MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp17

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017417	AAAT	2	8	681	688	75 %	25 %	0 %	0 %	387827840
2	NC_017417	AAAG	2	8	856	863	75 %	0 %	25 %	0 %	387827840
3	NC_017417	ATAA	2	8	1441	1448	75 %	25 %	0 %	0 %	387827840
4	NC_017417	TCTA	2	8	1937	1944	25 %	50 %	0 %	25 %	387827841
5	NC_017417	AGCA	2	8	2569	2576	50 %	0 %	25 %	25 %	387827841
6	NC_017417	TGCA	2	8	2750	2757	25 %	25 %	25 %	25 %	387827841
7	NC_017417	AGAT	2	8	3099	3106	50 %	25 %	25 %	0 %	387827842
8	NC_017417	GCTT	2	8	3514	3521	0 %	50 %	25 %	25 %	387827842
9	NC_017417	TAAA	2	8	3898	3905	75 %	25 %	0 %	0 %	387827842
10	NC_017417	ATGA	2	8	4776	4783	50 %	25 %	25 %	0 %	387827843
11	NC_017417	TAAA	2	8	4891	4898	75 %	25 %	0 %	0 %	387827843
12	NC_017417	ATTA	2	8	8702	8709	50 %	50 %	0 %	0 %	387827845
13	NC_017417	TCTA	2	8	8715	8722	25 %	50 %	0 %	25 %	387827845
14	NC_017417	AATC	2	8	8779	8786	50 %	25 %	0 %	25 %	387827845
15	NC_017417	AATG	2	8	8849	8856	50 %	25 %	25 %	0 %	387827845
16	NC_017417	CAAT	2	8	8964	8971	50 %	25 %	0 %	25 %	387827845
17	NC_017417	AAAT	2	8	9974	9981	75 %	25 %	0 %	0 %	387827846
18	NC_017417	TACT	2	8	10248	10255	25 %	50 %	0 %	25 %	387827847
19	NC_017417	CAAA	2	8	10330	10337	75 %	0 %	0 %	25 %	387827847
20	NC_017417	GAAA	2	8	11540	11547	75 %	0 %	25 %	0 %	387827848
21	NC_017417	AGCA	2	8	11566	11573	50 %	0 %	25 %	25 %	387827848
22	NC_017417	ACAA	2	8	12003	12010	75 %	0 %	0 %	25 %	387827849
23	NC_017417	ATCA	2	8	12100	12107	50 %	25 %	0 %	25 %	387827849
24	NC_017417	ATAA	2	8	12464	12471	75 %	25 %	0 %	0 %	387827849
25	NC_017417	TAAA	2	8	12771	12778	75 %	25 %	0 %	0 %	387827849
26	NC_017417	AGTA	2	8	12847	12854	50 %	25 %	25 %	0 %	387827849
27	NC_017417	AATT	2	8	12911	12918	50 %	50 %	0 %	0 %	387827849
28	NC_017417	TTAT	2	8	13351	13358	25 %	75 %	0 %	0 %	387827850
29	NC_017417	TTTC	2	8	13437	13444	0 %	75 %	0 %	25 %	387827850
30	NC_017417	ATTT	2	8	13547	13554	25 %	75 %	0 %	0 %	387827850
31	NC_017417	ATTT	2	8	15085	15092	25 %	75 %	0 %	0 %	387827851
32	NC_017417	AAAG	2	8	15127	15134	75 %	0 %	25 %	0 %	387827851
33	NC_017417	TTAT	2	8	17193	17200	25 %	75 %	0 %	0 %	387827852
34	NC_017417	AGCA	2	8	17240	17247	50 %	0 %	25 %	25 %	387827852
35	NC_017417	GATG	2	8	17316	17323	25 %	25 %	50 %	0 %	387827852
36	NC_017417	TTTG	2	8	17444	17451	0 %	75 %	25 %	0 %	387827852
37	NC_017417	CAAT	2	8	19652	19659	50 %	25 %	0 %	25 %	387827854
38	NC_017417	ATTG	2	8	19680	19687	25 %	50 %	25 %	0 %	387827855
39	NC_017417	TAAT	2	8	19736	19743	50 %	50 %	0 %	0 %	387827855

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.