MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp36

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017414	TA	3	6	261	266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017414	AT	3	6	450	455	50 %	50 %	0 %	0 %	387826907
3	NC_017414	AT	3	6	695	700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017414	TA	3	6	1185	1190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017414	AT	3	6	1383	1388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017414	TA	3	6	1598	1603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017414	AT	3	6	2421	2426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017414	AT	3	6	3958	3963	50 %	50 %	0 %	0 %	387826909
9	NC_017414	TA	5	10	5534	5543	50 %	50 %	0 %	0 %	387826911
10	NC_017414	GT	3	6	5560	5565	0 %	50 %	50 %	0 %	387826911
11	NC_017414	AT	4	8	5978	5985	50 %	50 %	0 %	0 %	387826912
12	NC_017414	AT	3	6	6306	6311	50 %	50 %	0 %	0 %	387826912
13	NC_017414	AT	3	6	6353	6358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017414	AG	3	6	7297	7302	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017414	TA	3	6	7631	7636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017414	AT	3	6	9259	9264	50 %	50 %	0 %	0 %	387826913
17	NC_017414	TG	3	6	9527	9532	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017414	TA	3	6	9813	9818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017414	AT	4	8	10357	10364	50 %	50 %	0 %	0 %	387826914
20	NC_017414	TA	3	6	11057	11062	50 %	50 %	0 %	0 %	387826915
21	NC_017414	TA	3	6	11869	11874	50 %	50 %	0 %	0 %	387826916
22	NC_017414	TA	4	8	12571	12578	50 %	50 %	0 %	0 %	387826917
23	NC_017414	TA	3	6	12595	12600	50 %	50 %	0 %	0 %	387826917
24	NC_017414	TA	4	8	12748	12755	50 %	50 %	0 %	0 %	387826917
25	NC_017414	TC	3	6	12880	12885	0 %	50 %	0 %	50 %	387826917
26	NC_017414	TG	3	6	13143	13148	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017414	TA	3	6	13173	13178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017414	TA	3	6	13405	13410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017414	AT	3	6	13511	13516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017414	AT	3	6	14009	14014	50 %	50 %	0 %	0 %	387826918
31	NC_017414	CT	3	6	14452	14457	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017414	TA	3	6	14540	14545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017414	TA	3	6	14823	14828	50 %	50 %	0 %	0 %	387826919
34	NC_017414	TA	3	6	15677	15682	50 %	50 %	0 %	0 %	387826920
35	NC_017414	AT	3	6	15778	15783	50 %	50 %	0 %	0 %	387826920
36	NC_017414	AG	3	6	15953	15958	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017414	TA	3	6	16011	16016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017414	AT	3	6	16119	16124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017414	TA	3	6	16191	16196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017414	AT	3	6	16631	16636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017414	AT	3	6	17233	17238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017414	GA	3	6	17742	17747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017414	AT	3	6	18448	18453	50 %	50 %	0 %	0 %	387826922
44	NC_017414	AC	3	6	18644	18649	50 %	0 %	0 %	50 %	387826922
45	NC_017414	TA	3	6	19429	19434	50 %	50 %	0 %	0 %	387826924
46	NC_017414	GT	3	6	19971	19976	0 %	50 %	50 %	0 %	387826925
47	NC_017414	CT	3	6	20152	20157	0 %	50 %	0 %	50 %	387826925
48	NC_017414	TG	3	6	20502	20507	0 %	50 %	50 %	0 %	387826926
49	NC_017414	AG	3	6	20797	20802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017414	TA	3	6	20857	20862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017414	AT	3	6	20916	20921	50 %	50 %	0 %	0 %	387826927

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.