MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp28-4

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017416	AATC	2	8	239	246	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017416	ATTC	2	8	254	261	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017416	CTAT	2	8	498	505	25 %	50 %	0 %	25 %	387828030
4	NC_017416	ATTA	2	8	519	526	50 %	50 %	0 %	0 %	387828030
5	NC_017416	TCAA	2	8	727	734	50 %	25 %	0 %	25 %	387828030
6	NC_017416	AATC	2	8	1452	1459	50 %	25 %	0 %	25 %	387828031
7	NC_017416	ATTA	2	8	2028	2035	50 %	50 %	0 %	0 %	387828032
8	NC_017416	CAAT	2	8	2537	2544	50 %	25 %	0 %	25 %	387828033
9	NC_017416	AGCC	2	8	3404	3411	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017416	TTAA	2	8	3669	3676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017416	ACAA	2	8	3910	3917	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017416	AAAT	2	8	4094	4101	75 %	25 %	0 %	0 %	387828036
13	NC_017416	AAAT	2	8	4289	4296	75 %	25 %	0 %	0 %	387828036
14	NC_017416	AAAT	2	8	4386	4393	75 %	25 %	0 %	0 %	387828036
15	NC_017416	TTAA	2	8	4816	4823	50 %	50 %	0 %	0 %	387828036
16	NC_017416	TTAA	2	8	4835	4842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017416	GATT	2	8	5368	5375	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017416	ATTA	2	8	5389	5396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017416	TGTT	2	8	5777	5784	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017416	AAAT	2	8	5867	5874	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017416	AAAT	2	8	6793	6800	75 %	25 %	0 %	0 %	387828037
22	NC_017416	ATAA	2	8	6855	6862	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017416	CAAA	2	8	7082	7089	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017416	TATG	2	8	7661	7668	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017416	GATA	2	8	7785	7792	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017416	ATAG	2	8	7899	7906	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017416	ATAA	2	8	8482	8489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017416	ATCA	2	8	8525	8532	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017416	ATTT	4	16	8577	8592	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017416	TTAA	2	8	8596	8603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017416	ATAA	3	12	8647	8658	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017416	GAAG	2	8	9688	9695	50 %	0 %	50 %	0 %	387828039
33	NC_017416	ATAA	2	8	9974	9981	75 %	25 %	0 %	0 %	387828039
34	NC_017416	GGTA	2	8	10389	10396	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017416	TATC	2	8	10511	10518	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017416	ATTG	2	8	10730	10737	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017416	ATTT	2	8	11299	11306	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017416	ATTA	2	8	11434	11441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017416	TAAA	2	8	11596	11603	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017416	CAAA	2	8	11629	11636	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017416	CTAA	2	8	11880	11887	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017416	AAAT	2	8	12366	12373	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017416	TTTA	2	8	12530	12537	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017416	CAAC	2	8	12756	12763	50 %	0 %	0 %	50 %	387828040
45	NC_017416	ATCA	2	8	12912	12919	50 %	25 %	0 %	25 %	387828040
46	NC_017416	CAAG	2	8	12951	12958	50 %	0 %	25 %	25 %	387828040
47	NC_017416	GTTT	2	8	13227	13234	0 %	75 %	25 %	0 %	387828040
48	NC_017416	GAAA	2	8	13256	13263	75 %	0 %	25 %	0 %	387828040
49	NC_017416	CAAA	2	8	13665	13672	75 %	0 %	0 %	25 %	387828040
50	NC_017416	AATG	2	8	13850	13857	50 %	25 %	25 %	0 %	387828041
51	NC_017416	TAAA	2	8	14879	14886	75 %	25 %	0 %	0 %	387828042
52	NC_017416	ATTA	2	8	15145	15152	50 %	50 %	0 %	0 %	387828043
53	NC_017416	AAAT	2	8	15219	15226	75 %	25 %	0 %	0 %	387828043
54	NC_017416	TAAC	2	8	16090	16097	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017416	TAAA	2	8	16417	16424	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017416	TAAA	2	8	16617	16624	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017416	TAAA	2	8	17039	17046	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017416	TTTA	2	8	17078	17085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017416	ATAA	2	8	17101	17108	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017416	TTTA	2	8	17822	17829	25 %	75 %	0 %	0 %	387828044
61	NC_017416	GCAA	2	8	17835	17842	50 %	0 %	25 %	25 %	387828044
62	NC_017416	TATT	2	8	18066	18073	25 %	75 %	0 %	0 %	387828044
63	NC_017416	ATGA	2	8	18446	18453	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017416	TTTA	2	8	18464	18471	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017416	ATTT	2	8	18682	18689	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017416	TACT	2	8	18782	18789	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017416	ATTT	2	8	19675	19682	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017416	ATTT	2	8	19768	19775	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017416	TTTA	2	8	19926	19933	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017416	TGTT	2	8	20074	20081	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017416	TATT	2	8	20139	20146	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017416	ATTT	2	8	20164	20171	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017416	TTAA	2	8	20202	20209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017416	GCTT	2	8	20516	20523	0 %	50 %	25 %	25 %	387828046
75	NC_017416	ATTA	2	8	20555	20562	50 %	50 %	0 %	0 %	387828046
76	NC_017416	TATC	2	8	20704	20711	25 %	50 %	0 %	25 %	387828046
77	NC_017416	TTGT	2	8	20727	20734	0 %	75 %	25 %	0 %	387828046
78	NC_017416	ATTT	2	8	21198	21205	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017416	ATTA	2	8	21309	21316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017416	TTTA	2	8	21377	21384	25 %	75 %	0 %	0 %	387828047
81	NC_017416	AAAT	2	8	21718	21725	75 %	25 %	0 %	0 %	387828047
82	NC_017416	AAAT	2	8	22113	22120	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017416	AATA	2	8	22427	22434	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017416	ACAA	2	8	22804	22811	75 %	0 %	0 %	25 %	387828048
85	NC_017416	TCTT	2	8	23356	23363	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017416	TAAT	2	8	23462	23469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017416	TTTC	2	8	23493	23500	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017416	TTAT	2	8	23583	23590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017416	TGTT	2	8	24515	24522	0 %	75 %	25 %	0 %	387828049
90	NC_017416	TTTG	2	8	25999	26006	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017416	AATT	2	8	26681	26688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017416	TATT	2	8	27019	27026	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017416	AAAT	2	8	27030	27037	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017416	AAAG	2	8	27723	27730	75 %	0 %	25 %	0 %	387828051
95	NC_017416	GATA	2	8	27746	27753	50 %	25 %	25 %	0 %	387828051
96	NC_017416	TTAT	2	8	27939	27946	25 %	75 %	0 %	0 %	387828051
97	NC_017416	ATTT	2	8	28492	28499	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017416	CTTT	2	8	28743	28750	0 %	75 %	0 %	25 %	387828052
99	NC_017416	ATCA	2	8	28811	28818	50 %	25 %	0 %	25 %	387828052
100	NC_017416	CTAT	2	8	28842	28849	25 %	50 %	0 %	25 %	387828052
101	NC_017416	ATTT	2	8	28879	28886	25 %	75 %	0 %	0 %	387828052
102	NC_017416	TAAT	2	8	29011	29018	50 %	50 %	0 %	0 %	387828052
103	NC_017416	ATTA	2	8	29210	29217	50 %	50 %	0 %	0 %	387828052

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.