MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp28-5

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017415	AT	3	6	639	644	50 %	50 %	0 %	0 %	387828012
2	NC_017415	CA	3	6	876	881	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017415	AT	4	8	1076	1083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017415	AT	3	6	1089	1094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017415	TA	4	8	1098	1105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017415	CT	3	6	2189	2194	0 %	50 %	0 %	50 %	387828013
7	NC_017415	CT	3	6	2213	2218	0 %	50 %	0 %	50 %	387828013
8	NC_017415	TA	3	6	2465	2470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017415	TA	3	6	2482	2487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017415	TA	3	6	2648	2653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017415	AT	3	6	2658	2663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017415	AT	6	12	2863	2874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017415	AT	3	6	3126	3131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017415	AT	3	6	3300	3305	50 %	50 %	0 %	0 %	387828014
15	NC_017415	TA	4	8	3309	3316	50 %	50 %	0 %	0 %	387828014
16	NC_017415	AG	3	6	3445	3450	50 %	0 %	50 %	0 %	387828014
17	NC_017415	AT	3	6	4162	4167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017415	AG	3	6	4208	4213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017415	TG	3	6	4275	4280	0 %	50 %	50 %	0 %	387828015
20	NC_017415	AT	3	6	4834	4839	50 %	50 %	0 %	0 %	387828016
21	NC_017415	AG	3	6	5215	5220	50 %	0 %	50 %	0 %	387828016
22	NC_017415	CT	3	6	6317	6322	0 %	50 %	0 %	50 %	387828016
23	NC_017415	TA	3	6	7653	7658	50 %	50 %	0 %	0 %	387828016
24	NC_017415	AT	3	6	7714	7719	50 %	50 %	0 %	0 %	387828016
25	NC_017415	AT	4	8	7821	7828	50 %	50 %	0 %	0 %	387828016
26	NC_017415	AT	4	8	8053	8060	50 %	50 %	0 %	0 %	387828016
27	NC_017415	TA	3	6	8156	8161	50 %	50 %	0 %	0 %	387828016
28	NC_017415	TG	3	6	8362	8367	0 %	50 %	50 %	0 %	387828016
29	NC_017415	AT	3	6	8552	8557	50 %	50 %	0 %	0 %	387828016
30	NC_017415	CT	3	6	9578	9583	0 %	50 %	0 %	50 %	387828017
31	NC_017415	AT	3	6	9890	9895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017415	TA	3	6	9918	9923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017415	AT	3	6	10266	10271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017415	TA	3	6	11411	11416	50 %	50 %	0 %	0 %	387828019
35	NC_017415	CA	3	6	12723	12728	50 %	0 %	0 %	50 %	387828020
36	NC_017415	AT	3	6	12955	12960	50 %	50 %	0 %	0 %	387828020
37	NC_017415	AT	3	6	13275	13280	50 %	50 %	0 %	0 %	387828021
38	NC_017415	AT	3	6	13610	13615	50 %	50 %	0 %	0 %	387828021
39	NC_017415	TA	3	6	14027	14032	50 %	50 %	0 %	0 %	387828022
40	NC_017415	AT	3	6	14310	14315	50 %	50 %	0 %	0 %	387828022
41	NC_017415	AT	3	6	14415	14420	50 %	50 %	0 %	0 %	387828022
42	NC_017415	AT	3	6	14629	14634	50 %	50 %	0 %	0 %	387828023
43	NC_017415	AT	3	6	14644	14649	50 %	50 %	0 %	0 %	387828023
44	NC_017415	AT	3	6	14884	14889	50 %	50 %	0 %	0 %	387828023
45	NC_017415	TA	3	6	16575	16580	50 %	50 %	0 %	0 %	387828024
46	NC_017415	AT	3	6	16920	16925	50 %	50 %	0 %	0 %	387828024
47	NC_017415	TA	3	6	19793	19798	50 %	50 %	0 %	0 %	387828025
48	NC_017415	TA	3	6	20158	20163	50 %	50 %	0 %	0 %	387828025
49	NC_017415	AT	3	6	20167	20172	50 %	50 %	0 %	0 %	387828025
50	NC_017415	TA	3	6	20453	20458	50 %	50 %	0 %	0 %	387828025
51	NC_017415	TA	3	6	21261	21266	50 %	50 %	0 %	0 %	387828025
52	NC_017415	TA	3	6	21636	21641	50 %	50 %	0 %	0 %	387828026
53	NC_017415	AG	3	6	22027	22032	50 %	0 %	50 %	0 %	387828026
54	NC_017415	AT	3	6	22846	22851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017415	TA	3	6	24096	24101	50 %	50 %	0 %	0 %	387828027
56	NC_017415	AT	3	6	24441	24446	50 %	50 %	0 %	0 %	387828027
57	NC_017415	GT	3	6	25065	25070	0 %	50 %	50 %	0 %	387828028
58	NC_017415	CA	3	6	25727	25732	50 %	0 %	0 %	50 %	387828028
59	NC_017415	AT	3	6	25819	25824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017415	AT	3	6	26277	26282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017415	AT	3	6	26584	26589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.