MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp28-5

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017415	AT	3	6	639	644	50 %	50 %	0 %	0 %	387828012
2	NC_017415	CT	3	6	2189	2194	0 %	50 %	0 %	50 %	387828013
3	NC_017415	CT	3	6	2213	2218	0 %	50 %	0 %	50 %	387828013
4	NC_017415	AT	3	6	3300	3305	50 %	50 %	0 %	0 %	387828014
5	NC_017415	TA	4	8	3309	3316	50 %	50 %	0 %	0 %	387828014
6	NC_017415	AG	3	6	3445	3450	50 %	0 %	50 %	0 %	387828014
7	NC_017415	TG	3	6	4275	4280	0 %	50 %	50 %	0 %	387828015
8	NC_017415	AT	3	6	4834	4839	50 %	50 %	0 %	0 %	387828016
9	NC_017415	AG	3	6	5215	5220	50 %	0 %	50 %	0 %	387828016
10	NC_017415	CT	3	6	6317	6322	0 %	50 %	0 %	50 %	387828016
11	NC_017415	TA	3	6	7653	7658	50 %	50 %	0 %	0 %	387828016
12	NC_017415	AT	3	6	7714	7719	50 %	50 %	0 %	0 %	387828016
13	NC_017415	AT	4	8	7821	7828	50 %	50 %	0 %	0 %	387828016
14	NC_017415	AT	4	8	8053	8060	50 %	50 %	0 %	0 %	387828016
15	NC_017415	TA	3	6	8156	8161	50 %	50 %	0 %	0 %	387828016
16	NC_017415	TG	3	6	8362	8367	0 %	50 %	50 %	0 %	387828016
17	NC_017415	AT	3	6	8552	8557	50 %	50 %	0 %	0 %	387828016
18	NC_017415	CT	3	6	9578	9583	0 %	50 %	0 %	50 %	387828017
19	NC_017415	TA	3	6	11411	11416	50 %	50 %	0 %	0 %	387828019
20	NC_017415	CA	3	6	12723	12728	50 %	0 %	0 %	50 %	387828020
21	NC_017415	AT	3	6	12955	12960	50 %	50 %	0 %	0 %	387828020
22	NC_017415	AT	3	6	13275	13280	50 %	50 %	0 %	0 %	387828021
23	NC_017415	AT	3	6	13610	13615	50 %	50 %	0 %	0 %	387828021
24	NC_017415	TA	3	6	14027	14032	50 %	50 %	0 %	0 %	387828022
25	NC_017415	AT	3	6	14310	14315	50 %	50 %	0 %	0 %	387828022
26	NC_017415	AT	3	6	14415	14420	50 %	50 %	0 %	0 %	387828022
27	NC_017415	AT	3	6	14629	14634	50 %	50 %	0 %	0 %	387828023
28	NC_017415	AT	3	6	14644	14649	50 %	50 %	0 %	0 %	387828023
29	NC_017415	AT	3	6	14884	14889	50 %	50 %	0 %	0 %	387828023
30	NC_017415	TA	3	6	16575	16580	50 %	50 %	0 %	0 %	387828024
31	NC_017415	AT	3	6	16920	16925	50 %	50 %	0 %	0 %	387828024
32	NC_017415	TA	3	6	19793	19798	50 %	50 %	0 %	0 %	387828025
33	NC_017415	TA	3	6	20158	20163	50 %	50 %	0 %	0 %	387828025
34	NC_017415	AT	3	6	20167	20172	50 %	50 %	0 %	0 %	387828025
35	NC_017415	TA	3	6	20453	20458	50 %	50 %	0 %	0 %	387828025
36	NC_017415	TA	3	6	21261	21266	50 %	50 %	0 %	0 %	387828025
37	NC_017415	TA	3	6	21636	21641	50 %	50 %	0 %	0 %	387828026
38	NC_017415	AG	3	6	22027	22032	50 %	0 %	50 %	0 %	387828026
39	NC_017415	TA	3	6	24096	24101	50 %	50 %	0 %	0 %	387828027
40	NC_017415	AT	3	6	24441	24446	50 %	50 %	0 %	0 %	387828027
41	NC_017415	GT	3	6	25065	25070	0 %	50 %	50 %	0 %	387828028
42	NC_017415	CA	3	6	25727	25732	50 %	0 %	0 %	50 %	387828028

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.