MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 chromosome

Total Repeats: 12973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017418	CAA	2	6	124	129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017418	ACT	2	6	258	263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017418	AAC	2	6	278	283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017418	TTC	2	6	304	309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017418	TAA	2	6	347	352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017418	CTT	2	6	379	384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017418	GTT	2	6	470	475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017418	ATT	2	6	496	501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017418	CTT	2	6	620	625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826929
10	NC_017418	TCA	2	6	654	659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826929
11	NC_017418	ATA	2	6	761	766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826929
12	NC_017418	AGC	2	6	772	777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826929
13	NC_017418	ATT	2	6	802	807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826929
14	NC_017418	GTT	2	6	866	871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826929
15	NC_017418	TCC	2	6	973	978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387826929
16	NC_017418	CTA	2	6	1178	1183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826929
17	NC_017418	TCA	2	6	1199	1204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826929
18	NC_017418	ATC	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826929
19	NC_017418	ACA	2	6	1668	1673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017418	TAA	2	6	1715	1720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017418	TCT	2	6	1740	1745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017418	AAT	2	6	1765	1770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017418	TAT	2	6	1873	1878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017418	TCA	2	6	1880	1885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017418	ACA	2	6	1935	1940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017418	GAA	2	6	1979	1984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017418	AGA	2	6	2086	2091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017418	TAT	2	6	2271	2276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017418	TCT	2	6	2357	2362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017418	TTG	2	6	2703	2708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017418	ACC	2	6	2713	2718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_017418	AAG	2	6	2778	2783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017418	TAA	2	6	2792	2797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017418	CTT	2	6	2802	2807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017418	ATC	2	6	2896	2901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017418	ATT	2	6	2959	2964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017418	TTA	2	6	3067	3072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017418	TAA	2	6	3101	3106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017418	ATT	2	6	3127	3132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017418	AAT	2	6	3133	3138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017418	AAT	2	6	3145	3150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017418	GAA	2	6	3170	3175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017418	TGA	2	6	3229	3234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826930
44	NC_017418	GAT	2	6	3235	3240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826930
45	NC_017418	TAA	2	6	3339	3344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826930
46	NC_017418	ATT	2	6	3360	3365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826930
47	NC_017418	ATT	2	6	3425	3430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826930
48	NC_017418	TAA	2	6	3453	3458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826930
49	NC_017418	TGG	2	6	3610	3615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387826930
50	NC_017418	ATA	2	6	3644	3649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826930
51	NC_017418	TAA	2	6	3684	3689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826930
52	NC_017418	TGA	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826930
53	NC_017418	TAA	2	6	3748	3753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826930
54	NC_017418	AAT	2	6	3754	3759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826930
55	NC_017418	AAT	2	6	3895	3900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826930
56	NC_017418	TAT	2	6	4012	4017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826930
57	NC_017418	ATC	2	6	4166	4171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826930
58	NC_017418	TAT	2	6	4223	4228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826930
59	NC_017418	ATG	2	6	4263	4268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826930
60	NC_017418	GAT	2	6	4361	4366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826930
61	NC_017418	TAC	2	6	4456	4461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826930
62	NC_017418	ATT	2	6	4480	4485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826930
63	NC_017418	ACA	2	6	4571	4576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826930
64	NC_017418	ATC	2	6	4600	4605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826930
65	NC_017418	TAA	2	6	4696	4701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826930
66	NC_017418	AGT	2	6	4720	4725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826930
67	NC_017418	TTC	2	6	4783	4788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826930
68	NC_017418	GGA	2	6	4790	4795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387826930
69	NC_017418	TAA	2	6	4816	4821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826930
70	NC_017418	TTG	2	6	4827	4832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826930
71	NC_017418	CTA	2	6	4922	4927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826930
72	NC_017418	TAA	2	6	4944	4949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826930
73	NC_017418	TAA	2	6	4966	4971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826930
74	NC_017418	ATA	2	6	4991	4996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017418	AAT	2	6	5030	5035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017418	TTC	2	6	5041	5046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826931
77	NC_017418	TAC	2	6	5125	5130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826931
78	NC_017418	TCA	2	6	5177	5182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826931
79	NC_017418	CTT	2	6	5213	5218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826931
