MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp28-5

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017415	AACT	2	8	253	260	50 %	25 %	0 %	25 %	387828012
2	NC_017415	AGAA	2	8	348	355	75 %	0 %	25 %	0 %	387828012
3	NC_017415	TCAC	2	8	381	388	25 %	25 %	0 %	50 %	387828012
4	NC_017415	CCAA	2	8	624	631	50 %	0 %	0 %	50 %	387828012
5	NC_017415	ATTT	2	8	1463	1470	25 %	75 %	0 %	0 %	387828013
6	NC_017415	TCAA	2	8	1833	1840	50 %	25 %	0 %	25 %	387828013
7	NC_017415	CTTT	2	8	1941	1948	0 %	75 %	0 %	25 %	387828013
8	NC_017415	ATTT	2	8	2293	2300	25 %	75 %	0 %	0 %	387828013
9	NC_017415	TAAT	2	8	2338	2345	50 %	50 %	0 %	0 %	387828013
10	NC_017415	AAAC	2	8	3998	4005	75 %	0 %	0 %	25 %	387828014
11	NC_017415	TTAA	2	8	4313	4320	50 %	50 %	0 %	0 %	387828015
12	NC_017415	TTAA	2	8	6511	6518	50 %	50 %	0 %	0 %	387828016
13	NC_017415	ATCT	2	8	6635	6642	25 %	50 %	0 %	25 %	387828016
14	NC_017415	ATTT	2	8	6689	6696	25 %	75 %	0 %	0 %	387828016
15	NC_017415	TTTA	2	8	7242	7249	25 %	75 %	0 %	0 %	387828016
16	NC_017415	ATTT	2	8	7670	7677	25 %	75 %	0 %	0 %	387828016
17	NC_017415	ACTA	2	8	7767	7774	50 %	25 %	0 %	25 %	387828016
18	NC_017415	TTGT	2	8	7945	7952	0 %	75 %	25 %	0 %	387828016
19	NC_017415	TAAG	2	8	8231	8238	50 %	25 %	25 %	0 %	387828016
20	NC_017415	ATTT	2	8	8430	8437	25 %	75 %	0 %	0 %	387828016
21	NC_017415	AAAG	2	8	8458	8465	75 %	0 %	25 %	0 %	387828016
22	NC_017415	ATAA	2	8	9026	9033	75 %	25 %	0 %	0 %	387828017
23	NC_017415	TATT	2	8	9526	9533	25 %	75 %	0 %	0 %	387828017
24	NC_017415	TTCC	2	8	11349	11356	0 %	50 %	0 %	50 %	387828018
25	NC_017415	GCCC	2	8	11645	11652	0 %	0 %	25 %	75 %	387828019
26	NC_017415	AGAT	2	8	11773	11780	50 %	25 %	25 %	0 %	387828019
27	NC_017415	CAAG	2	8	11844	11851	50 %	0 %	25 %	25 %	387828019
28	NC_017415	CTTG	2	8	11869	11876	0 %	50 %	25 %	25 %	387828019
29	NC_017415	TAAC	2	8	12011	12018	50 %	25 %	0 %	25 %	387828019
30	NC_017415	AAAC	2	8	12054	12061	75 %	0 %	0 %	25 %	387828019
31	NC_017415	TGGC	2	8	12108	12115	0 %	25 %	50 %	25 %	387828019
32	NC_017415	CTTC	2	8	12337	12344	0 %	50 %	0 %	50 %	387828019
33	NC_017415	ATTT	2	8	12664	12671	25 %	75 %	0 %	0 %	387828020
34	NC_017415	TAAG	2	8	12946	12953	50 %	25 %	25 %	0 %	387828020
35	NC_017415	ATCC	2	8	13017	13024	25 %	25 %	0 %	50 %	387828020
36	NC_017415	TTTC	2	8	13050	13057	0 %	75 %	0 %	25 %	387828020
37	NC_017415	TAAT	2	8	13475	13482	50 %	50 %	0 %	0 %	387828021
38	NC_017415	ATTT	2	8	14384	14391	25 %	75 %	0 %	0 %	387828022
39	NC_017415	ATTT	2	8	14466	14473	25 %	75 %	0 %	0 %	387828022
40	NC_017415	TCTT	2	8	14962	14969	0 %	75 %	0 %	25 %	387828023
41	NC_017415	TATT	2	8	14992	14999	25 %	75 %	0 %	0 %	387828023
42	NC_017415	ATAA	2	8	15112	15119	75 %	25 %	0 %	0 %	387828023
43	NC_017415	TATT	2	8	15247	15254	25 %	75 %	0 %	0 %	387828023
44	NC_017415	TAGT	2	8	15421	15428	25 %	50 %	25 %	0 %	387828023
45	NC_017415	ATCT	2	8	16001	16008	25 %	50 %	0 %	25 %	387828024
46	NC_017415	AATA	2	8	16321	16328	75 %	25 %	0 %	0 %	387828024
47	NC_017415	TCTT	2	8	16834	16841	0 %	75 %	0 %	25 %	387828024
48	NC_017415	AAAT	2	8	19992	19999	75 %	25 %	0 %	0 %	387828025
49	NC_017415	AAAT	2	8	20652	20659	75 %	25 %	0 %	0 %	387828025
50	NC_017415	CTAC	2	8	21060	21067	25 %	25 %	0 %	50 %	387828025
51	NC_017415	TTAA	2	8	21424	21431	50 %	50 %	0 %	0 %	387828025
52	NC_017415	TGAT	2	8	21627	21634	25 %	50 %	25 %	0 %	387828026
53	NC_017415	AATG	2	8	22276	22283	50 %	25 %	25 %	0 %	387828026
54	NC_017415	AGAT	2	8	22792	22799	50 %	25 %	25 %	0 %	387828026
55	NC_017415	ATCT	2	8	23522	23529	25 %	50 %	0 %	25 %	387828027
56	NC_017415	AATA	2	8	23842	23849	75 %	25 %	0 %	0 %	387828027
57	NC_017415	TCTT	2	8	24355	24362	0 %	75 %	0 %	25 %	387828027
58	NC_017415	TTGT	2	8	25298	25305	0 %	75 %	25 %	0 %	387828028

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.