MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp36

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017414	AGTT	2	8	571	578	25 %	50 %	25 %	0 %	387826907
2	NC_017414	ATGG	2	8	780	787	25 %	25 %	50 %	0 %	387826908
3	NC_017414	TAAT	2	8	4114	4121	50 %	50 %	0 %	0 %	387826909
4	NC_017414	TATT	2	8	4354	4361	25 %	75 %	0 %	0 %	387826910
5	NC_017414	TAAT	2	8	5161	5168	50 %	50 %	0 %	0 %	387826911
6	NC_017414	TAAT	2	8	5891	5898	50 %	50 %	0 %	0 %	387826912
7	NC_017414	ATAA	2	8	7765	7772	75 %	25 %	0 %	0 %	387826913
8	NC_017414	ATTT	2	8	7776	7783	25 %	75 %	0 %	0 %	387826913
9	NC_017414	ATAA	2	8	8060	8067	75 %	25 %	0 %	0 %	387826913
10	NC_017414	TAAA	2	8	8259	8266	75 %	25 %	0 %	0 %	387826913
11	NC_017414	GAAG	2	8	8435	8442	50 %	0 %	50 %	0 %	387826913
12	NC_017414	GCAT	2	8	8624	8631	25 %	25 %	25 %	25 %	387826913
13	NC_017414	ATAA	2	8	8726	8733	75 %	25 %	0 %	0 %	387826913
14	NC_017414	TGAT	2	8	8919	8926	25 %	50 %	25 %	0 %	387826913
15	NC_017414	AAAT	2	8	9855	9862	75 %	25 %	0 %	0 %	387826914
16	NC_017414	TTTC	2	8	10984	10991	0 %	75 %	0 %	25 %	387826915
17	NC_017414	AAAT	2	8	11431	11438	75 %	25 %	0 %	0 %	387826915
18	NC_017414	ATCA	2	8	11564	11571	50 %	25 %	0 %	25 %	387826915
19	NC_017414	ATTT	2	8	11688	11695	25 %	75 %	0 %	0 %	387826915
20	NC_017414	AAAT	2	8	11989	11996	75 %	25 %	0 %	0 %	387826916
21	NC_017414	AAGT	2	8	12036	12043	50 %	25 %	25 %	0 %	387826916
22	NC_017414	TTTG	2	8	12058	12065	0 %	75 %	25 %	0 %	387826916
23	NC_017414	ACTA	2	8	12076	12083	50 %	25 %	0 %	25 %	387826916
24	NC_017414	AAGA	2	8	12543	12550	75 %	0 %	25 %	0 %	387826917
25	NC_017414	CTTT	2	8	12640	12647	0 %	75 %	0 %	25 %	387826917
26	NC_017414	TCTT	2	8	12666	12673	0 %	75 %	0 %	25 %	387826917
27	NC_017414	TTTA	2	8	13007	13014	25 %	75 %	0 %	0 %	387826917
28	NC_017414	GAAA	2	8	13645	13652	75 %	0 %	25 %	0 %	387826918
29	NC_017414	AAAT	2	8	14043	14050	75 %	25 %	0 %	0 %	387826918
30	NC_017414	ACAA	2	8	14066	14073	75 %	0 %	0 %	25 %	387826918
31	NC_017414	AATA	2	8	14240	14247	75 %	25 %	0 %	0 %	387826918
32	NC_017414	CTTA	2	8	15600	15607	25 %	50 %	0 %	25 %	387826920
33	NC_017414	AGAA	2	8	17941	17948	75 %	0 %	25 %	0 %	387826922
34	NC_017414	AAGT	2	8	18602	18609	50 %	25 %	25 %	0 %	387826922
35	NC_017414	ATTT	2	8	19346	19353	25 %	75 %	0 %	0 %	387826924
36	NC_017414	TCTG	2	8	19865	19872	0 %	50 %	25 %	25 %	387826925
37	NC_017414	ATAA	2	8	19942	19949	75 %	25 %	0 %	0 %	387826925
38	NC_017414	CTTT	2	8	20124	20131	0 %	75 %	0 %	25 %	387826925
39	NC_017414	GCTT	2	8	20471	20478	0 %	50 %	25 %	25 %	387826926
40	NC_017414	ATGC	2	8	20987	20994	25 %	25 %	25 %	25 %	387826927
41	NC_017414	TTGC	2	8	21168	21175	0 %	50 %	25 %	25 %	387826927
42	NC_017414	ATTT	2	8	21519	21526	25 %	75 %	0 %	0 %	387826927

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.