MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp25

Total Repeats: 147

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017420	TAT	2	6	427	432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827857
2	NC_017420	TAA	2	6	434	439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827857
3	NC_017420	TTA	2	6	457	462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827857
4	NC_017420	TCT	2	6	477	482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
5	NC_017420	TCT	2	6	531	536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
6	NC_017420	TCT	2	6	603	608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
7	NC_017420	TTA	2	6	627	632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827857
8	NC_017420	AAG	2	6	712	717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827857
9	NC_017420	TCT	2	6	827	832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
10	NC_017420	TGA	2	6	1131	1136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827857
11	NC_017420	ATT	2	6	1172	1177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827857
12	NC_017420	TTC	2	6	1289	1294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
13	NC_017420	ATT	2	6	1311	1316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827857
14	NC_017420	TAA	2	6	1417	1422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827857
15	NC_017420	TAT	2	6	1423	1428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827857
16	NC_017420	TTC	2	6	1472	1477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
17	NC_017420	CAC	3	9	1711	1719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387827857
18	NC_017420	GAT	2	6	1804	1809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827857
19	NC_017420	GGA	2	6	1926	1931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827857
20	NC_017420	TAG	2	6	1998	2003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827857
21	NC_017420	ATT	2	6	2163	2168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827857
22	NC_017420	TTC	2	6	2192	2197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
23	NC_017420	TCT	2	6	2232	2237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
24	NC_017420	TAG	2	6	2239	2244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827857
25	NC_017420	TCT	2	6	2277	2282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
26	NC_017420	ATG	2	6	2405	2410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827857
27	NC_017420	GTG	2	6	2425	2430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827857
28	NC_017420	CTT	2	6	2513	2518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
29	NC_017420	CAT	2	6	2566	2571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827857
30	NC_017420	TTC	2	6	2573	2578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
31	NC_017420	AAT	2	6	2668	2673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827857
32	NC_017420	TTC	2	6	2756	2761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
33	NC_017420	ATC	2	6	2792	2797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827857
34	NC_017420	CTT	2	6	2905	2910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
35	NC_017420	AAT	2	6	2939	2944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827857
36	NC_017420	AGT	2	6	2954	2959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827857
37	NC_017420	AGA	2	6	3073	3078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827857
38	NC_017420	TTC	2	6	3095	3100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
39	NC_017420	ATT	2	6	3128	3133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827857
40	NC_017420	TCT	2	6	3150	3155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
41	NC_017420	TCC	2	6	3164	3169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387827857
42	NC_017420	TTA	2	6	3226	3231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827857
43	NC_017420	TCA	2	6	3264	3269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827857
44	NC_017420	AGA	2	6	3293	3298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827857
45	NC_017420	TCT	2	6	3315	3320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
46	NC_017420	TTC	2	6	3392	3397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
47	NC_017420	TAT	2	6	3575	3580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827857
48	NC_017420	CTT	2	6	3585	3590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
49	NC_017420	TTC	2	6	3653	3658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
50	NC_017420	TTC	2	6	3662	3667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
51	NC_017420	ATA	2	6	3764	3769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827857
52	NC_017420	TCT	2	6	3804	3809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
53	NC_017420	CTT	2	6	3811	3816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
54	NC_017420	ATT	2	6	3899	3904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827857
55	NC_017420	CTT	2	6	3913	3918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
56	NC_017420	TAT	2	6	3925	3930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827857
57	NC_017420	TGT	2	6	4011	4016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827857
58	NC_017420	AAT	2	6	4024	4029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827857
59	NC_017420	TTC	2	6	4034	4039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
60	NC_017420	GTC	2	6	4085	4090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827857
61	NC_017420	ATT	2	6	6720	6725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827858
62	NC_017420	CCA	2	6	6745	6750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387827858
63	NC_017420	ATA	2	6	6827	6832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827858
64	NC_017420	TAA	2	6	6852	6857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827858
65	NC_017420	AAG	2	6	6902	6907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827858
66	NC_017420	TAA	2	6	7080	7085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827858
67	NC_017420	AAG	2	6	7124	7129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827858
68	NC_017420	ATA	2	6	7144	7149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827858
69	NC_017420	ATT	2	6	7340	7345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827858
70	NC_017420	ATG	2	6	7463	7468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827858
