MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp38

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017413	TATT	2	8	4448	4455	25 %	75 %	0 %	0 %	387826533
2	NC_017413	TAAT	2	8	4876	4883	50 %	50 %	0 %	0 %	387826534
3	NC_017413	TAAA	2	8	6609	6616	75 %	25 %	0 %	0 %	387826536
4	NC_017413	AGGA	2	8	6621	6628	50 %	0 %	50 %	0 %	387826536
5	NC_017413	TAAA	2	8	7301	7308	75 %	25 %	0 %	0 %	387826537
6	NC_017413	GCTT	2	8	7674	7681	0 %	50 %	25 %	25 %	387826537
7	NC_017413	CCGC	2	8	8806	8813	0 %	0 %	25 %	75 %	387826538
8	NC_017413	TATT	2	8	9878	9885	25 %	75 %	0 %	0 %	387826539
9	NC_017413	TAAT	2	8	10376	10383	50 %	50 %	0 %	0 %	387826540
10	NC_017413	TAAA	2	8	10388	10395	75 %	25 %	0 %	0 %	387826540
11	NC_017413	ATAA	2	8	10510	10517	75 %	25 %	0 %	0 %	387826540
12	NC_017413	CTTT	2	8	11066	11073	0 %	75 %	0 %	25 %	387826540
13	NC_017413	TACT	2	8	11146	11153	25 %	50 %	0 %	25 %	387826540
14	NC_017413	TAAA	2	8	11249	11256	75 %	25 %	0 %	0 %	387826540
15	NC_017413	ATAA	2	8	11357	11364	75 %	25 %	0 %	0 %	387826541
16	NC_017413	AGAA	2	8	11374	11381	75 %	0 %	25 %	0 %	387826541
17	NC_017413	TTTA	2	8	11527	11534	25 %	75 %	0 %	0 %	387826541
18	NC_017413	ATGG	2	8	11580	11587	25 %	25 %	50 %	0 %	387826541
19	NC_017413	TTTG	2	8	12176	12183	0 %	75 %	25 %	0 %	387826542
20	NC_017413	TAAT	2	8	12497	12504	50 %	50 %	0 %	0 %	387826542
21	NC_017413	ATCA	2	8	13779	13786	50 %	25 %	0 %	25 %	387826544
22	NC_017413	ATAA	2	8	14602	14609	75 %	25 %	0 %	0 %	387826545
23	NC_017413	GAAA	2	8	23105	23112	75 %	0 %	25 %	0 %	387826546
24	NC_017413	AAAT	2	8	23552	23559	75 %	25 %	0 %	0 %	387826547
25	NC_017413	AAAT	2	8	23594	23601	75 %	25 %	0 %	0 %	387826547
26	NC_017413	AATT	2	8	24225	24232	50 %	50 %	0 %	0 %	387826548
27	NC_017413	ATCT	2	8	24704	24711	25 %	50 %	0 %	25 %	387826549
28	NC_017413	TTGT	2	8	25170	25177	0 %	75 %	25 %	0 %	387826550
29	NC_017413	GTTT	2	8	25338	25345	0 %	75 %	25 %	0 %	387826550
30	NC_017413	AATT	2	8	25473	25480	50 %	50 %	0 %	0 %	387826550
31	NC_017413	TTAT	2	8	26930	26937	25 %	75 %	0 %	0 %	387826552
32	NC_017413	AATA	2	8	26982	26989	75 %	25 %	0 %	0 %	387826552

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.