MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp28-5

Total Repeats: 273

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017415	TAT	2	6	112	117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828012
2	NC_017415	CCT	2	6	161	166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387828012
3	NC_017415	CTT	2	6	193	198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828012
4	NC_017415	CTC	2	6	230	235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387828012
5	NC_017415	TAT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828012
6	NC_017415	ATA	2	6	300	305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828012
7	NC_017415	AAC	2	6	306	311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828012
8	NC_017415	TTA	2	6	357	362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828012
9	NC_017415	CTC	2	6	368	373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387828012
10	NC_017415	TAC	2	6	395	400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828012
11	NC_017415	ACT	2	6	530	535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828012
12	NC_017415	AAC	2	6	589	594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828012
13	NC_017415	TAT	2	6	611	616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828012
14	NC_017415	TTC	2	6	1439	1444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828013
15	NC_017415	TTA	2	6	1554	1559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828013
16	NC_017415	TAT	2	6	1564	1569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828013
17	NC_017415	TAT	2	6	1586	1591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828013
18	NC_017415	ATT	2	6	1658	1663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828013
19	NC_017415	ATT	2	6	1757	1762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828013
20	NC_017415	TCA	2	6	1875	1880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828013
21	NC_017415	TGA	2	6	1980	1985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387828013
22	NC_017415	CAA	2	6	2029	2034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828013
23	NC_017415	TCT	2	6	2055	2060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828013
24	NC_017415	TTC	2	6	2132	2137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828013
25	NC_017415	TCT	2	6	2174	2179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828013
26	NC_017415	TAG	2	6	2183	2188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387828013
27	NC_017415	TTC	2	6	2219	2224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828013
28	NC_017415	ATT	2	6	2243	2248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828013
29	NC_017415	ATC	2	6	2261	2266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828013
30	NC_017415	CTA	2	6	2284	2289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828013
31	NC_017415	TCT	2	6	2306	2311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828013
32	NC_017415	ATG	2	6	2312	2317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387828013
33	NC_017415	ATA	2	6	2332	2337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828013
34	NC_017415	AAT	2	6	2390	2395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828013
35	NC_017415	ATT	2	6	3319	3324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828014
36	NC_017415	CCA	2	6	3344	3349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387828014
37	NC_017415	CAA	2	6	3364	3369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828014
38	NC_017415	ATA	2	6	3426	3431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828014
39	NC_017415	TAA	2	6	3451	3456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828014
40	NC_017415	AAG	2	6	3501	3506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828014
41	NC_017415	AAC	2	6	3692	3697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828014
42	NC_017415	AAG	2	6	3714	3719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828014
43	NC_017415	ATA	2	6	3734	3739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828014
44	NC_017415	ATT	2	6	3930	3935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828014
45	NC_017415	TAA	2	6	4006	4011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828014
46	NC_017415	TAA	2	6	4051	4056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828014
47	NC_017415	AAT	2	6	4220	4225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828015
48	NC_017415	ATT	2	6	4226	4231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828015
49	NC_017415	CAA	2	6	4247	4252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828015
50	NC_017415	AAT	2	6	4288	4293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828015
51	NC_017415	GAA	2	6	4345	4350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828015
52	NC_017415	GAA	3	9	4364	4372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828015
53	NC_017415	AGA	2	6	4396	4401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828015
54	NC_017415	AGA	2	6	4463	4468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828015
55	NC_017415	CTT	2	6	4795	4800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828016
56	NC_017415	AAT	2	6	4802	4807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828016
57	NC_017415	CTA	2	6	4820	4825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828016
58	NC_017415	TAA	2	6	4859	4864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828016
59	NC_017415	TCT	2	6	4894	4899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828016
60	NC_017415	ATT	2	6	4932	4937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828016
61	NC_017415	TCT	2	6	4999	5004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828016
62	NC_017415	TTC	2	6	5127	5132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828016
63	NC_017415	TCT	2	6	5190	5195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828016
64	NC_017415	ATA	2	6	5233	5238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828016
65	NC_017415	AAT	2	6	5239	5244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828016
66	NC_017415	ATT	2	6	5371	5376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828016
