MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp28-2

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017419	AGATA	2	10	798	807	60 %	20 %	20 %	0 %	387827739
2	NC_017419	TAAAT	2	10	1210	1219	60 %	40 %	0 %	0 %	387827740
3	NC_017419	AAAAC	2	10	1828	1837	80 %	0 %	0 %	20 %	387827740
4	NC_017419	ACTAT	2	10	1932	1941	40 %	40 %	0 %	20 %	387827740
5	NC_017419	ACTTA	2	10	1968	1977	40 %	40 %	0 %	20 %	387827740
6	NC_017419	TCTTT	2	10	3431	3440	0 %	80 %	0 %	20 %	387827742
7	NC_017419	ATATT	2	10	4212	4221	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017419	CACTA	2	10	4582	4591	40 %	20 %	0 %	40 %	387827743
9	NC_017419	AAACC	2	10	5187	5196	60 %	0 %	0 %	40 %	387827743
10	NC_017419	ATAGA	2	10	6988	6997	60 %	20 %	20 %	0 %	387827746
11	NC_017419	AAATA	2	10	7010	7019	80 %	20 %	0 %	0 %	387827746
12	NC_017419	ATTTT	2	10	7093	7102	20 %	80 %	0 %	0 %	387827746
13	NC_017419	TTTTC	2	10	8305	8314	0 %	80 %	0 %	20 %	387827747
14	NC_017419	ACTTC	2	10	8362	8371	20 %	40 %	0 %	40 %	387827747
15	NC_017419	ATATC	2	10	9590	9599	40 %	40 %	0 %	20 %	387827747
16	NC_017419	GAATT	2	10	11386	11395	40 %	40 %	20 %	0 %	387827748
17	NC_017419	CTGTA	2	10	14218	14227	20 %	40 %	20 %	20 %	387827753
18	NC_017419	AAATT	2	10	15585	15594	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017419	TTCAT	2	10	15616	15625	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017419	TGGTG	2	10	16548	16557	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017419	CAAGC	2	10	17229	17238	40 %	0 %	20 %	40 %	387827755
22	NC_017419	TTGAT	2	10	17311	17320	20 %	60 %	20 %	0 %	387827755
23	NC_017419	TGCTT	2	10	17560	17569	0 %	60 %	20 %	20 %	387827755
24	NC_017419	TATTT	2	10	18862	18871	20 %	80 %	0 %	0 %	387827757
25	NC_017419	TTCGG	2	10	19132	19141	0 %	40 %	40 %	20 %	387827758
26	NC_017419	AATGC	2	10	20217	20226	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017419	ACATA	2	10	21583	21592	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017419	TAGTT	2	10	21815	21824	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017419	TCGGT	2	10	22433	22442	0 %	40 %	40 %	20 %	387827759
30	NC_017419	TTTAT	2	10	26694	26703	20 %	80 %	0 %	0 %	387827765
31	NC_017419	CTTTA	2	10	28843	28852	20 %	60 %	0 %	20 %	387827768

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.