MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp28-2

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017419	TA	3	6	183	188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017419	TA	3	6	278	283	50 %	50 %	0 %	0 %	387827739
3	NC_017419	TA	3	6	410	415	50 %	50 %	0 %	0 %	387827739
4	NC_017419	AG	3	6	963	968	50 %	0 %	50 %	0 %	387827739
5	NC_017419	TA	3	6	1493	1498	50 %	50 %	0 %	0 %	387827740
6	NC_017419	GA	3	6	1520	1525	50 %	0 %	50 %	0 %	387827740
7	NC_017419	CT	3	6	2807	2812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017419	TA	3	6	3814	3819	50 %	50 %	0 %	0 %	387827742
9	NC_017419	AT	3	6	4159	4164	50 %	50 %	0 %	0 %	387827742
10	NC_017419	TA	4	8	4384	4391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017419	TA	3	6	5172	5177	50 %	50 %	0 %	0 %	387827743
12	NC_017419	AT	3	6	5618	5623	50 %	50 %	0 %	0 %	387827744
13	NC_017419	CA	3	6	5624	5629	50 %	0 %	0 %	50 %	387827744
14	NC_017419	TA	3	6	6410	6415	50 %	50 %	0 %	0 %	387827745
15	NC_017419	AG	3	6	6856	6861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017419	TA	3	6	7447	7452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017419	TA	3	6	7565	7570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017419	AT	3	6	7879	7884	50 %	50 %	0 %	0 %	387827747
19	NC_017419	TA	3	6	10097	10102	50 %	50 %	0 %	0 %	387827747
20	NC_017419	TC	3	6	10284	10289	0 %	50 %	0 %	50 %	387827747
21	NC_017419	TA	3	6	11929	11934	50 %	50 %	0 %	0 %	387827749
22	NC_017419	GA	3	6	13350	13355	50 %	0 %	50 %	0 %	387827752
23	NC_017419	AT	3	6	14427	14432	50 %	50 %	0 %	0 %	387827753
24	NC_017419	TC	3	6	16012	16017	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017419	GT	3	6	16177	16182	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017419	TG	3	6	16342	16347	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017419	CA	4	8	17118	17125	50 %	0 %	0 %	50 %	387827755
28	NC_017419	AC	3	6	17293	17298	50 %	0 %	0 %	50 %	387827755
29	NC_017419	TC	3	6	17390	17395	0 %	50 %	0 %	50 %	387827755
30	NC_017419	AT	3	6	18192	18197	50 %	50 %	0 %	0 %	387827757
31	NC_017419	TG	3	6	18446	18451	0 %	50 %	50 %	0 %	387827757
32	NC_017419	AT	3	6	19156	19161	50 %	50 %	0 %	0 %	387827758
33	NC_017419	TG	3	6	19985	19990	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017419	TG	3	6	20351	20356	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017419	GT	3	6	20961	20966	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017419	AT	3	6	21141	21146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017419	TC	3	6	21534	21539	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017419	AT	3	6	24436	24441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017419	AT	3	6	24588	24593	50 %	50 %	0 %	0 %	387827763
40	NC_017419	TA	3	6	25006	25011	50 %	50 %	0 %	0 %	387827763
41	NC_017419	TA	3	6	25427	25432	50 %	50 %	0 %	0 %	387827763
42	NC_017419	TA	3	6	25571	25576	50 %	50 %	0 %	0 %	387827763
43	NC_017419	GA	3	6	25930	25935	50 %	0 %	50 %	0 %	387827763
44	NC_017419	AT	3	6	26325	26330	50 %	50 %	0 %	0 %	387827764
45	NC_017419	AG	3	6	26719	26724	50 %	0 %	50 %	0 %	387827765
46	NC_017419	GT	3	6	26907	26912	0 %	50 %	50 %	0 %	387827765
47	NC_017419	AG	3	6	27879	27884	50 %	0 %	50 %	0 %	387827766
48	NC_017419	AT	3	6	28156	28161	50 %	50 %	0 %	0 %	387827767
49	NC_017419	AT	3	6	28367	28372	50 %	50 %	0 %	0 %	387827767

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.