MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp36

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017414	TAACTT	2	12	51	62	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017414	ATTTTG	2	12	2377	2388	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017414	TTTTCT	2	12	4305	4316	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387826910
4	NC_017414	ACTATA	2	12	4771	4782	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017414	TTAATA	2	12	6395	6406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017414	CATATA	2	12	7925	7936	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387826913
7	NC_017414	TCTTAA	2	12	9758	9769	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017414	GTTTAT	2	12	9989	10000	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387826914
9	NC_017414	AAAAGA	2	12	10143	10154	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387826914
10	NC_017414	CAAGAG	2	12	10505	10516	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017414	AATCAA	2	12	11317	11328	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387826915
12	NC_017414	TAAAAA	2	12	14176	14187	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387826918
13	NC_017414	TAAACA	2	12	15232	15243	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017414	TCAAAA	2	12	17273	17284	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017414	AGAGGA	2	12	18297	18308	50 %	0 %	50 %	0 %	387826922
16	NC_017414	AGATGA	2	12	18327	18338	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387826922
17	NC_017414	AATTTA	2	12	19404	19415	50 %	50 %	0 %	0 %	387826924
18	NC_017414	AGCATT	2	12	21795	21806	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017414	AGCATT	2	12	21933	21944	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017414	TCAGCA	2	12	22249	22260	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017414	ATCATT	2	12	22390	22401	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017414	CACCAT	2	12	22527	22538	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017414	CAGCAC	2	12	22629	22640	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017414	ATCAGC	2	12	23300	23311	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017414	ATCAGC	2	12	23661	23672	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017414	CCATTC	2	12	23872	23883	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017414	AGCACC	2	12	24186	24197	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017414	AGCCCC	2	12	24198	24209	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_017414	TCAGCA	2	12	24400	24411	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017414	TCAGCA	2	12	25252	25263	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017414	AGCACC	2	12	26950	26961	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017414	CATTCC	2	12	27276	27287	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017414	ATCAGC	2	12	27595	27606	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017414	AGCACC	2	12	27700	27711	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017414	ATCAGC	2	12	27853	27864	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017414	CCATTC	2	12	28106	28117	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017414	ATCATT	2	12	28261	28272	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017414	TCAGCA	2	12	28760	28771	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017414	ATCAGC	2	12	28876	28887	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.