MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp38

Total Repeats: 142

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017413	TAT	2	6	254	259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017413	AAT	2	6	266	271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017413	AGA	2	6	291	296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017413	TCT	2	6	304	309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017413	TAA	2	6	392	397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017413	ATT	2	6	399	404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017413	TTA	2	6	457	462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017413	CAA	2	6	650	655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017413	TCT	2	6	657	662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017413	ATA	2	6	700	705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017413	AAT	2	6	706	711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017413	TAT	3	9	1001	1009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017413	TAA	2	6	1017	1022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017413	TAA	2	6	1112	1117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017413	TTC	2	6	1125	1130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017413	TAT	2	6	1146	1151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017413	ACT	2	6	1266	1271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017413	TTA	2	6	1499	1504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017413	CCA	2	6	1549	1554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_017413	ATT	2	6	1587	1592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017413	GAT	2	6	1640	1645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017413	GGA	2	6	1762	1767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017413	CTT	2	6	1790	1795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017413	TAG	2	6	1834	1839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017413	TTC	2	6	2028	2033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017413	TCT	2	6	2068	2073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017413	TAG	2	6	2075	2080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017413	ATG	2	6	2241	2246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017413	GTG	2	6	2261	2266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017413	CTT	2	6	2349	2354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017413	CAT	2	6	2402	2407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017413	TTC	2	6	2409	2414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017413	ATA	2	6	2425	2430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017413	TTC	2	6	2592	2597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017413	TGA	2	6	2601	2606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017413	CTT	2	6	2741	2746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017413	CAA	2	6	2774	2779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017413	AGT	2	6	2790	2795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017413	TTC	2	6	2931	2936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017413	ATT	2	6	2964	2969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017413	TCT	2	6	2986	2991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017413	TTA	2	6	3062	3067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017413	TCA	2	6	3100	3105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017413	AGA	2	6	3129	3134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017413	TTC	2	6	3228	3233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017413	GTC	2	6	3327	3332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017413	TTC	2	6	3489	3494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017413	TTC	2	6	3498	3503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017413	TCT	2	6	3640	3645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017413	ATT	2	6	3735	3740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017413	CTT	2	6	3749	3754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017413	TAT	2	6	3761	3766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017413	TGT	2	6	3847	3852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017413	AAT	2	6	3860	3865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017413	TTC	2	6	3870	3875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017413	ATC	2	6	3921	3926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017413	TTA	2	6	3973	3978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017413	ATT	2	6	4035	4040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017413	TAT	2	6	4094	4099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017413	ATA	2	6	4196	4201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017413	TTA	2	6	4595	4600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017413	ATT	2	6	4661	4666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017413	TAC	2	6	5074	5079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017413	GAA	2	6	5252	5257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017413	ATG	2	6	5747	5752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017413	CTT	2	6	5847	5852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017413	TAT	2	6	5977	5982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017413	CTT	2	6	5998	6003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017413	CAA	2	6	6089	6094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017413	ATA	2	6	6173	6178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017413	ATA	2	6	6226	6231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017413	ATT	2	6	7842	7847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017413	ATT	2	6	7887	7892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017413	ATA	2	6	7950	7955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017413	GTC	2	6	8004	8009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017413	ATT	2	6	8050	8055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017413	ATA	2	6	8078	8083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017413	CGT	2	6	8102	8107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017413	CTT	2	6	8159	8164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017413	CTA	2	6	8212	8217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017413	TAA	3	9	8275	8283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017413	ATA	3	9	8449	8457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017413	TAA	2	6	8479	8484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017413	TCT	2	6	9537	9542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017413	ATG	2	6	9547	9552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017413	CTA	2	6	9580	9585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017413	TTA	2	6	9643	9648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017413	TAA	2	6	10126	10131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017413	CAT	2	6	10184	10189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017413	ATA	2	6	10246	10251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017413	TAT	2	6	13237	13242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017413	AAT	2	6	13249	13254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017413	ATA	2	6	13395	13400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017413	ATA	2	6	13457	13462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017413	TAT	2	6	13481	13486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017413	TAT	2	6	13493	13498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017413	ATT	2	6	13508	13513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017413	TAA	2	6	13526	13531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017413	ATA	2	6	13617	13622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017413	TAC	2	6	14027	14032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017413	TAT	3	9	14097	14105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017413	ATC	2	6	14149	14154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017413	CTG	2	6	14166	14171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017413	TAA	2	6	14181	14186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017413	ATT	2	6	14284	14289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017413	TAA	2	6	14394	14399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017413	ATA	2	6	17001	17006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017413	ATA	2	6	18131	18136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017413	ATA	2	6	18192	18197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017413	ATA	2	6	20257	20262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017413	AGT	2	6	22342	22347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017413	ATT	2	6	23183	23188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017413	TTA	2	6	23733	23738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017413	GTT	2	6	23871	23876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017413	TAG	2	6	23884	23889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017413	TAA	2	6	23961	23966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017413	TTA	2	6	23984	23989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017413	TAA	2	6	24435	24440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017413	CAT	2	6	24550	24555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017413	TAT	2	6	24977	24982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017413	TAA	2	6	24983	24988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017413	TTG	2	6	25039	25044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017413	TAA	2	6	25045	25050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017413	TAT	2	6	25051	25056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017413	ATT	2	6	25059	25064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017413	TAT	2	6	25519	25524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017413	AAC	2	6	25545	25550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017413	TAT	2	6	25585	25590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017413	ACA	2	6	25626	25631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017413	ATA	2	6	25667	25672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017413	GTT	2	6	25718	25723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017413	ATT	2	6	25786	25791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017413	TAA	2	6	26811	26816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017413	TAA	2	6	26830	26835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017413	TAA	2	6	27325	27330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017413	TTG	2	6	27357	27362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017413	AAT	2	6	27364	27369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017413	TAT	2	6	27376	27381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017413	CTG	2	6	27478	27483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017413	AGA	2	6	27488	27493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017413	TCC	2	6	27497	27502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_017413	TTA	2	6	27506	27511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.