MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp28-2

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017419	GTTT	2	8	269	276	0 %	75 %	25 %	0 %	387827739
2	NC_017419	TAAT	2	8	476	483	50 %	50 %	0 %	0 %	387827739
3	NC_017419	AATT	2	8	674	681	50 %	50 %	0 %	0 %	387827739
4	NC_017419	TGAT	2	8	872	879	25 %	50 %	25 %	0 %	387827739
5	NC_017419	CTTT	2	8	908	915	0 %	75 %	0 %	25 %	387827739
6	NC_017419	AAGA	2	8	1083	1090	75 %	0 %	25 %	0 %	387827739
7	NC_017419	AAAT	2	8	1194	1201	75 %	25 %	0 %	0 %	387827740
8	NC_017419	AAAT	2	8	1546	1553	75 %	25 %	0 %	0 %	387827740
9	NC_017419	ATAA	2	8	2178	2185	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017419	TCTA	2	8	3241	3248	25 %	50 %	0 %	25 %	387827742
11	NC_017419	AATA	2	8	3560	3567	75 %	25 %	0 %	0 %	387827742
12	NC_017419	TCTT	2	8	4073	4080	0 %	75 %	0 %	25 %	387827742
13	NC_017419	CATA	2	8	4494	4501	50 %	25 %	0 %	25 %	387827743
14	NC_017419	ATCA	2	8	4730	4737	50 %	25 %	0 %	25 %	387827743
15	NC_017419	AAGA	3	12	4866	4877	75 %	0 %	25 %	0 %	387827743
16	NC_017419	GAAA	2	8	5267	5274	75 %	0 %	25 %	0 %	387827743
17	NC_017419	AAAT	2	8	5404	5411	75 %	25 %	0 %	0 %	387827743
18	NC_017419	AATC	2	8	5708	5715	50 %	25 %	0 %	25 %	387827744
19	NC_017419	ATTT	2	8	5733	5740	25 %	75 %	0 %	0 %	387827744
20	NC_017419	AATT	2	8	6242	6249	50 %	50 %	0 %	0 %	387827745
21	NC_017419	TTTA	2	8	7214	7221	25 %	75 %	0 %	0 %	387827746
22	NC_017419	CTAA	2	8	7669	7676	50 %	25 %	0 %	25 %	387827747
23	NC_017419	TTCG	2	8	8078	8085	0 %	50 %	25 %	25 %	387827747
24	NC_017419	GTTT	2	8	8102	8109	0 %	75 %	25 %	0 %	387827747
25	NC_017419	CAAA	2	8	8455	8462	75 %	0 %	0 %	25 %	387827747
26	NC_017419	CTTT	2	8	8887	8894	0 %	75 %	0 %	25 %	387827747
27	NC_017419	GATC	2	8	8968	8975	25 %	25 %	25 %	25 %	387827747
28	NC_017419	CTTT	2	8	9175	9182	0 %	75 %	0 %	25 %	387827747
29	NC_017419	TTTA	2	8	10053	10060	25 %	75 %	0 %	0 %	387827747
30	NC_017419	TCGC	2	8	10084	10091	0 %	25 %	25 %	50 %	387827747
31	NC_017419	TACA	2	8	10170	10177	50 %	25 %	0 %	25 %	387827747
32	NC_017419	TTTG	2	8	10587	10594	0 %	75 %	25 %	0 %	387827747
33	NC_017419	GTTC	2	8	10960	10967	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017419	AAAC	2	8	10975	10982	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017419	AATT	2	8	11244	11251	50 %	50 %	0 %	0 %	387827748
36	NC_017419	ATTA	2	8	11617	11624	50 %	50 %	0 %	0 %	387827748
37	NC_017419	AATC	2	8	12234	12241	50 %	25 %	0 %	25 %	387827749
38	NC_017419	AAGT	2	8	12834	12841	50 %	25 %	25 %	0 %	387827750
39	NC_017419	AATT	2	8	13116	13123	50 %	50 %	0 %	0 %	387827751
40	NC_017419	AAAG	2	8	13305	13312	75 %	0 %	25 %	0 %	387827752
41	NC_017419	TAAA	2	8	13414	13421	75 %	25 %	0 %	0 %	387827752
42	NC_017419	TTTG	2	8	13523	13530	0 %	75 %	25 %	0 %	387827752
43	NC_017419	AACA	2	8	13786	13793	75 %	0 %	0 %	25 %	387827753
44	NC_017419	GCTT	2	8	14449	14456	0 %	50 %	25 %	25 %	387827753