67	NC_017415	GTT	2	6	5404	5409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387828016
68	NC_017415	TCT	2	6	5425	5430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828016
69	NC_017415	ATT	2	6	5538	5543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828016
70	NC_017415	TCT	2	6	5545	5550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828016
71	NC_017415	TTC	2	6	5652	5657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828016
72	NC_017415	TAT	2	6	5673	5678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828016
73	NC_017415	CAC	2	6	5792	5797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387828016
74	NC_017415	TTA	2	6	6026	6031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828016
75	NC_017415	ACT	2	6	6081	6086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828016
76	NC_017415	ATT	2	6	6114	6119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828016
77	NC_017415	ATT	2	6	6123	6128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828016
78	NC_017415	GAT	2	6	6167	6172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387828016
79	NC_017415	GGA	2	6	6289	6294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387828016
80	NC_017415	ACA	2	6	6304	6309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828016
81	NC_017415	GTA	2	6	6360	6365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387828016
82	NC_017415	ATT	2	6	6526	6531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828016
83	NC_017415	TAT	3	9	6602	6610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828016
84	NC_017415	ATG	2	6	6768	6773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387828016
85	NC_017415	TGA	2	6	6786	6791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387828016
86	NC_017415	AAT	2	6	6801	6806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828016
87	NC_017415	TTC	2	6	6936	6941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828016
88	NC_017415	CTT	2	6	6944	6949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828016
89	NC_017415	CTT	2	6	6980	6985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828016
90	NC_017415	AAT	2	6	7031	7036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828016
91	NC_017415	AAC	2	6	7051	7056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828016
92	NC_017415	AAT	2	6	7080	7085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828016
93	NC_017415	CTT	2	6	7251	7256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828016
94	NC_017415	CTT	2	6	7268	7273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828016
95	NC_017415	TAA	2	6	7285	7290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828016
96	NC_017415	AGT	2	6	7317	7322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387828016
97	NC_017415	TAG	2	6	7347	7352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387828016
98	NC_017415	TTC	2	6	7414	7419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828016
99	NC_017415	TTC	2	6	7458	7463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828016
100	NC_017415	ATT	2	6	7491	7496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828016
101	NC_017415	TAT	2	6	7556	7561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828016
102	NC_017415	TAT	2	6	7590	7595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828016
103	NC_017415	TCT	2	6	7678	7683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828016
104	NC_017415	AAT	2	6	7746	7751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828016
105	NC_017415	TTC	2	6	7791	7796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828016
106	NC_017415	TCA	2	6	7855	7860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828016
107	NC_017415	TTC	2	6	8016	8021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828016
108	NC_017415	TTC	2	6	8025	8030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828016
109	NC_017415	TTC	2	6	8166	8171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828016
110	NC_017415	CTT	2	6	8174	8179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828016
111	NC_017415	TAT	2	6	8261	8266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828016
112	NC_017415	CTT	2	6	8276	8281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828016
113	NC_017415	TAT	2	6	8288	8293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828016
114	NC_017415	AGT	2	6	8326	8331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387828016
115	NC_017415	CCA	2	6	8338	8343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387828016
116	NC_017415	TGC	2	6	8374	8379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387828016
117	NC_017415	AAT	2	6	8387	8392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828016
118	NC_017415	TTG	2	6	8438	8443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387828016
119	NC_017415	TCT	2	6	8509	8514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828016
120	NC_017415	AAT	2	6	8827	8832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828017
121	NC_017415	TCA	2	6	8871	8876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828017
122	NC_017415	TAA	2	6	8947	8952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828017
123	NC_017415	TCA	2	6	9006	9011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828017
124	NC_017415	TAA	2	6	9097	9102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828017
125	NC_017415	CAA	2	6	9148	9153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828017
126	NC_017415	TCT	2	6	9225	9230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387828017
127	NC_017415	AAC	2	6	9258	9263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828017
128	NC_017415	TTA	2	6	9360	9365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828017
129	NC_017415	TCG	2	6	9420	9425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387828017
130	NC_017415	AAT	2	6	9428	9433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828017
131	NC_017415	ATT	2	6	9462	9467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828017
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133	NC_017415	GAT	2	6	9594	9599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387828017
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.