MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 chromosome

Total Repeats: 1021

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017418	GCTTT	2	10	2057	2066	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017418	AATCA	2	10	2392	2401	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017418	ACTAT	2	10	3115	3124	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017418	ATTGG	2	10	3389	3398	20 %	40 %	40 %	0 %	387826930
5	NC_017418	AAAGA	2	10	3865	3874	80 %	0 %	20 %	0 %	387826930
6	NC_017418	TAGAG	2	10	4321	4330	40 %	20 %	40 %	0 %	387826930
7	NC_017418	GTAAT	2	10	4587	4596	40 %	40 %	20 %	0 %	387826930
8	NC_017418	ATTCC	2	10	5078	5087	20 %	40 %	0 %	40 %	387826931
9	NC_017418	ATTTT	2	10	5498	5507	20 %	80 %	0 %	0 %	387826931
10	NC_017418	GTATT	2	10	5916	5925	20 %	60 %	20 %	0 %	387826931
11	NC_017418	AAATC	2	10	6093	6102	60 %	20 %	0 %	20 %	387826931
12	NC_017418	ACAAT	2	10	7114	7123	60 %	20 %	0 %	20 %	387826932
13	NC_017418	CCCTT	2	10	7881	7890	0 %	40 %	0 %	60 %	387826933
14	NC_017418	ATTAT	2	10	7933	7942	40 %	60 %	0 %	0 %	387826933
15	NC_017418	AAAAT	2	10	9758	9767	80 %	20 %	0 %	0 %	387826935
16	NC_017418	TTAAA	2	10	10096	10105	60 %	40 %	0 %	0 %	387826936
17	NC_017418	ATAAA	2	10	10189	10198	80 %	20 %	0 %	0 %	387826936
18	NC_017418	AATTC	2	10	10599	10608	40 %	40 %	0 %	20 %	387826937
19	NC_017418	CAAAA	2	10	10632	10641	80 %	0 %	0 %	20 %	387826937
20	NC_017418	AAAAG	2	10	11126	11135	80 %	0 %	20 %	0 %	387826937
21	NC_017418	TTCAT	2	10	11501	11510	20 %	60 %	0 %	20 %	387826938
22	NC_017418	ACTTA	2	10	12306	12315	40 %	40 %	0 %	20 %	387826939
23	NC_017418	CAAAT	2	10	12458	12467	60 %	20 %	0 %	20 %	387826939
24	NC_017418	TAAAA	2	10	12727	12736	80 %	20 %	0 %	0 %	387826940
25	NC_017418	AACAT	2	10	12777	12786	60 %	20 %	0 %	20 %	387826940
26	NC_017418	AATAT	2	10	14390	14399	60 %	40 %	0 %	0 %	387826940
27	NC_017418	AAAAG	2	10	14446	14455	80 %	0 %	20 %	0 %	387826940
28	NC_017418	AAAAT	2	10	16017	16026	80 %	20 %	0 %	0 %	387826943
29	NC_017418	ATGAT	2	10	16035	16044	40 %	40 %	20 %	0 %	387826943
30	NC_017418	ATCTA	2	10	17143	17152	40 %	40 %	0 %	20 %	387826944
31	NC_017418	TATCA	2	10	17569	17578	40 %	40 %	0 %	20 %	387826944
32	NC_017418	AAAGA	2	10	17884	17893	80 %	0 %	20 %	0 %	387826945
33	NC_017418	CAATC	2	10	18338	18347	40 %	20 %	0 %	40 %	387826946
34	NC_017418	TAAAC	2	10	19672	19681	60 %	20 %	0 %	20 %	387826946
35	NC_017418	TAAAT	2	10	19804	19813	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017418	AATTA	2	10	22371	22380	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017418	ACAAT	2	10	22584	22593	60 %	20 %	0 %	20 %	387826949
38	NC_017418	AAATA	2	10	23551	23560	80 %	20 %	0 %	0 %	387826949
39	NC_017418	ATTTT	2	10	23709	23718	20 %	80 %	0 %	0 %	387826950
40	NC_017418	AAAAT	2	10	28539	28548	80 %	20 %	0 %	0 %	387826956
41	NC_017418	TAACC	2	10	29101	29110	40 %	20 %	0 %	40 %	387826956
42	NC_017418	TTAAA	2	10	29215	29224	60 %	40 %	0 %	0 %	387826957
43	NC_017418	AAATA	2	10	31092	31101	80 %	20 %	0 %	0 %	387826958
44	NC_017418	CAAAA	2	10	31692	31701	80 %	0 %	0 %	20 %	387826959
45	NC_017418	TGTCT	2	10	32116	32125	0 %	60 %	20 %	20 %	387826960
46	NC_017418	TTTGA	2	10	32288	32297	20 %	60 %	20 %	0 %	387826960
