MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp28-5

Total Repeats: 214

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017415	T	6	6	291	296	0 %	100 %	0 %	0 %	387828012
2	NC_017415	T	6	6	438	443	0 %	100 %	0 %	0 %	387828012
3	NC_017415	A	7	7	548	554	100 %	0 %	0 %	0 %	387828012
4	NC_017415	A	6	6	899	904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017415	A	6	6	924	929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017415	T	6	6	1123	1128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017415	A	7	7	1174	1180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017415	T	6	6	1230	1235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017415	T	6	6	1384	1389	0 %	100 %	0 %	0 %	387828013
10	NC_017415	T	7	7	1823	1829	0 %	100 %	0 %	0 %	387828013
11	NC_017415	T	8	8	1946	1953	0 %	100 %	0 %	0 %	387828013
12	NC_017415	A	7	7	2033	2039	100 %	0 %	0 %	0 %	387828013
13	NC_017415	T	9	9	2065	2073	0 %	100 %	0 %	0 %	387828013
14	NC_017415	T	9	9	2234	2242	0 %	100 %	0 %	0 %	387828013
15	NC_017415	A	6	6	2352	2357	100 %	0 %	0 %	0 %	387828013
16	NC_017415	T	7	7	2405	2411	0 %	100 %	0 %	0 %	387828013
17	NC_017415	A	7	7	2412	2418	100 %	0 %	0 %	0 %	387828013
18	NC_017415	T	6	6	2433	2438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017415	T	8	8	2671	2678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017415	T	9	9	2938	2946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017415	A	7	7	2947	2953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017415	T	6	6	3048	3053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017415	T	6	6	3207	3212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017415	A	7	7	3223	3229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017415	A	6	6	3278	3283	100 %	0 %	0 %	0 %	387828014
26	NC_017415	T	6	6	3334	3339	0 %	100 %	0 %	0 %	387828014
27	NC_017415	A	7	7	3395	3401	100 %	0 %	0 %	0 %	387828014
28	NC_017415	A	6	6	3574	3579	100 %	0 %	0 %	0 %	387828014
29	NC_017415	T	6	6	3630	3635	0 %	100 %	0 %	0 %	387828014
30	NC_017415	A	8	8	3765	3772	100 %	0 %	0 %	0 %	387828014
31	NC_017415	T	6	6	3888	3893	0 %	100 %	0 %	0 %	387828014
32	NC_017415	A	6	6	3950	3955	100 %	0 %	0 %	0 %	387828014
33	NC_017415	A	7	7	4384	4390	100 %	0 %	0 %	0 %	387828015
34	NC_017415	A	9	9	4406	4414	100 %	0 %	0 %	0 %	387828015
35	NC_017415	A	6	6	4493	4498	100 %	0 %	0 %	0 %	387828015
36	NC_017415	T	6	6	4632	4637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017415	T	7	7	4711	4717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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39	NC_017415	T	6	6	5083	5088	0 %	100 %	0 %	0 %	387828016
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41	NC_017415	T	7	7	5415	5421	0 %	100 %	0 %	0 %	387828016
42	NC_017415	A	6	6	5478	5483	100 %	0 %	0 %	0 %	387828016
43	NC_017415	A	7	7	5519	5525	100 %	0 %	0 %	0 %	387828016
44	NC_017415	T	6	6	5755	5760	0 %	100 %	0 %	0 %	387828016
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53	NC_017415	T	6	6	6706	6711	0 %	100 %	0 %	0 %	387828016
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67	NC_017415	T	7	7	8514	8520	0 %	100 %	0 %	0 %	387828016
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69	NC_017415	A	6	6	8685	8690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017415	A	6	6	8800	8805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017415	A	7	7	8816	8822	100 %	0 %	0 %	0 %	387828017
72	NC_017415	C	7	7	9043	9049	0 %	0 %	0 %	100 %	387828017
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77	NC_017415	A	6	6	9727	9732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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89	NC_017415	A	6	6	12536	12541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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106	NC_017415	T	7	7	14459	14465	0 %	100 %	0 %	0 %	387828022
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112	NC_017415	T	6	6	15082	15087	0 %	100 %	0 %	0 %	387828023
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116	NC_017415	T	7	7	15334	15340	0 %	100 %	0 %	0 %	387828023
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134	NC_017415	T	6	6	17529	17534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017415	T	7	7	17596	17602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_017415	T	6	6	18719	18724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.