45	NC_017419	ATCT	2	8	15043	15050	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017419	ATTT	2	8	15553	15560	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017419	TTTC	2	8	15659	15666	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017419	TTAA	2	8	15670	15677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017419	AATG	2	8	15807	15814	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017419	GTTT	2	8	16785	16792	0 %	75 %	25 %	0 %	387827755
51	NC_017419	GCAA	2	8	16853	16860	50 %	0 %	25 %	25 %	387827755
52	NC_017419	ATTG	2	8	17627	17634	25 %	50 %	25 %	0 %	387827755
53	NC_017419	TTTC	2	8	17693	17700	0 %	75 %	0 %	25 %	387827755
54	NC_017419	AAAG	2	8	18100	18107	75 %	0 %	25 %	0 %	387827756
55	NC_017419	TATC	2	8	18408	18415	25 %	50 %	0 %	25 %	387827757
56	NC_017419	TTTG	2	8	18586	18593	0 %	75 %	25 %	0 %	387827757
57	NC_017419	TACC	2	8	18955	18962	25 %	25 %	0 %	50 %	387827758
58	NC_017419	CTTC	2	8	19016	19023	0 %	50 %	0 %	50 %	387827758
59	NC_017419	CTAT	2	8	19052	19059	25 %	50 %	0 %	25 %	387827758
60	NC_017419	TCCT	2	8	19423	19430	0 %	50 %	0 %	50 %	387827758
61	NC_017419	ATTA	2	8	20119	20126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017419	ATTG	2	8	21467	21474	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017419	ATTG	2	8	21899	21906	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017419	TGCT	2	8	22135	22142	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017419	TTGT	2	8	22669	22676	0 %	75 %	25 %	0 %	387827759
66	NC_017419	GGTT	2	8	22680	22687	0 %	50 %	50 %	0 %	387827759
67	NC_017419	AAGA	2	8	22715	22722	75 %	0 %	25 %	0 %	387827759
68	NC_017419	TTAC	2	8	23519	23526	25 %	50 %	0 %	25 %	387827761
69	NC_017419	AATC	2	8	23544	23551	50 %	25 %	0 %	25 %	387827761
70	NC_017419	AATA	2	8	23608	23615	75 %	25 %	0 %	0 %	387827761
71	NC_017419	AGAT	2	8	24152	24159	50 %	25 %	25 %	0 %	387827762
72	NC_017419	TAAA	2	8	24279	24286	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017419	CTAG	2	8	24294	24301	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017419	TGCA	2	8	24524	24531	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017419	TGAT	2	8	24779	24786	25 %	50 %	25 %	0 %	387827763
76	NC_017419	ACGG	2	8	25690	25697	25 %	0 %	50 %	25 %	387827763
77	NC_017419	GGAA	2	8	25724	25731	50 %	0 %	50 %	0 %	387827763
78	NC_017419	GATA	2	8	27073	27080	50 %	25 %	25 %	0 %	387827765
79	NC_017419	ATCA	2	8	27083	27090	50 %	25 %	0 %	25 %	387827765
80	NC_017419	TAAA	2	8	27500	27507	75 %	25 %	0 %	0 %	387827766
81	NC_017419	ACAT	2	8	27587	27594	50 %	25 %	0 %	25 %	387827766
82	NC_017419	ATTA	2	8	28803	28810	50 %	50 %	0 %	0 %	387827767
83	NC_017419	TTGA	2	8	29060	29067	25 %	50 %	25 %	0 %	387827768
84	NC_017419	TAAT	2	8	29268	29275	50 %	50 %	0 %	0 %	387827768

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.