MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp17

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017417	A	6	6	67	72	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017417	A	8	8	119	126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017417	A	7	7	920	926	100 %	0 %	0 %	0 %	387827840
4	NC_017417	A	6	6	1203	1208	100 %	0 %	0 %	0 %	387827840
5	NC_017417	A	6	6	1570	1575	100 %	0 %	0 %	0 %	387827840
6	NC_017417	T	7	7	1909	1915	0 %	100 %	0 %	0 %	387827841
7	NC_017417	A	6	6	1944	1949	100 %	0 %	0 %	0 %	387827841
8	NC_017417	A	7	7	2070	2076	100 %	0 %	0 %	0 %	387827841
9	NC_017417	A	6	6	2714	2719	100 %	0 %	0 %	0 %	387827841
10	NC_017417	A	6	6	2808	2813	100 %	0 %	0 %	0 %	387827841
11	NC_017417	T	6	6	3049	3054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017417	A	6	6	3960	3965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017417	A	6	6	4272	4277	100 %	0 %	0 %	0 %	387827843
14	NC_017417	T	6	6	4529	4534	0 %	100 %	0 %	0 %	387827843
15	NC_017417	T	6	6	5161	5166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017417	A	7	7	5208	5214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017417	A	6	6	5425	5430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017417	A	6	6	5489	5494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017417	A	6	6	5668	5673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017417	A	7	7	5747	5753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017417	A	7	7	5757	5763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017417	A	7	7	6053	6059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017417	A	6	6	6638	6643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017417	A	6	6	6783	6788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017417	A	8	8	6823	6830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017417	A	6	6	6832	6837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017417	A	6	6	7094	7099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017417	A	6	6	7289	7294	100 %	0 %	0 %	0 %	387827844
29	NC_017417	A	6	6	7314	7319	100 %	0 %	0 %	0 %	387827844
30	NC_017417	A	6	6	7427	7432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017417	A	6	6	7793	7798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017417	A	8	8	7883	7890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017417	T	6	6	7951	7956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017417	A	7	7	8201	8207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017417	A	6	6	8471	8476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017417	A	6	6	8532	8537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017417	A	7	7	8798	8804	100 %	0 %	0 %	0 %	387827845
38	NC_017417	T	7	7	9006	9012	0 %	100 %	0 %	0 %	387827845
39	NC_017417	A	6	6	9259	9264	100 %	0 %	0 %	0 %	387827845
40	NC_017417	T	7	7	9610	9616	0 %	100 %	0 %	0 %	387827846
41	NC_017417	A	8	8	9946	9953	100 %	0 %	0 %	0 %	387827846
42	NC_017417	C	6	6	9998	10003	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
43	NC_017417	A	8	8	10027	10034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017417	A	6	6	10112	10117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017417	A	6	6	10260	10265	100 %	0 %	0 %	0 %	387827847
46	NC_017417	A	7	7	10267	10273	100 %	0 %	0 %	0 %	387827847
47	NC_017417	A	6	6	10319	10324	100 %	0 %	0 %	0 %	387827847
48	NC_017417	A	6	6	10629	10634	100 %	0 %	0 %	0 %	387827847
49	NC_017417	A	6	6	10904	10909	100 %	0 %	0 %	0 %	387827847
50	NC_017417	G	6	6	10953	10958	0 %	0 %	100 %	0 %	387827847
51	NC_017417	T	6	6	10992	10997	0 %	100 %	0 %	0 %	387827847
52	NC_017417	A	8	8	11108	11115	100 %	0 %	0 %	0 %	387827847
53	NC_017417	A	6	6	11421	11426	100 %	0 %	0 %	0 %	387827848
54	NC_017417	A	8	8	11573	11580	100 %	0 %	0 %	0 %	387827848
55	NC_017417	A	6	6	11624	11629	100 %	0 %	0 %	0 %	387827848
56	NC_017417	A	6	6	11818	11823	100 %	0 %	0 %	0 %	387827849
57	NC_017417	A	7	7	11883	11889	100 %	0 %	0 %	0 %	387827849
58	NC_017417	A	7	7	11945	11951	100 %	0 %	0 %	0 %	387827849
59	NC_017417	A	7	7	12092	12098	100 %	0 %	0 %	0 %	387827849
60	NC_017417	A	7	7	12290	12296	100 %	0 %	0 %	0 %	387827849
61	NC_017417	A	6	6	12349	12354	100 %	0 %	0 %	0 %	387827849
62	NC_017417	A	7	7	12447	12453	100 %	0 %	0 %	0 %	387827849
63	NC_017417	A	6	6	12525	12530	100 %	0 %	0 %	0 %	387827849
64	NC_017417	A	6	6	12567	12572	100 %	0 %	0 %	0 %	387827849
65	NC_017417	A	7	7	12686	12692	100 %	0 %	0 %	0 %	387827849
66	NC_017417	A	6	6	12717	12722	100 %	0 %	0 %	0 %	387827849