47	NC_017418	TCACT	2	10	32835	32844	20 %	40 %	0 %	40 %	387826960
48	NC_017418	ATTTC	2	10	35275	35284	20 %	60 %	0 %	20 %	387826961
49	NC_017418	TAAAT	2	10	35482	35491	60 %	40 %	0 %	0 %	387826962
50	NC_017418	AATAA	2	10	36547	36556	80 %	20 %	0 %	0 %	387826963
51	NC_017418	GCAAA	2	10	37785	37794	60 %	0 %	20 %	20 %	387826964
52	NC_017418	TAAGC	2	10	38113	38122	40 %	20 %	20 %	20 %	387826964
53	NC_017418	TAAGT	2	10	40391	40400	40 %	40 %	20 %	0 %	387826966
54	NC_017418	TATCA	2	10	41056	41065	40 %	40 %	0 %	20 %	387826966
55	NC_017418	ATCTT	2	10	41098	41107	20 %	60 %	0 %	20 %	387826967
56	NC_017418	AATTT	2	10	41823	41832	40 %	60 %	0 %	0 %	387826967
57	NC_017418	AAACT	2	10	42488	42497	60 %	20 %	0 %	20 %	387826968
58	NC_017418	GATTT	2	10	43621	43630	20 %	60 %	20 %	0 %	387826969
59	NC_017418	TCTTT	2	10	43945	43954	0 %	80 %	0 %	20 %	387826969
60	NC_017418	AAATT	2	10	45339	45348	60 %	40 %	0 %	0 %	387826970
61	NC_017418	AATAC	2	10	48095	48104	60 %	20 %	0 %	20 %	387826974
62	NC_017418	ACTAT	2	10	48563	48572	40 %	40 %	0 %	20 %	387826975
63	NC_017418	AAATT	2	10	48894	48903	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017418	TAAAT	2	10	50978	50987	60 %	40 %	0 %	0 %	387826979
65	NC_017418	GAATT	2	10	51229	51238	40 %	40 %	20 %	0 %	387826979
66	NC_017418	TCCTA	2	10	55754	55763	20 %	40 %	0 %	40 %	387826982
67	NC_017418	AATTA	2	10	56437	56446	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017418	ATTTT	2	10	59006	59015	20 %	80 %	0 %	0 %	387826987
69	NC_017418	TTAAA	2	10	59031	59040	60 %	40 %	0 %	0 %	387826987
70	NC_017418	ATTTT	2	10	59974	59983	20 %	80 %	0 %	0 %	387826988
71	NC_017418	TTATT	2	10	60196	60205	20 %	80 %	0 %	0 %	387826989
72	NC_017418	ATTCA	2	10	61272	61281	40 %	40 %	0 %	20 %	387826990
73	NC_017418	AATAA	2	10	62021	62030	80 %	20 %	0 %	0 %	387826990
74	NC_017418	GATTT	2	10	62140	62149	20 %	60 %	20 %	0 %	387826990
75	NC_017418	CATTA	2	10	62972	62981	40 %	40 %	0 %	20 %	387826991
76	NC_017418	GTCTT	2	10	64954	64963	0 %	60 %	20 %	20 %	387826993
77	NC_017418	ACAAA	2	10	65799	65808	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017418	CTTTT	2	10	66755	66764	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017418	AATAA	2	10	67827	67836	80 %	20 %	0 %	0 %	387826994
80	NC_017418	TTTAT	2	10	69704	69713	20 %	80 %	0 %	0 %	387826995
81	NC_017418	ATAAA	2	10	69976	69985	80 %	20 %	0 %	0 %	387826996
82	NC_017418	AAAAG	2	10	71143	71152	80 %	0 %	20 %	0 %	387826997
83	NC_017418	CTATT	2	10	71671	71680	20 %	60 %	0 %	20 %	387826997
84	NC_017418	TGATA	2	10	73890	73899	40 %	40 %	20 %	0 %	387826999
85	NC_017418	TAAAA	2	10	74679	74688	80 %	20 %	0 %	0 %	387827000
86	NC_017418	AAAAT	2	10	74759	74768	80 %	20 %	0 %	0 %	387827000
87	NC_017418	TAATA	2	10	75892	75901	60 %	40 %	0 %	0 %	387827001
88	NC_017418	TCAAA	3	15	76516	76530	60 %	20 %	0 %	20 %	387827002
89	NC_017418	ATTCT	2	10	78206	78215	20 %	60 %	0 %	20 %	387827003
90	NC_017418	TAAAC	2	10	78361	78370	60 %	20 %	0 %	20 %	387827003
91	NC_017418	CAATC	2	10	79332	79341	40 %	20 %	0 %	40 %	387827005
92	NC_017418	ATTTT	2	10	80058	80067	20 %	80 %	0 %	0 %	387827005
93	NC_017418	AAAAT	2	10	80585	80594	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017418	AAGTA	2	10	80639	80648	60 %	20 %	20 %	0 %	387827006
