MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 chromosome

Total Repeats: 12037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017418	CTT	2	6	620	625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826929
2	NC_017418	TCA	2	6	654	659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826929
3	NC_017418	ATA	2	6	761	766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826929
4	NC_017418	AGC	2	6	772	777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826929
5	NC_017418	ATT	2	6	802	807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826929
6	NC_017418	GTT	2	6	866	871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826929
7	NC_017418	TCC	2	6	973	978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387826929
8	NC_017418	CTA	2	6	1178	1183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826929
9	NC_017418	TCA	2	6	1199	1204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826929
10	NC_017418	ATC	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826929
11	NC_017418	TGA	2	6	3229	3234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826930
12	NC_017418	GAT	2	6	3235	3240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826930
13	NC_017418	TAA	2	6	3339	3344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826930
14	NC_017418	ATT	2	6	3360	3365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826930
15	NC_017418	ATT	2	6	3425	3430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826930
16	NC_017418	TAA	2	6	3453	3458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826930
17	NC_017418	TGG	2	6	3610	3615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387826930
18	NC_017418	ATA	2	6	3644	3649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826930
19	NC_017418	TAA	2	6	3684	3689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826930
20	NC_017418	TGA	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826930
21	NC_017418	TAA	2	6	3748	3753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826930
22	NC_017418	AAT	2	6	3754	3759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826930
23	NC_017418	AAT	2	6	3895	3900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826930
24	NC_017418	TAT	2	6	4012	4017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826930
25	NC_017418	ATC	2	6	4166	4171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826930
26	NC_017418	TAT	2	6	4223	4228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826930
27	NC_017418	ATG	2	6	4263	4268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826930
28	NC_017418	GAT	2	6	4361	4366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826930
29	NC_017418	TAC	2	6	4456	4461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826930
30	NC_017418	ATT	2	6	4480	4485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826930
31	NC_017418	ACA	2	6	4571	4576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826930
32	NC_017418	ATC	2	6	4600	4605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826930
33	NC_017418	TAA	2	6	4696	4701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826930
34	NC_017418	AGT	2	6	4720	4725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826930
35	NC_017418	TTC	2	6	4783	4788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826930
36	NC_017418	GGA	2	6	4790	4795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387826930
37	NC_017418	TAA	2	6	4816	4821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826930
38	NC_017418	TTG	2	6	4827	4832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826930
39	NC_017418	CTA	2	6	4922	4927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826930
40	NC_017418	TAA	2	6	4944	4949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826930
41	NC_017418	TAA	2	6	4966	4971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826930
42	NC_017418	TTC	2	6	5041	5046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826931
43	NC_017418	TAC	2	6	5125	5130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826931
44	NC_017418	TCA	2	6	5177	5182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826931
45	NC_017418	CTT	2	6	5213	5218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826931
46	NC_017418	CTT	2	6	5296	5301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826931
47	NC_017418	CTT	2	6	5325	5330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826931
48	NC_017418	TAA	2	6	5446	5451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826931
49	NC_017418	TCG	2	6	5459	5464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826931
50	NC_017418	ATT	2	6	5479	5484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826931
51	NC_017418	CCA	2	6	5520	5525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387826931
52	NC_017418	TAA	2	6	5973	5978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826931
53	NC_017418	CTT	2	6	5994	5999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826931
54	NC_017418	TAC	2	6	6016	6021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826931
55	NC_017418	TAT	2	6	6365	6370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826932
56	NC_017418	TTA	2	6	6425	6430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826932
57	NC_017418	ATT	2	6	6603	6608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826932
58	NC_017418	TAG	2	6	6635	6640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826932
59	NC_017418	ACA	2	6	6707	6712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826932
60	NC_017418	CTA	2	6	6722	6727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826932
61	NC_017418	AAT	2	6	6747	6752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826932
62	NC_017418	CAT	2	6	6803	6808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826932
63	NC_017418	TAA	2	6	6809	6814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826932
64	NC_017418	TAA	2	6	6913	6918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826932
65	NC_017418	ATA	2	6	6950	6955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826932
