTA	2	6	1008	1013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017421	ACA	2	6	1113	1118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017421	ACT	2	6	1226	1231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017421	TAG	2	6	1258	1263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017421	TAA	2	6	1277	1282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017421	ATA	2	6	1324	1329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017421	TAA	2	6	1364	1369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017421	ATA	2	6	1377	1382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017421	TAT	2	6	1400	1405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017421	TAA	3	9	1414	1422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017421	ATT	3	9	1440	1448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017421	ATA	2	6	1487	1492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017421	TAT	2	6	1561	1566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017421	GCA	2	6	1638	1643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017421	ATT	3	9	1805	1813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017421	TTA	2	6	1935	1940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017421	CTT	2	6	1984	1989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017421	GTT	2	6	2222	2227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017421	ATG	2	6	2374	2379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017421	TTC	2	6	2631	2636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017421	TGT	2	6	2640	2645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017421	TAT	2	6	2672	2677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017421	ACT	2	6	2743	2748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017421	CTG	2	6	2800	2805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017421	ATT	2	6	2907	2912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017421	TAA	2	6	2995	3000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017421	ACT	2	6	3182	3187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017421	ATA	2	6	3293	3298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017421	ATC	2	6	3302	3307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017421	CTA	2	6	3320	3325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017421	TAA	2	6	3335	3340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017421	ATT	2	6	3439	3444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017421	TAT	2	6	3459	3464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017421	TTA	2	6	3528	3533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017421	TAA	2	6	3628	3633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017421	ATA	2	6	3651	3656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017421	TTA	2	6	3765	3770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017421	ATT	2	6	3777	3782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017421	AGA	2	6	3824	3829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017421	TAA	2	6	3837	3842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017421	ATA	2	6	3937	3942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017421	TTA	2	6	4012	4017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017421	TAT	2	6	4102	4107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017421	ATC	2	6	4198	4203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017421	GAA	2	6	4282	4287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017421	AAC	2	6	4308	4313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017421	TAG	2	6	4339	4344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017421	TAA	2	6	4376	4381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017421	TCT	2	6	4447	4452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017421	ATT	4	12	4461	4472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017421	TAA	2	6	4591	4596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017421	GTA	2	6	4635	4640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017421	TAA	2	6	4660	4665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017421	AAG	2	6	4680	4685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017421	CTG	2	6	4770	4775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017421	TCC	2	6	4797	4802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_017421	TAA	2	6	4837	4842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017421	CTA	2	6	4914	4919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017421	GAA	2	6	4922	4927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017421	TTA	2	6	4965	4970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017421	TAA	2	6	5031	5036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017421	AAT	2	6	5039	5044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017421	ATG	2	6	5049	5054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017421	CAT	2	6	5082	5087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017421	TAA	2	6	5088	5093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017421	AAT	2	6	5144	5149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017421	TGA	2	6	5170	5175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017421	AAG	2	6	5256	5261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017421	AGA	2	6	5331	5336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017421	CTT	2	6	5360	5365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017421	GAA	2	6	5387	5392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017421	CTT	2	6	5494	5499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017421	TCA	2	6	5573	5578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017421	AAT	2	6	5589	5594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017421	ATT	2	6	5632	5637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017421	ATT	2	6	5656	5661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017421	TTA	3	9	5699	5707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017421	CAT	2	6	5812	5817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017421	TAG	2	6	5882	5887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017421	AAT	2	6	6828	6833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017421	ATA	2	6	6894	6899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017421	TAA	2	6	6926	6931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017421	TAA	2	6	6940	6945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017421	TTA	2	6	7005	7010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017421	TAA	2	6	7024	7029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017421	AGA	2	6	7113	7118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017421	TGT	2	6	7119	7124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017421	TAA	2	6	7434	7439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017421	TAT	2	6	7456	7461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017421	TTA	2	6	7622	7627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017421	ATT	2	6	7638	7643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017421	GTA	2	6	7675	7680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017421	CAA	2	6	7960	7965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017421	ACA	2	6	7977	7982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017421	TAT	2	6	8014	8019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017421	TAA	2	6	8189	8194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017421	TTG	2	6	8408	8413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017421	ATA	2	6	8508	8513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017421	AAT	2	6	8551	8556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017421	TCA	2	6	8581	8586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017421	ATT	3	9	9164	9172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017421	TTC	2	6	9179	9184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017421	CTT	2	6	9240	9245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017421	TAG	2	6	9313	9318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017421	TAT	2	6	9387	9392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017421	ATA	2	6	9452	9457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017421	ATA	2	6	9476	9481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017421	ATT	2	6	9549	9554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017421	TAC	2	6	9627	9632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017421	TTA	2	6	9646	9651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017421	ATT	2	6	9724	9729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017421	CAT	2	6	9792	9797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017421	ATA	2	6	10784	10789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017421	ATT	2	6	10793	10798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017421	TAA	2	6	13756	13761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017421	TTA	3	9	13762	13770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017421	ATT	2	6	13818	13823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017421	GAT	2	6	13828	13833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017421	ATT	2	6	14313	14318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017421	TAA	2	6	14353	14358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017421	GTT	2	6	14437	14442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017421	AAT	2	6	14443	14448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017421	ATC	2	6	14458	14463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017421	TAT	2	6	14470	14475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017421	AAC	2	6	14490	14495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017421	ATT	2	6	14527	14532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017421	AGG	2	6	14533	14538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017421	TAA	2	6	14540	14545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017421	ACT	2	6	14755	14760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.