MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp38

Total Repeats: 14

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017413	TCAAAT	2	12	111	122	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017413	TTTTCT	2	12	409	420	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017413	ATTTAG	2	12	441	452	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017413	TTTCTT	2	12	587	598	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017413	CTTTGT	2	12	3776	3787	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017413	TATTAA	2	12	4121	4132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017413	TAAAAA	2	12	5095	5106	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017413	ACTGCT	2	12	8119	8130	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017413	AATTTA	2	12	11661	11672	50 %	50 %	0 %	0 %	387826541
10	NC_017413	AGTTTT	2	12	12238	12249	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387826542
11	NC_017413	ATTTAG	2	12	13910	13921	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387826544
12	NC_017413	TTAAAA	2	12	23195	23206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017413	TTTAGA	2	12	24118	24129	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387826548
14	NC_017413	CTATAT	2	12	24583	24594	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387826549

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.