66	NC_017418	TAA	2	6	6965	6970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826932
67	NC_017418	ATT	2	6	7410	7415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826933
68	NC_017418	TCT	2	6	7514	7519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826933
69	NC_017418	ATC	2	6	7617	7622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826933
70	NC_017418	CTT	2	6	7773	7778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826933
71	NC_017418	TCA	2	6	7795	7800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826933
72	NC_017418	AAT	2	6	7849	7854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826933
73	NC_017418	TAT	2	6	7859	7864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826933
74	NC_017418	TCA	2	6	8014	8019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826933
75	NC_017418	TGC	2	6	8029	8034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826933
76	NC_017418	TAT	2	6	8054	8059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826933
77	NC_017418	TAC	2	6	8295	8300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826934
78	NC_017418	ATT	2	6	8383	8388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826934
79	NC_017418	TAA	2	6	8482	8487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826934
80	NC_017418	GAA	2	6	8535	8540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826934
81	NC_017418	ATA	2	6	8643	8648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826934
82	NC_017418	CTC	2	6	8716	8721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387826934
83	NC_017418	TAA	2	6	8737	8742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826934
84	NC_017418	AAT	2	6	8985	8990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826935
85	NC_017418	TAA	2	6	9008	9013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826935
86	NC_017418	TAA	2	6	9017	9022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826935
87	NC_017418	TGA	2	6	9033	9038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826935
88	NC_017418	AAC	2	6	9117	9122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826935
89	NC_017418	CAA	2	6	9210	9215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826935
90	NC_017418	TAA	2	6	9240	9245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826935
91	NC_017418	AAT	2	6	9246	9251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826935
92	NC_017418	TTA	2	6	9487	9492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826935
93	NC_017418	AGT	2	6	9591	9596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826935
94	NC_017418	CCA	2	6	9598	9603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387826935
95	NC_017418	ACA	2	6	9673	9678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826935
96	NC_017418	TAA	2	6	9702	9707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826935
97	NC_017418	TAA	2	6	9746	9751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826935
98	NC_017418	TGC	2	6	9885	9890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826935
99	NC_017418	AAT	2	6	9963	9968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826935
100	NC_017418	ATA	2	6	10011	10016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826936
101	NC_017418	TAA	2	6	10222	10227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826936
102	NC_017418	TAG	2	6	10351	10356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826936
103	NC_017418	AGA	2	6	10436	10441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826937
104	NC_017418	AGT	2	6	10455	10460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826937
105	NC_017418	GCA	2	6	10578	10583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826937
106	NC_017418	ACA	2	6	10675	10680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826937
107	NC_017418	AAG	2	6	10711	10716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826937
108	NC_017418	AGA	2	6	10838	10843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826937
109	NC_017418	AAG	2	6	11161	11166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826937
110	NC_017418	CAA	2	6	11321	11326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826938
111	NC_017418	GAA	2	6	11353	11358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826938
112	NC_017418	ATA	2	6	11388	11393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826938
113	NC_017418	ATT	2	6	11453	11458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826938
114	NC_017418	ACT	2	6	11566	11571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826938
115	NC_017418	ATA	2	6	11766	11771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826938
116	NC_017418	TCT	2	6	11775	11780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826938
117	NC_017418	AAT	2	6	11804	11809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826938
118	NC_017418	AAC	2	6	11897	11902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826938
119	NC_017418	AAT	2	6	11944	11949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826938
120	NC_017418	ATA	2	6	11993	11998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826939
121	NC_017418	GAA	2	6	12025	12030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826939
122	NC_017418	ATT	2	6	12150	12155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826939
123	NC_017418	ATA	2	6	12158	12163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826939
124	NC_017418	CAT	2	6	12192	12197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826939
125	NC_017418	ATA	2	6	12286	12291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826939
126	NC_017418	CAA	2	6	12324	12329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826939
127	NC_017418	GAA	2	6	12355	12360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826939
128	NC_017418	ATA	2	6	12511	12516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826939
129	NC_017418	ATA	2	6	12523	12528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826939
130	NC_017418	TTA	2	6	12556	12561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826940
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