MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp17

Total Repeats: 315

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017417	GTT	2	6	7	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017417	TTA	2	6	25	30	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017417	ATT	2	6	81	86	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017417	GTT	2	6	112	117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017417	CTA	2	6	186	191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017417	TTC	2	6	213	218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017417	CTT	2	6	228	233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017417	TAG	2	6	328	333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017417	CTA	2	6	535	540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017417	TAA	2	6	568	573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017417	TAA	2	6	608	613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827840
12	NC_017417	CAA	2	6	691	696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827840
13	NC_017417	ATA	2	6	737	742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827840
14	NC_017417	ATA	2	6	770	775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827840
15	NC_017417	ACA	3	9	797	805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827840
16	NC_017417	GAT	2	6	832	837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827840
17	NC_017417	GAA	2	6	841	846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827840
18	NC_017417	CAA	3	9	883	891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827840
19	NC_017417	AAT	2	6	892	897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827840
20	NC_017417	GAT	2	6	949	954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827840
21	NC_017417	ACT	2	6	1029	1034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827840
22	NC_017417	TAA	2	6	1035	1040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827840
23	NC_017417	AGA	2	6	1098	1103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827840
24	NC_017417	AAT	2	6	1192	1197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827840
25	NC_017417	TAG	2	6	1275	1280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827840
26	NC_017417	TGC	2	6	1317	1322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827840
27	NC_017417	ATG	2	6	1370	1375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827840
28	NC_017417	AGA	2	6	1380	1385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827840
29	NC_017417	ATG	2	6	1454	1459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827840
30	NC_017417	CTT	2	6	1650	1655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017417	ACA	2	6	1679	1684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017417	ATT	2	6	1725	1730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017417	ATT	2	6	1736	1741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017417	TAT	2	6	1773	1778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017417	ATT	3	9	1780	1788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017417	TTA	2	6	1829	1834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017417	TAA	2	6	1867	1872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827841
38	NC_017417	TAT	2	6	1880	1885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827841
39	NC_017417	GTT	2	6	1924	1929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827841
40	NC_017417	ATC	2	6	1981	1986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827841
41	NC_017417	ACT	2	6	2001	2006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827841
42	NC_017417	CAG	2	6	2014	2019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827841
43	NC_017417	CAT	2	6	2059	2064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827841
44	NC_017417	GAT	2	6	2121	2126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827841
45	NC_017417	ATA	2	6	2137	2142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827841
46	NC_017417	AAT	2	6	2171	2176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827841
47	NC_017417	AAT	2	6	2199	2204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827841
48	NC_017417	GAA	2	6	2214	2219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827841
49	NC_017417	TAC	2	6	2279	2284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827841
50	NC_017417	AGA	3	9	2312	2320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827841
51	NC_017417	AAG	2	6	2350	2355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827841
52	NC_017417	TAT	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827841
53	NC_017417	CTT	2	6	2862	2867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017417	ACT	2	6	2966	2971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017417	ATT	2	6	3122	3127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827842
56	NC_017417	ACA	2	6	3223	3228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827842
57	NC_017417	AGC	2	6	3252	3257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827842
58	NC_017417	AAT	2	6	3291	3296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827842
59	NC_017417	GTT	2	6	3333	3338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827842
60	NC_017417	ATA	2	6	3355	3360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827842
61	NC_017417	AGC	2	6	3363	3368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827842
62	NC_017417	CAA	2	6	3378	3383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827842
63	NC_017417	TCT	2	6	3441	3446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827842
64	NC_017417	AGA	2	6	3449	3454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827842
65	NC_017417	ATA	2	6	3502	3507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827842
66	NC_017417	AGT	2	6	3627	3632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827842
67	NC_017417	CTT	2	6	3637	3642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827842
68	NC_017417	ATG	2	6	3658	3663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827842
69	NC_017417	GCT	2	6	3915	3920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827842
70	NC_017417	ATA	2	6	3927	3932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017417	TAA	3	9	4010	4018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017417	TAC	2	6	4046	4051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827843
73	NC_017417	ACA	2	6	4171	4176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827843
74	NC_017417	AAG	2	6	4178	4183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827843
75	NC_017417	AAT	2	6	4221	4226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827843
76	NC_017417	AAT	2	6	4236	4241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827843
77	NC_017417	AAG	2	6	4255	4260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827843
78	NC_017417	AAT	2	6	4281	4286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827843
79	NC_017417	CAA	2	6	4371	4376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827843
80	NC_017417	TAA	3	9	4379	4387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827843
81	NC_017417	AGA	2	6	4442	4447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827843
82	NC_017417	TAA	2	6	4451	4456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827843
83	NC_017417	TAA	2	6	4493	4498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827843
84	NC_017417	AAT	2	6	4536	4541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827843
85	NC_017417	TAA	2	6	4553	4558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827843
86	NC_017417	TAG	2	6	4607	4612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827843
87	NC_017417	ATT	2	6	4636	4641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827843
88	NC_017417	AGA	2	6	4703	4708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827843
89	NC_017417	AAG	2	6	4717	4722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827843
90	NC_017417	ATA	2	6	4729	4734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827843
91	NC_017417	TAT	2	6	4770	4775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827843
92	NC_017417	AAG	2	6	4789	4794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827843
93	NC_017417	GCT	2	6	4908	4913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827843
94	NC_017417	AGT	2	6	4917	4922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827843
95	NC_017417	AGA	2	6	4950	4955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017417	TAA	2	6	4998	5003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017417	ACA	2	6	5022	5027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017417	TTA	2	6	5141	5146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017417	AAC	2	6	5171	5176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017417	TAA	2	6	5191	5196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017417	TAC	2	6	5228	5233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017417	GTT	2	6	5362	5367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017417	TAA	2	6	5468	5473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017417	TAT	2	6	5577	5582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017417	TTA	2	6	5610	5615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017417	ACT	2	6	5626	5631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017417	TAT	2	6	5635	5640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017417	GAA	2	6	5646	5651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017417	ACT	3	9	5676	5684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017417	ATT	2	6	5923	5928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017417	TAA	2	6	5961	5966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017417	TAA	2	6	5977	5982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017417	GTT	2	6	6143	6148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017417	ATT	2	6	6202	6207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017417	ATA	2	6	6221	6226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017417	TAA	2	6	6246	6251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017417	TCC	2	6	6293	6298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_017417	TAA	2	6	6316	6321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017417	ATC	2	6	6431	6436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017417	CAA	2	6	6715	6720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017417	TAT	2	6	6762	6767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017417	TAA	2	6	6866	6871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017417	TAA	3	9	6914	6922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017417	AGA	2	6	6929	6934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017417	TAA	2	6	6967	6972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017417	ATT	2	6	7008	7013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017417	TTA	2	6	7020	7025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017417	ATA	2	6	7059	7064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017417	ATT	2	6	7139	7144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017417	ACA	2	6	7168	7173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017417	ATG	2	6	7183	7188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827844
132	NC_017417	TTA	2	6	7198	7203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827844
133	NC_017417	ATA	2	6	7214	7219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827844
134	NC_017417	AGA	2	6	7263	7268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827844
135	NC_017417	AAG	2	6	7298	7303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827844
136	NC_017417	TAA	2	6	7389	7394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017417	TAA	3	9	7466	7474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017417	AAG	2	6	7555	7560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017417	TAA	2	6	7598	7603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.