MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp28-4

Total Repeats: 301

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017416	AAC	2	6	411	416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828030
2	NC_017416	TAC	2	6	557	562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828030
3	NC_017416	AAC	2	6	565	570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828030
4	NC_017416	ATT	2	6	576	581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828030
5	NC_017416	AAT	2	6	735	740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828030
6	NC_017416	ATT	2	6	745	750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828030
7	NC_017416	CTA	2	6	778	783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828030
8	NC_017416	ATT	2	6	1062	1067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828031
9	NC_017416	ATT	2	6	1075	1080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828031
10	NC_017416	TTA	2	6	1081	1086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828031
11	NC_017416	AAT	2	6	1120	1125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828031
12	NC_017416	TTA	2	6	1322	1327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828031
13	NC_017416	AGA	2	6	1383	1388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828031
14	NC_017416	ATC	2	6	1475	1480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828031
15	NC_017416	ATA	2	6	1746	1751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828032
16	NC_017416	AAC	2	6	1774	1779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828032
17	NC_017416	ATT	2	6	1834	1839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828032
18	NC_017416	AAT	2	6	1854	1859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828032
19	NC_017416	CAA	2	6	1933	1938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828032
20	NC_017416	ATA	2	6	1977	1982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828032
21	NC_017416	TAT	2	6	2019	2024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828032
22	NC_017416	ACT	2	6	2068	2073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828032
23	NC_017416	ACA	2	6	2099	2104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828032
24	NC_017416	CTA	2	6	2122	2127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828032
25	NC_017416	TAA	2	6	2297	2302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828033
26	NC_017416	ACA	2	6	2321	2326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828033
27	NC_017416	TAG	2	6	2358	2363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387828033
28	NC_017416	ACA	2	6	2408	2413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828033
29	NC_017416	TTA	2	6	2443	2448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828033
30	NC_017416	AAC	2	6	2473	2478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828033
31	NC_017416	TAA	2	6	2493	2498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828033
32	NC_017416	TAC	2	6	2530	2535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828033
33	NC_017416	ACT	2	6	2576	2581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828033
34	NC_017416	TTA	3	9	2884	2892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828034
35	NC_017416	TTA	2	6	3068	3073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828035
36	NC_017416	ACA	2	6	3112	3117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828035
37	NC_017416	AAC	2	6	3121	3126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828035
38	NC_017416	TAA	2	6	3141	3146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828035
39	NC_017416	CAA	2	6	3176	3181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828035
40	NC_017416	CTA	2	6	3339	3344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828035
41	NC_017416	TAA	2	6	4133	4138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828036
42	NC_017416	AGA	2	6	4161	4166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828036
43	NC_017416	ATT	2	6	4177	4182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828036
44	NC_017416	AGA	2	6	4206	4211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828036
45	NC_017416	AGA	2	6	4216	4221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828036
46	NC_017416	ATA	2	6	4256	4261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828036
47	NC_017416	ACA	2	6	4429	4434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828036
48	NC_017416	TAA	2	6	4574	4579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828036
49	NC_017416	ATC	2	6	4601	4606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828036
50	NC_017416	AGA	2	6	4626	4631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828036
51	NC_017416	ATC	2	6	4711	4716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828036
52	NC_017416	CAA	2	6	4737	4742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828036
53	NC_017416	AAT	2	6	4747	4752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828036
54	NC_017416	GAT	2	6	4756	4761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387828036
55	NC_017416	CTT	2	6	4784	4789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828036
56	NC_017416	TAG	2	6	4805	4810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387828036
57	NC_017416	ATT	2	6	6700	6705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828037
58	NC_017416	AGA	2	6	6763	6768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828037
59	NC_017416	AAC	2	6	8128	8133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828038
60	NC_017416	CAA	2	6	8158	8163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828038
61	NC_017416	AGA	2	6	8231	8236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828038
62	NC_017416	GAA	2	6	8294	8299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828038
63	NC_017416	TAT	2	6	8305	8310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828038
64	NC_017416	AGA	3	9	8842	8850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
65	NC_017416	CAA	2	6	8864	8869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
