MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-7

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017412	TAAAT	2	10	610	619	60 %	40 %	0 %	0 %	387826749
2	NC_017412	AAGTA	2	10	1640	1649	60 %	20 %	20 %	0 %	387826751
3	NC_017412	TTTGA	2	10	2329	2338	20 %	60 %	20 %	0 %	387826751
4	NC_017412	CAATT	2	10	2347	2356	40 %	40 %	0 %	20 %	387826751
5	NC_017412	TAAGT	2	10	2630	2639	40 %	40 %	20 %	0 %	387826751
6	NC_017412	TTTTA	2	10	2821	2830	20 %	80 %	0 %	0 %	387826751
7	NC_017412	TTTGA	2	10	5277	5286	20 %	60 %	20 %	0 %	387826753
8	NC_017412	CGATA	2	10	5469	5478	40 %	20 %	20 %	20 %	387826753
9	NC_017412	TTTTC	2	10	8690	8699	0 %	80 %	0 %	20 %	387826757
10	NC_017412	CTGTA	2	10	14441	14450	20 %	40 %	20 %	20 %	387826763
11	NC_017412	TTCAT	2	10	15837	15846	20 %	60 %	0 %	20 %	387826766
12	NC_017412	TGGTG	2	10	16770	16779	0 %	40 %	60 %	0 %	387826766
13	NC_017412	CAAGC	2	10	17451	17460	40 %	0 %	20 %	40 %	387826767
14	NC_017412	TTGAT	2	10	17533	17542	20 %	60 %	20 %	0 %	387826767
15	NC_017412	TGCTT	2	10	17782	17791	0 %	60 %	20 %	20 %	387826767
16	NC_017412	TATTT	2	10	19102	19111	20 %	80 %	0 %	0 %	387826769
17	NC_017412	TCAAG	2	10	19416	19425	40 %	20 %	20 %	20 %	387826770
18	NC_017412	AATGC	2	10	20457	20466	40 %	20 %	20 %	20 %	387826771
19	NC_017412	ACATA	2	10	21822	21831	60 %	20 %	0 %	20 %	387826771
20	NC_017412	TAGTT	2	10	22054	22063	20 %	60 %	20 %	0 %	387826771
21	NC_017412	CTTGA	2	10	22593	22602	20 %	40 %	20 %	20 %	387826771
22	NC_017412	TCGGT	2	10	22672	22681	0 %	40 %	40 %	20 %	387826772
23	NC_017412	GCGGA	2	10	27526	27535	20 %	0 %	60 %	20 %	387826779

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.