67	NC_017417	A	6	6	12747	12752	100 %	0 %	0 %	0 %	387827849
68	NC_017417	A	7	7	12758	12764	100 %	0 %	0 %	0 %	387827849
69	NC_017417	A	7	7	12784	12790	100 %	0 %	0 %	0 %	387827849
70	NC_017417	A	6	6	12840	12845	100 %	0 %	0 %	0 %	387827849
71	NC_017417	T	6	6	12858	12863	0 %	100 %	0 %	0 %	387827849
72	NC_017417	T	8	8	12969	12976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017417	T	6	6	13085	13090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017417	T	8	8	13143	13150	0 %	100 %	0 %	0 %	387827850
75	NC_017417	T	6	6	13269	13274	0 %	100 %	0 %	0 %	387827850
76	NC_017417	A	6	6	13384	13389	100 %	0 %	0 %	0 %	387827850
77	NC_017417	T	6	6	13633	13638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017417	T	6	6	14288	14293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017417	T	7	7	14358	14364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017417	A	6	6	14365	14370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017417	T	7	7	14465	14471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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86	NC_017417	T	6	6	14874	14879	0 %	100 %	0 %	0 %	387827851
87	NC_017417	T	6	6	15037	15042	0 %	100 %	0 %	0 %	387827851
88	NC_017417	A	6	6	15064	15069	100 %	0 %	0 %	0 %	387827851
89	NC_017417	A	7	7	15275	15281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017417	T	8	8	15296	15303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017417	G	12	12	15447	15458	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017417	T	7	7	15641	15647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017417	T	6	6	15659	15664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017417	A	8	8	15828	15835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017417	A	7	7	15890	15896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017417	A	7	7	16040	16046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017417	A	7	7	16073	16079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017417	A	7	7	16085	16091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017417	A	6	6	16093	16098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017417	A	6	6	16162	16167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017417	T	7	7	16185	16191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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105	NC_017417	A	7	7	17348	17354	100 %	0 %	0 %	0 %	387827852
106	NC_017417	A	6	6	17634	17639	100 %	0 %	0 %	0 %	387827852
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108	NC_017417	A	6	6	18114	18119	100 %	0 %	0 %	0 %	387827853
109	NC_017417	A	7	7	18148	18154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017417	T	6	6	18342	18347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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112	NC_017417	A	7	7	18676	18682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017417	A	7	7	18752	18758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017417	T	6	6	18836	18841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017417	T	6	6	18876	18881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017417	A	6	6	19046	19051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017417	A	8	8	19113	19120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017417	A	6	6	19125	19130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017417	A	7	7	19144	19150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017417	A	6	6	19171	19176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017417	A	6	6	19475	19480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017417	A	6	6	19546	19551	100 %	0 %	0 %	0 %	387827854
123	NC_017417	A	6	6	19748	19753	100 %	0 %	0 %	0 %	387827855
124	NC_017417	A	7	7	19780	19786	100 %	0 %	0 %	0 %	387827855
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126	NC_017417	A	6	6	19942	19947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017417	T	7	7	20047	20053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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131	NC_017417	T	7	7	20125	20131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017417	T	7	7	20240	20246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017417	T	6	6	20419	20424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017417	G	6	6	20430	20435	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017417	T	6	6	20482	20487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.