MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp38

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017421	TC	3	6	217	222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017421	TA	3	6	1026	1031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017421	AT	3	6	2103	2108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017421	TA	3	6	3403	3408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017421	AT	3	6	3743	3748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017421	AT	3	6	4439	4444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017421	AT	4	8	4477	4484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017421	TA	3	6	4534	4539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017421	AT	3	6	5470	5475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017421	CT	3	6	5510	5515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017421	AT	3	6	5549	5554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017421	TA	3	6	5724	5729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017421	TA	3	6	6961	6966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017421	AT	3	6	7519	7524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017421	TA	4	8	7689	7696	50 %	50 %	0 %	0 %	387827772
16	NC_017421	TA	3	6	8086	8091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017421	AT	3	6	8231	8236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017421	TA	3	6	8791	8796	50 %	50 %	0 %	0 %	387827773
19	NC_017421	AT	3	6	9395	9400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017421	TA	4	8	10693	10700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017421	TC	3	6	10863	10868	0 %	50 %	0 %	50 %	387827774
22	NC_017421	TA	3	6	10930	10935	50 %	50 %	0 %	0 %	387827774
23	NC_017421	TA	3	6	11191	11196	50 %	50 %	0 %	0 %	387827774
24	NC_017421	TA	3	6	11574	11579	50 %	50 %	0 %	0 %	387827775
25	NC_017421	TA	3	6	11594	11599	50 %	50 %	0 %	0 %	387827775
26	NC_017421	TA	3	6	12190	12195	50 %	50 %	0 %	0 %	387827776
27	NC_017421	AT	3	6	12605	12610	50 %	50 %	0 %	0 %	387827776
28	NC_017421	TA	4	8	13214	13221	50 %	50 %	0 %	0 %	387827777
29	NC_017421	TA	4	8	13236	13243	50 %	50 %	0 %	0 %	387827777
30	NC_017421	TA	4	8	13370	13377	50 %	50 %	0 %	0 %	387827777
31	NC_017421	TA	3	6	13595	13600	50 %	50 %	0 %	0 %	387827777
32	NC_017421	AT	3	6	13832	13837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017421	TA	3	6	14256	14261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017421	AT	3	6	14306	14311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017421	AT	3	6	14340	14345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017421	AT	3	6	14474	14479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017421	TA	3	6	14563	14568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017421	AT	3	6	15059	15064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017421	TA	3	6	15409	15414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017421	AT	3	6	15639	15644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017421	AT	3	6	16211	16216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017421	GT	3	6	16234	16239	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017421	GA	3	6	16812	16817	50 %	0 %	50 %	0 %	387827781
44	NC_017421	TA	5	10	16963	16972	50 %	50 %	0 %	0 %	387827781
45	NC_017421	AT	3	6	17456	17461	50 %	50 %	0 %	0 %	387827781
46	NC_017421	AT	3	6	17511	17516	50 %	50 %	0 %	0 %	387827781
47	NC_017421	TA	4	8	17745	17752	50 %	50 %	0 %	0 %	387827782
48	NC_017421	TG	3	6	17928	17933	0 %	50 %	50 %	0 %	387827782
49	NC_017421	TA	3	6	18201	18206	50 %	50 %	0 %	0 %	387827782
50	NC_017421	AT	3	6	20034	20039	50 %	50 %	0 %	0 %	387827784
51	NC_017421	GT	3	6	20289	20294	0 %	50 %	50 %	0 %	387827784
52	NC_017421	AT	3	6	20395	20400	50 %	50 %	0 %	0 %	387827785
53	NC_017421	AG	3	6	20411	20416	50 %	0 %	50 %	0 %	387827785
54	NC_017421	AG	3	6	21197	21202	50 %	0 %	50 %	0 %	387827785
55	NC_017421	CT	3	6	21250	21255	0 %	50 %	0 %	50 %	387827785
56	NC_017421	AT	3	6	21960	21965	50 %	50 %	0 %	0 %	387827786
57	NC_017421	TA	3	6	22227	22232	50 %	50 %	0 %	0 %	387827786
58	NC_017421	AT	3	6	23213	23218	50 %	50 %	0 %	0 %	387827787
59	NC_017421	AG	3	6	23561	23566	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017421	AT	3	6	23584	23589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017421	AT	3	6	24368	24373	50 %	50 %	0 %	0 %	387827788
62	NC_017421	TA	3	6	24396	24401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017421	TA	3	6	24419	24424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017421	CT	3	6	24754	24759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017421	AT	3	6	24919	24924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017421	AT	3	6	25211	25216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017421	AT	3	6	25278	25283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017421	TG	3	6	25472	25477	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017421	TA	3	6	25489	25494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017421	TC	3	6	26578	26583	0 %	50 %	0 %	50 %	387827789
71	NC_017421	TA	3	6	26756	26761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017421	AT	3	6	26766	26771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017421	AT	3	6	26872	26877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017421	AT	3	6	26903	26908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017421	AT	3	6	26910	26915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017421	CA	3	6	27311	27316	50 %	0 %	0 %	50 %	387827790
77	NC_017421	AT	3	6	28322	28327	50 %	50 %	0 %	0 %	387827790
78	NC_017421	AG	3	6	28425	28430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017421	TA	3	6	29393	29398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017421	TA	3	6	30004	30009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017421	AT	3	6	31249	31254	50 %	50 %	0 %	0 %	387827792
82	NC_017421	AG	3	6	31596	31601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017421	AT	3	6	31619	31624	50 %	50 %	0 %	0 %	387827793
84	NC_017421	AT	3	6	32403	32408	50 %	50 %	0 %	0 %	387827793
85	NC_017421	CT	3	6	32789	32794	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017421	AT	5	10	32991	33000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017421	TA	3	6	33015	33020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017421	TC	3	6	33042	33047	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017421	CA	3	6	33815	33820	50 %	0 %	0 %	50 %	387827794
90	NC_017421	TA	3	6	33900	33905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017421	TA	3	6	33997	34002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017421	TA	5	10	35494	35503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017421	AT	3	6	35735	35740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017421	AT	3	6	36415	36420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017421	TA	3	6	37793	37798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017421	AT	3	6	37811	37816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.