MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp36

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017414	TATAA	2	10	742	751	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017414	TAATA	2	10	755	764	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017414	AAATT	2	10	826	835	60 %	40 %	0 %	0 %	387826908
4	NC_017414	ATTGA	2	10	1644	1653	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017414	TAAAC	2	10	1656	1665	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017414	TTCTT	2	10	7942	7951	0 %	80 %	0 %	20 %	387826913
7	NC_017414	TGTTT	2	10	8514	8523	0 %	80 %	20 %	0 %	387826913
8	NC_017414	TTAAT	2	10	8562	8571	40 %	60 %	0 %	0 %	387826913
9	NC_017414	ATTTA	2	10	9659	9668	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017414	ATTTT	2	10	9956	9965	20 %	80 %	0 %	0 %	387826914
11	NC_017414	ACACT	2	10	10127	10136	40 %	20 %	0 %	40 %	387826914
12	NC_017414	GAAAA	2	10	10578	10587	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017414	AATAA	2	10	10620	10629	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017414	ATTTT	2	10	11445	11454	20 %	80 %	0 %	0 %	387826915
15	NC_017414	ATTGA	2	10	11770	11779	40 %	40 %	20 %	0 %	387826916
16	NC_017414	TATTT	2	10	11951	11960	20 %	80 %	0 %	0 %	387826916
17	NC_017414	TTATT	2	10	12277	12286	20 %	80 %	0 %	0 %	387826917
18	NC_017414	AGAAT	2	10	13327	13336	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017414	TCTTT	2	10	14515	14524	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017414	AAGAA	2	10	15318	15327	80 %	0 %	20 %	0 %	387826920
21	NC_017414	TTTAT	2	10	15839	15848	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017414	AAGAA	2	10	15862	15871	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017414	GTAAT	2	10	15888	15897	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017414	TTAGT	2	10	17625	17634	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017414	ATGAA	2	10	17828	17837	60 %	20 %	20 %	0 %	387826922
26	NC_017414	AGAAA	2	10	18094	18103	80 %	0 %	20 %	0 %	387826922
27	NC_017414	TATTT	2	10	18832	18841	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017414	ATCAA	2	10	19117	19126	60 %	20 %	0 %	20 %	387826923
29	NC_017414	TACTA	2	10	19321	19330	40 %	40 %	0 %	20 %	387826924
30	NC_017414	GATAA	2	10	19711	19720	60 %	20 %	20 %	0 %	387826925
31	NC_017414	ATCTT	2	10	19898	19907	20 %	60 %	0 %	20 %	387826925
32	NC_017414	TTCTC	2	10	20158	20167	0 %	60 %	0 %	40 %	387826925
33	NC_017414	CTTTT	3	15	20236	20250	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.