MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp28-4

Total Repeats: 497

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017416	TTA	2	6	5	10	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017416	TAA	2	6	42	47	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017416	AAG	2	6	93	98	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017416	AAC	2	6	411	416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828030
5	NC_017416	TAC	2	6	557	562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828030
6	NC_017416	AAC	2	6	565	570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828030
7	NC_017416	ATT	2	6	576	581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828030
8	NC_017416	AAT	2	6	735	740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828030
9	NC_017416	ATT	2	6	745	750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828030
10	NC_017416	CTA	2	6	778	783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828030
11	NC_017416	AAT	2	6	976	981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017416	TAT	2	6	1003	1008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017416	ATT	2	6	1062	1067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828031
14	NC_017416	ATT	2	6	1075	1080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828031
15	NC_017416	TTA	2	6	1081	1086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828031
16	NC_017416	AAT	2	6	1120	1125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828031
17	NC_017416	TTA	2	6	1322	1327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828031
18	NC_017416	AGA	2	6	1383	1388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828031
19	NC_017416	ATC	2	6	1475	1480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828031
20	NC_017416	TAG	3	9	1547	1555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017416	TAC	2	6	1563	1568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017416	ATA	2	6	1746	1751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828032
23	NC_017416	AAC	2	6	1774	1779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828032
24	NC_017416	ATT	2	6	1834	1839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828032
25	NC_017416	AAT	2	6	1854	1859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828032
26	NC_017416	CAA	2	6	1933	1938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828032
27	NC_017416	ATA	2	6	1977	1982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828032
28	NC_017416	TAT	2	6	2019	2024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828032
29	NC_017416	ACT	2	6	2068	2073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828032
30	NC_017416	ACA	2	6	2099	2104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828032
31	NC_017416	CTA	2	6	2122	2127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828032
32	NC_017416	GAA	2	6	2227	2232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017416	TAA	2	6	2297	2302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828033
34	NC_017416	ACA	2	6	2321	2326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828033
35	NC_017416	TAG	2	6	2358	2363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387828033
36	NC_017416	ACA	2	6	2408	2413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828033
37	NC_017416	TTA	2	6	2443	2448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828033
38	NC_017416	AAC	2	6	2473	2478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828033
39	NC_017416	TAA	2	6	2493	2498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828033
40	NC_017416	TAC	2	6	2530	2535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828033
41	NC_017416	ACT	2	6	2576	2581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828033
42	NC_017416	TAT	2	6	2681	2686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017416	AAT	2	6	2717	2722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017416	TTA	3	9	2884	2892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828034
45	NC_017416	TAA	2	6	2963	2968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017416	ATA	2	6	3002	3007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017416	TTA	2	6	3068	3073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828035
48	NC_017416	ACA	2	6	3112	3117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828035
49	NC_017416	AAC	2	6	3121	3126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828035
50	NC_017416	TAA	2	6	3141	3146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828035
51	NC_017416	CAA	2	6	3176	3181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828035
52	NC_017416	CTA	2	6	3339	3344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828035
53	NC_017416	ATC	2	6	3563	3568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017416	ATA	2	6	3780	3785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017416	ATT	2	6	3845	3850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017416	ATT	2	6	3946	3951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017416	ATA	2	6	3972	3977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017416	TAA	2	6	3988	3993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017416	TAA	2	6	4133	4138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828036
60	NC_017416	AGA	2	6	4161	4166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828036
61	NC_017416	ATT	2	6	4177	4182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828036
62	NC_017416	AGA	2	6	4206	4211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828036
63	NC_017416	AGA	2	6	4216	4221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828036
64	NC_017416	ATA	2	6	4256	4261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828036
65	NC_017416	ACA	2	6	4429	4434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828036
66	NC_017416	TAA	2	6	4574	4579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828036
67	NC_017416	ATC	2	6	4601	4606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828036
68	NC_017416	AGA	2	6	4626	4631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828036
69	NC_017416	ATC	2	6	4711	4716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828036
70	NC_017416	CAA	2	6	4737	4742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828036
71	NC_017416	AAT	2	6	4747	4752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828036
72	NC_017416	GAT	2	6	4756	4761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387828036
73	NC_017416	CTT	2	6	4784	4789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828036
74	NC_017416	TAG	2	6	4805	4810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387828036
75	NC_017416	TCT	2	6	4883	4888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017416	TAG	2	6	4912	4917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017416	TAA	2	6	4977	4982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017416	TTA	2	6	4983	4988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017416	TTA	2	6	4996	5001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017416	TAA	2	6	5033	5038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017416	TCT	2	6	5041	5046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017416	TTA	2	6	5104	5109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017416	ATT	2	6	5141	5146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017416	TAA	2	6	5175	5180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017416	TAA	2	6	5263	5268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017416	TCA	2	6	5414	5419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017416	GAT	2	6	5453	5458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017416	AGC	2	6	5486	5491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017416	GTA	2	6	5541	5546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017416	AAT	2	6	5556	5561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017416	TAA	2	6	5572	5577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017416	TGA	2	6	5678	5683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017416	AAC	2	6	5723	5728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017416	GAA	3	9	5997	6005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017416	GGC	2	6	6092	6097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017416	TTA	2	6	6333	6338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017416	CCA	2	6	6425	6430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_017416	AAT	2	6	6443	6448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017416	TAA	2	6	6580	6585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017416	ATT	2	6	6700	6705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828037
101	NC_017416	AGA	2	6	6763	6768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828037
102	NC_017416	AGA	2	6	6839	6844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017416	AAT	2	6	7186	7191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017416	AAT	2	6	7221	7226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017416	ATA	2	6	7232	7237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017416	TAT	2	6	7260	7265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017416	AGA	2	6	7349	7354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017416	ATT	2	6	7399	7404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017416	ATT	2	6	7535	7540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017416	ATT	2	6	7576	7581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017416	TGT	2	6	7583	7588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017416	ATG	2	6	7706	7711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017416	AGC	2	6	7716	7721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017416	ACT	2	6	7815	7820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017416	ACA	2	6	7853	7858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017416	ACA	2	6	7870	7875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017416	GAT	2	6	7941	7946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017416	AAC	2	6	8128	8133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828038
119	NC_017416	CAA	2	6	8158	8163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828038
120	NC_017416	AGA	2	6	8231	8236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828038
121	NC_017416	GAA	2	6	8294	8299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828038
122	NC_017416	TAT	2	6	8305	8310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828038
123	NC_017416	TTA	2	6	8342	8347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017416	TAA	2	6	8391	8396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017416	ATT	2	6	8405	8410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017416	TAA	2	6	8428	8433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017416	AAT	2	6	8450	8455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017416	TAA	2	6	8505	8510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017416	TAA	2	6	8639	8644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017416	AGG	2	6	8675	8680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017416	AGA	3	9	8842	8850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
132	NC_017416	CAA	2	6	8864	8869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
133	NC_017416	GAA	2	6	8870	8875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
134	NC_017416	CAA	2	6	8891	8896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
135	NC_017416	GAA	2	6	8897	8902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
136	NC_017416	CAA	2	6	8918	8923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
137	NC_017416	GAA	2	6	8924	8929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
138	NC_017416	CAA	2	6	8945	8950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
139	NC_017416	GAA	2	6	8951	8956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
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