95	NC_017418	ATTTA	2	10	80750	80759	40 %	60 %	0 %	0 %	387827006
96	NC_017418	CAAAG	2	10	80828	80837	60 %	0 %	20 %	20 %	387827006
97	NC_017418	ATTAT	2	10	81582	81591	40 %	60 %	0 %	0 %	387827007
98	NC_017418	TGATT	2	10	82387	82396	20 %	60 %	20 %	0 %	387827007
99	NC_017418	ATTAA	2	10	83548	83557	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017418	AATAA	2	10	84304	84313	80 %	20 %	0 %	0 %	387827009
101	NC_017418	TAAAT	2	10	84373	84382	60 %	40 %	0 %	0 %	387827009
102	NC_017418	TCTTT	2	10	84713	84722	0 %	80 %	0 %	20 %	387827009
103	NC_017418	GCAAA	2	10	86441	86450	60 %	0 %	20 %	20 %	387827010
104	NC_017418	CTTTT	2	10	87528	87537	0 %	80 %	0 %	20 %	387827012
105	NC_017418	ACCAA	2	10	87693	87702	60 %	0 %	0 %	40 %	387827012
106	NC_017418	CTTTT	2	10	87971	87980	0 %	80 %	0 %	20 %	387827012
107	NC_017418	ATCTC	2	10	88174	88183	20 %	40 %	0 %	40 %	387827012
108	NC_017418	AAATT	2	10	88285	88294	60 %	40 %	0 %	0 %	387827012
109	NC_017418	TTAAT	2	10	89410	89419	40 %	60 %	0 %	0 %	387827013
110	NC_017418	GGCAT	2	10	93461	93470	20 %	20 %	40 %	20 %	387827017
111	NC_017418	ATAAA	2	10	93723	93732	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017418	TTAAA	2	10	94226	94235	60 %	40 %	0 %	0 %	387827019
113	NC_017418	TAATA	2	10	94387	94396	60 %	40 %	0 %	0 %	387827019
114	NC_017418	TTCAA	2	10	96116	96125	40 %	40 %	0 %	20 %	387827019
115	NC_017418	AATGA	2	10	96820	96829	60 %	20 %	20 %	0 %	387827020
116	NC_017418	AATCA	2	10	97861	97870	60 %	20 %	0 %	20 %	387827021
117	NC_017418	ATTTA	2	10	98005	98014	40 %	60 %	0 %	0 %	387827021
118	NC_017418	AAAGT	2	10	98292	98301	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017418	AAAAG	2	10	98761	98770	80 %	0 %	20 %	0 %	387827022
120	NC_017418	CACGC	2	10	99145	99154	20 %	0 %	20 %	60 %	387827022
121	NC_017418	GGCTC	2	10	99702	99711	0 %	20 %	40 %	40 %	387827022
122	NC_017418	ATAAA	2	10	101052	101061	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017418	CCAAG	2	10	101724	101733	40 %	0 %	20 %	40 %	387827025
124	NC_017418	ACCCA	2	10	101804	101813	40 %	0 %	0 %	60 %	387827025
125	NC_017418	ATCAA	2	10	103257	103266	60 %	20 %	0 %	20 %	387827026
126	NC_017418	TTAGT	2	10	103378	103387	20 %	60 %	20 %	0 %	387827026
127	NC_017418	GCATT	2	10	104456	104465	20 %	40 %	20 %	20 %	387827027
128	NC_017418	AAGCA	2	10	105070	105079	60 %	0 %	20 %	20 %	387827028
129	NC_017418	TTTTA	2	10	105501	105510	20 %	80 %	0 %	0 %	387827029
130	NC_017418	CATAA	2	10	106511	106520	60 %	20 %	0 %	20 %	387827029
131	NC_017418	AATCT	2	10	107401	107410	40 %	40 %	0 %	20 %	387827030
132	NC_017418	ATTAC	2	10	107623	107632	40 %	40 %	0 %	20 %	387827030
133	NC_017418	TACAA	2	10	107826	107835	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017418	CTTAT	2	10	108486	108495	20 %	60 %	0 %	20 %	387827031
135	NC_017418	ATCAA	2	10	108587	108596	60 %	20 %	0 %	20 %	387827031
136	NC_017418	TATCT	2	10	110566	110575	20 %	60 %	0 %	20 %	387827032
137	NC_017418	TAATA	2	10	112705	112714	60 %	40 %	0 %	0 %	387827037
138	NC_017418	AATAA	2	10	113891	113900	80 %	20 %	0 %	0 %	387827037
139	NC_017418	CAATA	2	10	115363	115372	60 %	20 %	0 %	20 %	387827039
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