71	NC_017420	TGA	2	6	7530	7535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827858
72	NC_017420	TGC	2	6	9589	9594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827859
73	NC_017420	ATT	2	6	9612	9617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827859
74	NC_017420	ATC	2	6	9763	9768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827859
75	NC_017420	AAC	2	6	9867	9872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827859
76	NC_017420	CAA	2	6	9890	9895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827859
77	NC_017420	TAT	2	6	9899	9904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827859
78	NC_017420	ATA	2	6	9907	9912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827859
79	NC_017420	TTA	2	6	10087	10092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827860
80	NC_017420	TCA	2	6	10099	10104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827860
81	NC_017420	TCT	2	6	10135	10140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827860
82	NC_017420	AAT	2	6	10202	10207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827860
83	NC_017420	AAC	2	6	10431	10436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827860
84	NC_017420	TTC	2	6	10437	10442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827860
85	NC_017420	TAA	2	6	10479	10484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827860
86	NC_017420	TAA	2	6	10491	10496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827860
87	NC_017420	TAT	2	6	10497	10502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827860
88	NC_017420	TTC	2	6	11351	11356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827861
89	NC_017420	TCT	2	6	11427	11432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827861
90	NC_017420	CTT	2	6	11566	11571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827861
91	NC_017420	ATT	2	6	11745	11750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827861
92	NC_017420	TCA	2	6	11790	11795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827861
93	NC_017420	ATC	2	6	12048	12053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827862
94	NC_017420	TTA	2	6	12059	12064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827862
95	NC_017420	GTT	2	6	12087	12092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827862
96	NC_017420	TAA	2	6	12159	12164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827862
97	NC_017420	ATT	2	6	12205	12210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827862
98	NC_017420	AAT	2	6	12243	12248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827862
99	NC_017420	TAT	3	9	12270	12278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827862
100	NC_017420	TAA	2	6	12297	12302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827862
101	NC_017420	ATT	2	6	12393	12398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827862
102	NC_017420	GAA	2	6	12415	12420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827862
103	NC_017420	TTC	2	6	12483	12488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827862
104	NC_017420	AGA	2	6	12541	12546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827862
105	NC_017420	CCT	2	6	12607	12612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387827862
106	NC_017420	TCC	2	6	12668	12673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387827863
107	NC_017420	CTT	2	6	12792	12797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827863
108	NC_017420	AAT	2	6	12999	13004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827863
109	NC_017420	ATT	2	6	13149	13154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827863
110	NC_017420	ATT	2	6	13274	13279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827864
111	NC_017420	TGT	2	6	13346	13351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827864
112	NC_017420	TTA	2	6	13434	13439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827864
113	NC_017420	CTT	2	6	13573	13578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827864
114	NC_017420	TTA	2	6	13579	13584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827864
115	NC_017420	ATA	2	6	13676	13681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827864
116	NC_017420	TTG	2	6	13714	13719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827864
117	NC_017420	TAA	3	9	13741	13749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827864
118	NC_017420	TTA	2	6	13806	13811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827864
119	NC_017420	TAT	2	6	13855	13860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827864
120	NC_017420	TAG	2	6	13970	13975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827864
121	NC_017420	TAG	2	6	14010	14015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827864
122	NC_017420	TAG	2	6	14049	14054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827864
123	NC_017420	AGT	2	6	14089	14094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827864
124	NC_017420	CTT	2	6	14116	14121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827864
125	NC_017420	TTA	2	6	14193	14198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827864
126	NC_017420	TTA	2	6	14265	14270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827864
127	NC_017420	CCT	2	6	14284	14289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387827864
128	NC_017420	ATA	2	6	14321	14326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827864
129	NC_017420	ATT	2	6	14923	14928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827865
130	NC_017420	CTT	2	6	14950	14955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827865
131	NC_017420	TTA	2	6	14966	14971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827865
132	NC_017420	ATC	2	6	15114	15119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827865
133	NC_017420	TGG	2	6	15302	15307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827865
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135	NC_017420	AAT	2	6	15323	15328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827865
136	NC_017420	TTG	2	6	21857	21862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827866
137	NC_017420	ATC	2	6	21948	21953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827866
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.