80	NC_017418	CTT	2	6	5296	5301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826931
81	NC_017418	CTT	2	6	5325	5330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826931
82	NC_017418	TAA	2	6	5446	5451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826931
83	NC_017418	TCG	2	6	5459	5464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826931
84	NC_017418	ATT	2	6	5479	5484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826931
85	NC_017418	CCA	2	6	5520	5525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387826931
86	NC_017418	TAA	2	6	5973	5978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826931
87	NC_017418	CTT	2	6	5994	5999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826931
88	NC_017418	TAC	2	6	6016	6021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826931
89	NC_017418	TAT	2	6	6365	6370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826932
90	NC_017418	TTA	2	6	6425	6430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826932
91	NC_017418	ATT	2	6	6603	6608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826932
92	NC_017418	TAG	2	6	6635	6640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826932
93	NC_017418	ACA	2	6	6707	6712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826932
94	NC_017418	CTA	2	6	6722	6727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826932
95	NC_017418	AAT	2	6	6747	6752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826932
96	NC_017418	CAT	2	6	6803	6808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826932
97	NC_017418	TAA	2	6	6809	6814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826932
98	NC_017418	TAA	2	6	6913	6918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826932
99	NC_017418	ATA	2	6	6950	6955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826932
100	NC_017418	TAA	2	6	6965	6970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826932
101	NC_017418	ATT	2	6	7410	7415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826933
102	NC_017418	TCT	2	6	7514	7519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826933
103	NC_017418	ATC	2	6	7617	7622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826933
104	NC_017418	CTT	2	6	7773	7778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826933
105	NC_017418	TCA	2	6	7795	7800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826933
106	NC_017418	AAT	2	6	7849	7854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826933
107	NC_017418	TAT	2	6	7859	7864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826933
108	NC_017418	TCA	2	6	8014	8019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826933
109	NC_017418	TGC	2	6	8029	8034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826933
110	NC_017418	TAT	2	6	8054	8059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826933
111	NC_017418	TAA	2	6	8124	8129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017418	TAT	2	6	8159	8164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017418	TAA	2	6	8177	8182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017418	TAC	2	6	8295	8300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826934
115	NC_017418	ATT	2	6	8383	8388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826934
116	NC_017418	TAA	2	6	8482	8487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826934
117	NC_017418	GAA	2	6	8535	8540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826934
118	NC_017418	ATA	2	6	8643	8648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826934
119	NC_017418	CTC	2	6	8716	8721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387826934
120	NC_017418	TAA	2	6	8737	8742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826934
121	NC_017418	AAT	2	6	8985	8990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826935
122	NC_017418	TAA	2	6	9008	9013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826935
123	NC_017418	TAA	2	6	9017	9022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826935
124	NC_017418	TGA	2	6	9033	9038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826935
125	NC_017418	AAC	2	6	9117	9122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826935
126	NC_017418	CAA	2	6	9210	9215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826935
127	NC_017418	TAA	2	6	9240	9245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826935
128	NC_017418	AAT	2	6	9246	9251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826935
129	NC_017418	TTA	2	6	9487	9492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826935
130	NC_017418	AGT	2	6	9591	9596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826935
131	NC_017418	CCA	2	6	9598	9603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387826935
132	NC_017418	ACA	2	6	9673	9678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826935
133	NC_017418	TAA	2	6	9702	9707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826935
134	NC_017418	TAA	2	6	9746	9751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826935
135	NC_017418	TGC	2	6	9885	9890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826935
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219	NC_017418	TAT	2	6	15684	15689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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230	NC_017418	ATA	2	6	16553	16558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826943
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241	NC_017418	CTC	2	6	17365	17370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387826944
242	NC_017418	TCA	2	6	17390	17395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826944
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245	NC_017418	AAT	2	6	18004	18009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826945
246	NC_017418	AAT	2	6	18025	18030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826945
247	NC_017418	CAA	2	6	18068	18073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826945
248	NC_017418	TAC	2	6	18097	18102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826946
249	NC_017418	AAT	2	6	18106	18111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826946
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253	NC_017418	TCA	2	6	18308	18313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826946
254	NC_017418	AAC	2	6	18411	18416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826946
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256	NC_017418	TTC	2	6	18535	18540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826946
257	NC_017418	ATC	2	6	18562	18567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826946
258	NC_017418	CAA	2	6	18710	18715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826946
259	NC_017418	ACT	2	6	18844	18849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826946
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