66	NC_017416	GAA	2	6	8870	8875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
67	NC_017416	CAA	2	6	8891	8896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
68	NC_017416	GAA	2	6	8897	8902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
69	NC_017416	CAA	2	6	8918	8923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
70	NC_017416	GAA	2	6	8924	8929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
71	NC_017416	CAA	2	6	8945	8950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
72	NC_017416	GAA	2	6	8951	8956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
73	NC_017416	CAA	2	6	8972	8977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
74	NC_017416	GAA	2	6	8978	8983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
75	NC_017416	CAA	2	6	8999	9004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
76	NC_017416	GAA	2	6	9005	9010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
77	NC_017416	CAA	2	6	9026	9031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
78	NC_017416	GAA	2	6	9032	9037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
79	NC_017416	CAA	2	6	9053	9058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
80	NC_017416	GAA	2	6	9059	9064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
81	NC_017416	CAA	2	6	9080	9085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
82	NC_017416	GAA	2	6	9086	9091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
83	NC_017416	CAA	2	6	9107	9112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
84	NC_017416	GAA	2	6	9113	9118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
85	NC_017416	CAA	2	6	9134	9139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
86	NC_017416	GAA	2	6	9140	9145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
87	NC_017416	CAA	2	6	9161	9166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
88	NC_017416	GAA	2	6	9167	9172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
89	NC_017416	CAA	2	6	9188	9193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
90	NC_017416	GAA	2	6	9194	9199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
91	NC_017416	CAA	2	6	9215	9220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
92	NC_017416	GAA	2	6	9221	9226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
93	NC_017416	CAA	2	6	9242	9247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
94	NC_017416	GAA	2	6	9248	9253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
95	NC_017416	CAA	2	6	9269	9274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
96	NC_017416	GAA	2	6	9275	9280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
97	NC_017416	CAA	2	6	9296	9301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
98	NC_017416	GAA	2	6	9302	9307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
99	NC_017416	CAA	2	6	9323	9328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
100	NC_017416	GAA	2	6	9329	9334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
101	NC_017416	CAA	2	6	9350	9355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
102	NC_017416	GAA	2	6	9356	9361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
103	NC_017416	CAA	2	6	9377	9382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
104	NC_017416	GAA	2	6	9383	9388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
105	NC_017416	CAA	2	6	9404	9409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
106	NC_017416	GAA	2	6	9410	9415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
107	NC_017416	CAA	2	6	9431	9436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
108	NC_017416	GAA	2	6	9437	9442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
109	NC_017416	CAA	2	6	9458	9463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
110	NC_017416	GAA	2	6	9464	9469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
111	NC_017416	CAA	2	6	9485	9490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
112	NC_017416	GAA	2	6	9491	9496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
113	NC_017416	CAA	2	6	9512	9517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
114	NC_017416	GAA	2	6	9518	9523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
115	NC_017416	CAA	2	6	9539	9544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
116	NC_017416	GAA	2	6	9545	9550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
117	NC_017416	CAA	2	6	9566	9571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
118	NC_017416	GAA	2	6	9572	9577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
119	NC_017416	CAA	2	6	9593	9598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
120	NC_017416	GAA	2	6	9599	9604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
121	NC_017416	CAA	2	6	9620	9625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
122	NC_017416	GAA	2	6	9626	9631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
123	NC_017416	CAA	2	6	9647	9652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
124	NC_017416	GAA	2	6	9653	9658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
125	NC_017416	CAA	2	6	9674	9679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
126	NC_017416	GAA	2	6	9680	9685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
127	NC_017416	ACA	2	6	9706	9711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
128	NC_017416	AGA	2	6	9899	9904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
129	NC_017416	ATT	2	6	9962	9967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828039
130	NC_017416	GGA	2	6	10025	10030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387828039
131	NC_017416	TTA	2	6	10175	10180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828039
132	NC_017416	TAA	2	6	10207	10212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828039
133	NC_017416	CAA	2	6	10253	10258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828039
134	NC_017416	AGA	2	6	10279	10284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828039
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.