MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp36

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017414	AGTT	2	8	571	578	25 %	50 %	25 %	0 %	387826907
2	NC_017414	ATGG	2	8	780	787	25 %	25 %	50 %	0 %	387826908
3	NC_017414	AAAT	2	8	1371	1378	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017414	CAAA	2	8	1441	1448	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017414	TATT	2	8	1718	1725	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017414	GATT	2	8	2039	2046	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017414	ATTC	2	8	2289	2296	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017414	TATT	2	8	2331	2338	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017414	CAAA	2	8	2501	2508	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017414	CTCA	2	8	2815	2822	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017414	ATTA	2	8	3145	3152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017414	TAAT	2	8	4114	4121	50 %	50 %	0 %	0 %	387826909
13	NC_017414	AAAG	2	8	4195	4202	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017414	TAAG	2	8	4247	4254	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017414	TATT	2	8	4354	4361	25 %	75 %	0 %	0 %	387826910
16	NC_017414	TAAT	2	8	5161	5168	50 %	50 %	0 %	0 %	387826911
17	NC_017414	TAAT	2	8	5891	5898	50 %	50 %	0 %	0 %	387826912
18	NC_017414	ATTT	2	8	6376	6383	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017414	TTTA	2	8	6714	6721	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017414	ATTT	2	8	6758	6765	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017414	TAAA	2	8	6784	6791	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017414	ATAA	2	8	6876	6883	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017414	TAAA	2	8	7382	7389	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017414	GCTA	2	8	7564	7571	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017414	TATT	2	8	7592	7599	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017414	TAAA	2	8	7664	7671	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017414	ATAA	2	8	7765	7772	75 %	25 %	0 %	0 %	387826913
28	NC_017414	ATTT	2	8	7776	7783	25 %	75 %	0 %	0 %	387826913
29	NC_017414	ATAA	2	8	8060	8067	75 %	25 %	0 %	0 %	387826913
30	NC_017414	TAAA	2	8	8259	8266	75 %	25 %	0 %	0 %	387826913
31	NC_017414	GAAG	2	8	8435	8442	50 %	0 %	50 %	0 %	387826913
32	NC_017414	GCAT	2	8	8624	8631	25 %	25 %	25 %	25 %	387826913
33	NC_017414	ATAA	2	8	8726	8733	75 %	25 %	0 %	0 %	387826913
34	NC_017414	TGAT	2	8	8919	8926	25 %	50 %	25 %	0 %	387826913
35	NC_017414	ATAA	2	8	9620	9627	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017414	AATA	2	8	9705	9712	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017414	TTGT	2	8	9745	9752	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017414	ATTA	2	8	9777	9784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017414	AAAT	2	8	9855	9862	75 %	25 %	0 %	0 %	387826914
40	NC_017414	TAGA	2	8	10521	10528	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017414	TAAT	2	8	10834	10841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017414	TTTC	2	8	10984	10991	0 %	75 %	0 %	25 %	387826915
43	NC_017414	AAAT	2	8	11431	11438	75 %	25 %	0 %	0 %	387826915
44	NC_017414	ATCA	2	8	11564	11571	50 %	25 %	0 %	25 %	387826915
45	NC_017414	ATTT	2	8	11688	11695	25 %	75 %	0 %	0 %	387826915
46	NC_017414	AAAT	2	8	11989	11996	75 %	25 %	0 %	0 %	387826916
47	NC_017414	AAGT	2	8	12036	12043	50 %	25 %	25 %	0 %	387826916
48	NC_017414	TTTG	2	8	12058	12065	0 %	75 %	25 %	0 %	387826916
49	NC_017414	ACTA	2	8	12076	12083	50 %	25 %	0 %	25 %	387826916
50	NC_017414	AAGA	2	8	12543	12550	75 %	0 %	25 %	0 %	387826917
51	NC_017414	CTTT	2	8	12640	12647	0 %	75 %	0 %	25 %	387826917
52	NC_017414	TCTT	2	8	12666	12673	0 %	75 %	0 %	25 %	387826917
53	NC_017414	TTTA	2	8	13007	13014	25 %	75 %	0 %	0 %	387826917
54	NC_017414	AATA	2	8	13337	13344	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017414	GAAA	2	8	13645	13652	75 %	0 %	25 %	0 %	387826918
56	NC_017414	AAAT	2	8	14043	14050	75 %	25 %	0 %	0 %	387826918
57	NC_017414	ACAA	2	8	14066	14073	75 %	0 %	0 %	25 %	387826918
58	NC_017414	AATA	2	8	14240	14247	75 %	25 %	0 %	0 %	387826918
59	NC_017414	TTAA	2	8	14276	14283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017414	TAAT	2	8	14441	14448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017414	TATT	2	8	14614	14621	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017414	ATTT	2	8	14711	14718	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017414	TAAT	2	8	15026	15033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017414	CTTA	2	8	15600	15607	25 %	50 %	0 %	25 %	387826920
65	NC_017414	TACA	2	8	16604	16611	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017414	TTTA	2	8	16672	16679	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017414	ACTC	2	8	16716	16723	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017414	TTTA	2	8	16938	16945	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017414	TCCT	2	8	17056	17063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017414	TTTA	2	8	17490	17497	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017414	AAAG	2	8	17583	17590	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017414	ATAA	2	8	17608	17615	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017414	AGAA	2	8	17941	17948	75 %	0 %	25 %	0 %	387826922
74	NC_017414	AAGT	2	8	18602	18609	50 %	25 %	25 %	0 %	387826922
75	NC_017414	AGTA	2	8	19034	19041	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017414	ATTT	2	8	19346	19353	25 %	75 %	0 %	0 %	387826924
77	NC_017414	TCTG	2	8	19865	19872	0 %	50 %	25 %	25 %	387826925
78	NC_017414	ATAA	2	8	19942	19949	75 %	25 %	0 %	0 %	387826925
79	NC_017414	CTTT	2	8	20124	20131	0 %	75 %	0 %	25 %	387826925
80	NC_017414	GCTT	2	8	20471	20478	0 %	50 %	25 %	25 %	387826926
81	NC_017414	ATGC	2	8	20987	20994	25 %	25 %	25 %	25 %	387826927
82	NC_017414	TTGC	2	8	21168	21175	0 %	50 %	25 %	25 %	387826927
83	NC_017414	ATTT	2	8	21519	21526	25 %	75 %	0 %	0 %	387826927
84	NC_017414	TAGA	2	8	29103	29110	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.