MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp28-5

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017415	TAC	2	6	660	665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017415	TGT	2	6	676	681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017415	TTA	2	6	710	715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017415	ATT	2	6	789	794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017415	TAT	3	9	821	829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017415	TAA	2	6	920	925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017415	ATT	2	6	1108	1113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017415	CCA	2	6	1133	1138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017415	CAA	2	6	1143	1148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017415	ATA	2	6	1205	1210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017415	ATT	3	9	1244	1252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017415	ATC	2	6	1342	1347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017415	ATT	2	6	1351	1356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017415	ATT	2	6	1369	1374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017415	AGA	2	6	2488	2493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017415	TGA	2	6	2536	2541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017415	ATT	2	6	2544	2549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017415	TTA	2	6	2580	2585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017415	TTC	2	6	2610	2615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017415	TAT	2	6	2639	2644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017415	TTA	2	6	2908	2913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017415	TAT	2	6	2987	2992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017415	TTC	2	6	3009	3014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017415	CTA	2	6	3020	3025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017415	ATA	2	6	3119	3124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017415	ATA	2	6	3218	3223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017415	GTT	2	6	4141	4146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017415	TGT	2	6	4181	4186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017415	TTG	2	6	4720	4725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017415	TAA	2	6	8648	8653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017415	ATT	2	6	8779	8784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017415	ATA	2	6	8790	8795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017415	TAA	2	6	9723	9728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017415	TAA	2	6	9736	9741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017415	CTT	2	6	9841	9846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017415	TAA	2	6	9876	9881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017415	TAA	2	6	9929	9934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017415	CAT	2	6	9956	9961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017415	AGA	2	6	10027	10032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017415	GAA	2	6	10089	10094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017415	ATA	2	6	10184	10189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017415	GAA	2	6	10200	10205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017415	TAT	2	6	10240	10245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017415	TAT	2	6	10253	10258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017415	CTT	2	6	10303	10308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017415	TAA	2	6	10389	10394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017415	ATA	2	6	12393	12398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017415	CAA	2	6	12451	12456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017415	GTT	2	6	12506	12511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017415	ACA	2	6	12545	12550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017415	AAT	2	6	15655	15660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017415	TTA	3	9	15661	15669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017415	CTT	2	6	15743	15748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017415	TTA	2	6	17085	17090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017415	TAA	2	6	17152	17157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017415	AAT	2	6	19293	19298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017415	TTA	2	6	19328	19333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017415	TGT	2	6	19359	19364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017415	CAA	2	6	19379	19384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017415	AAG	2	6	19492	19497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017415	TTA	2	6	19511	19516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017415	TAA	2	6	19522	19527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017415	AAT	2	6	22873	22878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017415	ATT	2	6	22967	22972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017415	CTT	2	6	23001	23006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017415	TTC	2	6	23014	23019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017415	ATC	2	6	23033	23038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017415	GGA	2	6	23061	23066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017415	CTT	2	6	23186	23191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017415	CTT	2	6	23261	23266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017415	ATG	2	6	24626	24631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017415	CTA	2	6	24638	24643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017415	AAT	2	6	24644	24649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017415	GTT	2	6	25755	25760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017415	CCT	2	6	25761	25766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_017415	TAA	2	6	26017	26022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017415	TAG	2	6	26197	26202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017415	ATA	2	6	26228	26233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017415	ATT	2	6	26240	26245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017415	AAG	2	6	26328	26333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017415	GTT	2	6	26410	26415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017415	TAG	2	6	26416	26421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017415	GTT	2	6	26564	26569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.