MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp17

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017417	AAAGT	2	10	899	908	60 %	20 %	20 %	0 %	387827840
2	NC_017417	GATAA	2	10	1150	1159	60 %	20 %	20 %	0 %	387827840
3	NC_017417	GTTTG	2	10	2992	3001	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017417	AAACA	2	10	3306	3315	80 %	0 %	0 %	20 %	387827842
5	NC_017417	AAAGT	2	10	4504	4513	60 %	20 %	20 %	0 %	387827843
6	NC_017417	TATAA	2	10	5778	5787	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017417	TAATA	2	10	5791	5800	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017417	AATTT	2	10	5860	5869	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017417	ATATT	2	10	6610	6619	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017417	TTTAA	2	10	7498	7507	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017417	TATTT	2	10	7799	7808	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017417	CATAC	2	10	7990	7999	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_017417	ACAGA	2	10	8171	8180	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017417	AAAAT	2	10	9787	9796	80 %	20 %	0 %	0 %	387827846
15	NC_017417	AAAAT	2	10	9958	9967	80 %	20 %	0 %	0 %	387827846
16	NC_017417	AGATT	2	10	10158	10167	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017417	AGAAA	2	10	10591	10600	80 %	0 %	20 %	0 %	387827847
18	NC_017417	TCAAA	2	10	10873	10882	60 %	20 %	0 %	20 %	387827847
19	NC_017417	CAATT	2	10	11548	11557	40 %	40 %	0 %	20 %	387827848
20	NC_017417	GATAA	2	10	11795	11804	60 %	20 %	20 %	0 %	387827849
21	NC_017417	CAAAA	2	10	12209	12218	80 %	0 %	0 %	20 %	387827849
22	NC_017417	AAAAG	2	10	13840	13849	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017417	ATTTT	2	10	14459	14468	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017417	GTTTT	2	10	14810	14819	0 %	80 %	20 %	0 %	387827851
25	NC_017417	TAATA	3	15	15214	15228	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017417	AATTT	2	10	18429	18438	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017417	ATATT	2	10	19064	19073	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017417	TAAAT	2	10	19283	19292	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017417	AAAGA	2	10	19295	19304	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017417	ATTTG	2	10	20600	20609	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.