MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp28-5

Total Repeats: 136

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017415	T	6	6	291	296	0 %	100 %	0 %	0 %	387828012
2	NC_017415	T	6	6	438	443	0 %	100 %	0 %	0 %	387828012
3	NC_017415	A	7	7	548	554	100 %	0 %	0 %	0 %	387828012
4	NC_017415	T	6	6	1384	1389	0 %	100 %	0 %	0 %	387828013
5	NC_017415	T	7	7	1823	1829	0 %	100 %	0 %	0 %	387828013
6	NC_017415	T	8	8	1946	1953	0 %	100 %	0 %	0 %	387828013
7	NC_017415	A	7	7	2033	2039	100 %	0 %	0 %	0 %	387828013
8	NC_017415	T	9	9	2065	2073	0 %	100 %	0 %	0 %	387828013
9	NC_017415	T	9	9	2234	2242	0 %	100 %	0 %	0 %	387828013
10	NC_017415	A	6	6	2352	2357	100 %	0 %	0 %	0 %	387828013
11	NC_017415	T	7	7	2405	2411	0 %	100 %	0 %	0 %	387828013
12	NC_017415	A	7	7	2412	2418	100 %	0 %	0 %	0 %	387828013
13	NC_017415	A	6	6	3278	3283	100 %	0 %	0 %	0 %	387828014
14	NC_017415	T	6	6	3334	3339	0 %	100 %	0 %	0 %	387828014
15	NC_017415	A	7	7	3395	3401	100 %	0 %	0 %	0 %	387828014
16	NC_017415	A	6	6	3574	3579	100 %	0 %	0 %	0 %	387828014
17	NC_017415	T	6	6	3630	3635	0 %	100 %	0 %	0 %	387828014
18	NC_017415	A	8	8	3765	3772	100 %	0 %	0 %	0 %	387828014
19	NC_017415	T	6	6	3888	3893	0 %	100 %	0 %	0 %	387828014
20	NC_017415	A	6	6	3950	3955	100 %	0 %	0 %	0 %	387828014
21	NC_017415	A	7	7	4384	4390	100 %	0 %	0 %	0 %	387828015
22	NC_017415	A	9	9	4406	4414	100 %	0 %	0 %	0 %	387828015
23	NC_017415	A	6	6	4493	4498	100 %	0 %	0 %	0 %	387828015
24	NC_017415	T	6	6	4848	4853	0 %	100 %	0 %	0 %	387828016
25	NC_017415	T	6	6	5083	5088	0 %	100 %	0 %	0 %	387828016
26	NC_017415	T	6	6	5244	5249	0 %	100 %	0 %	0 %	387828016
27	NC_017415	T	7	7	5415	5421	0 %	100 %	0 %	0 %	387828016
28	NC_017415	A	6	6	5478	5483	100 %	0 %	0 %	0 %	387828016
29	NC_017415	A	7	7	5519	5525	100 %	0 %	0 %	0 %	387828016
30	NC_017415	T	6	6	5755	5760	0 %	100 %	0 %	0 %	387828016
31	NC_017415	T	6	6	5897	5902	0 %	100 %	0 %	0 %	387828016
32	NC_017415	A	7	7	6060	6066	100 %	0 %	0 %	0 %	387828016
33	NC_017415	T	6	6	6137	6142	0 %	100 %	0 %	0 %	387828016
34	NC_017415	A	7	7	6251	6257	100 %	0 %	0 %	0 %	387828016
35	NC_017415	A	6	6	6351	6356	100 %	0 %	0 %	0 %	387828016
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40	NC_017415	A	6	6	6720	6725	100 %	0 %	0 %	0 %	387828016
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42	NC_017415	T	6	6	7183	7188	0 %	100 %	0 %	0 %	387828016
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54	NC_017415	A	7	7	8816	8822	100 %	0 %	0 %	0 %	387828017
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107	NC_017415	T	7	7	20286	20292	0 %	100 %	0 %	0 %	387828025
108	NC_017415	A	7	7	20316	20322	100 %	0 %	0 %	0 %	387828025
109	NC_017415	A	7	7	20328	20334	100 %	0 %	0 %	0 %	387828025
110	NC_017415	A	6	6	20387	20392	100 %	0 %	0 %	0 %	387828025
111	NC_017415	A	6	6	20464	20469	100 %	0 %	0 %	0 %	387828025
112	NC_017415	A	6	6	20756	20761	100 %	0 %	0 %	0 %	387828025
113	NC_017415	A	7	7	20886	20892	100 %	0 %	0 %	0 %	387828025
114	NC_017415	A	7	7	20910	20916	100 %	0 %	0 %	0 %	387828025
115	NC_017415	A	6	6	20918	20923	100 %	0 %	0 %	0 %	387828025
116	NC_017415	A	8	8	20931	20938	100 %	0 %	0 %	0 %	387828025
117	NC_017415	A	7	7	20960	20966	100 %	0 %	0 %	0 %	387828025
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119	NC_017415	A	7	7	20998	21004	100 %	0 %	0 %	0 %	387828025
120	NC_017415	A	7	7	21906	21912	100 %	0 %	0 %	0 %	387828026
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123	NC_017415	A	6	6	22304	22309	100 %	0 %	0 %	0 %	387828026
124	NC_017415	A	7	7	22400	22406	100 %	0 %	0 %	0 %	387828026
125	NC_017415	T	6	6	23794	23799	0 %	100 %	0 %	0 %	387828027
126	NC_017415	T	6	6	23817	23822	0 %	100 %	0 %	0 %	387828027
127	NC_017415	T	6	6	23836	23841	0 %	100 %	0 %	0 %	387828027
128	NC_017415	T	6	6	23925	23930	0 %	100 %	0 %	0 %	387828027
129	NC_017415	T	7	7	24124	24130	0 %	100 %	0 %	0 %	387828027
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132	NC_017415	A	6	6	24286	24291	100 %	0 %	0 %	0 %	387828027
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.