MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp17

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017417	ATTT	2	8	172	179	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017417	AATA	2	8	362	369	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017417	ATTT	2	8	427	434	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017417	TTTA	2	8	461	468	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017417	ATCT	2	8	501	508	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017417	TAGA	2	8	584	591	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017417	AAAT	2	8	681	688	75 %	25 %	0 %	0 %	387827840
8	NC_017417	AAAG	2	8	856	863	75 %	0 %	25 %	0 %	387827840
9	NC_017417	ATAA	2	8	1441	1448	75 %	25 %	0 %	0 %	387827840
10	NC_017417	CCAG	2	8	1621	1628	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017417	TCTA	2	8	1937	1944	25 %	50 %	0 %	25 %	387827841
12	NC_017417	AGCA	2	8	2569	2576	50 %	0 %	25 %	25 %	387827841
13	NC_017417	TGCA	2	8	2750	2757	25 %	25 %	25 %	25 %	387827841
14	NC_017417	CCTC	2	8	2944	2951	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
15	NC_017417	AGAT	2	8	3099	3106	50 %	25 %	25 %	0 %	387827842
16	NC_017417	GCTT	2	8	3514	3521	0 %	50 %	25 %	25 %	387827842
17	NC_017417	TAAA	2	8	3898	3905	75 %	25 %	0 %	0 %	387827842
18	NC_017417	ATGA	2	8	4776	4783	50 %	25 %	25 %	0 %	387827843
19	NC_017417	TAAA	2	8	4891	4898	75 %	25 %	0 %	0 %	387827843
20	NC_017417	ATAG	2	8	5093	5100	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017417	ATGG	2	8	5816	5823	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017417	TAAT	2	8	6460	6467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017417	ACAA	2	8	7628	7635	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017417	CATT	2	8	7705	7712	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017417	TAAA	2	8	8007	8014	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017417	ATTA	2	8	8702	8709	50 %	50 %	0 %	0 %	387827845
27	NC_017417	TCTA	2	8	8715	8722	25 %	50 %	0 %	25 %	387827845
28	NC_017417	AATC	2	8	8779	8786	50 %	25 %	0 %	25 %	387827845
29	NC_017417	AATG	2	8	8849	8856	50 %	25 %	25 %	0 %	387827845
30	NC_017417	CAAT	2	8	8964	8971	50 %	25 %	0 %	25 %	387827845
31	NC_017417	AAAT	2	8	9974	9981	75 %	25 %	0 %	0 %	387827846
32	NC_017417	TATT	2	8	10017	10024	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017417	TACT	2	8	10248	10255	25 %	50 %	0 %	25 %	387827847
34	NC_017417	CAAA	2	8	10330	10337	75 %	0 %	0 %	25 %	387827847
35	NC_017417	GAAA	2	8	11540	11547	75 %	0 %	25 %	0 %	387827848
36	NC_017417	AGCA	2	8	11566	11573	50 %	0 %	25 %	25 %	387827848
37	NC_017417	ACAA	2	8	12003	12010	75 %	0 %	0 %	25 %	387827849
38	NC_017417	ATCA	2	8	12100	12107	50 %	25 %	0 %	25 %	387827849
39	NC_017417	ATAA	2	8	12464	12471	75 %	25 %	0 %	0 %	387827849
40	NC_017417	TAAA	2	8	12771	12778	75 %	25 %	0 %	0 %	387827849
41	NC_017417	AGTA	2	8	12847	12854	50 %	25 %	25 %	0 %	387827849
42	NC_017417	AATT	2	8	12911	12918	50 %	50 %	0 %	0 %	387827849
43	NC_017417	ACCA	2	8	13069	13076	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017417	TTAT	2	8	13351	13358	25 %	75 %	0 %	0 %	387827850
45	NC_017417	TTTC	2	8	13437	13444	0 %	75 %	0 %	25 %	387827850
46	NC_017417	ATTT	2	8	13547	13554	25 %	75 %	0 %	0 %	387827850
47	NC_017417	ATTA	2	8	13769	13776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017417	TTTA	2	8	13917	13924	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017417	AGAT	2	8	13933	13940	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017417	TTAT	2	8	14075	14082	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017417	TAAG	2	8	14114	14121	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017417	AAAT	2	8	14178	14185	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017417	ATTT	2	8	15085	15092	25 %	75 %	0 %	0 %	387827851
54	NC_017417	AAAG	2	8	15127	15134	75 %	0 %	25 %	0 %	387827851
55	NC_017417	TAAA	2	8	15270	15277	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017417	GCCC	2	8	15417	15424	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
57	NC_017417	AAAT	2	8	15433	15440	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017417	ATTT	2	8	15475	15482	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017417	AATT	2	8	15568	15575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017417	GTAA	2	8	15592	15599	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017417	ACCA	2	8	15739	15746	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017417	AGAT	2	8	15813	15820	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017417	AAAT	2	8	15860	15867	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017417	ATAA	2	8	15868	15875	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017417	TGTA	2	8	15915	15922	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017417	AAGC	2	8	16016	16023	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017417	TTAT	2	8	16201	16208	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017417	ATTA	2	8	16232	16239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017417	TAAT	2	8	16704	16711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017417	TAAT	2	8	16725	16732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017417	TAAT	2	8	16746	16753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017417	TAAT	2	8	16767	16774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017417	TAAT	2	8	16788	16795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017417	TAAT	2	8	16809	16816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017417	TAAT	2	8	16830	16837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017417	TAAT	2	8	16851	16858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017417	TAAT	2	8	16872	16879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017417	TAAT	2	8	16893	16900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017417	TAAT	2	8	16914	16921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017417	TAAT	2	8	16935	16942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017417	TAAT	2	8	16956	16963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017417	TAAT	2	8	16977	16984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017417	TAAT	2	8	16998	17005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017417	TAAT	2	8	17019	17026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017417	TAAT	2	8	17040	17047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017417	TAAT	2	8	17061	17068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017417	TAAT	2	8	17082	17089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017417	TTAT	2	8	17193	17200	25 %	75 %	0 %	0 %	387827852
89	NC_017417	AGCA	2	8	17240	17247	50 %	0 %	25 %	25 %	387827852
90	NC_017417	GATG	2	8	17316	17323	25 %	25 %	50 %	0 %	387827852
91	NC_017417	TTTG	2	8	17444	17451	0 %	75 %	25 %	0 %	387827852
92	NC_017417	ATTT	2	8	18221	18228	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017417	ATAA	2	8	18326	18333	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017417	AAAT	2	8	18795	18802	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017417	GATT	2	8	18849	18856	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017417	AATT	2	8	19372	19379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017417	CTTT	2	8	19455	19462	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017417	CAAT	2	8	19652	19659	50 %	25 %	0 %	25 %	387827854
99	NC_017417	ATTG	2	8	19680	19687	25 %	50 %	25 %	0 %	387827855
100	NC_017417	TAAT	2	8	19736	19743	50 %	50 %	0 %	0 %	387827855
101	NC_017417	TTTA	2	8	20181	20188	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017417	TAAA	2	8	20195	20202	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017417	TAAA	2	8	20664	20671	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.