MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-7

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017412	ATTT	2	8	130	137	25 %	75 %	0 %	0 %	387826749
2	NC_017412	TACT	2	8	732	739	25 %	50 %	0 %	25 %	387826750
3	NC_017412	ATTT	2	8	918	925	25 %	75 %	0 %	0 %	387826750
4	NC_017412	AACA	2	8	1852	1859	75 %	0 %	0 %	25 %	387826751
5	NC_017412	CTTT	2	8	2069	2076	0 %	75 %	0 %	25 %	387826751
6	NC_017412	TTTC	2	8	2400	2407	0 %	75 %	0 %	25 %	387826751
7	NC_017412	TTAA	2	8	3137	3144	50 %	50 %	0 %	0 %	387826751
8	NC_017412	GATA	2	8	3258	3265	50 %	25 %	25 %	0 %	387826751
9	NC_017412	TTTC	2	8	4049	4056	0 %	75 %	0 %	25 %	387826751
10	NC_017412	CATC	2	8	4674	4681	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017412	ATTC	2	8	4859	4866	25 %	50 %	0 %	25 %	387826752
12	NC_017412	TATC	2	8	5292	5299	25 %	50 %	0 %	25 %	387826753
13	NC_017412	ATAA	2	8	5403	5410	75 %	25 %	0 %	0 %	387826753
14	NC_017412	ATTA	2	8	6559	6566	50 %	50 %	0 %	0 %	387826755
15	NC_017412	CAAA	2	8	6816	6823	75 %	0 %	0 %	25 %	387826755
16	NC_017412	TTAT	2	8	6950	6957	25 %	75 %	0 %	0 %	387826755
17	NC_017412	TTCT	2	8	7095	7102	0 %	75 %	0 %	25 %	387826756
18	NC_017412	ATTT	2	8	7177	7184	25 %	75 %	0 %	0 %	387826756
19	NC_017412	TATT	2	8	7460	7467	25 %	75 %	0 %	0 %	387826756
20	NC_017412	CTAA	2	8	8057	8064	50 %	25 %	0 %	25 %	387826757
21	NC_017412	CATA	2	8	8421	8428	50 %	25 %	0 %	25 %	387826757
22	NC_017412	AAAG	2	8	8841	8848	75 %	0 %	25 %	0 %	387826757
23	NC_017412	CCAT	2	8	9021	9028	25 %	25 %	0 %	50 %	387826757
24	NC_017412	CAAA	2	8	9042	9049	75 %	0 %	0 %	25 %	387826757
25	NC_017412	GTTA	2	8	9262	9269	25 %	50 %	25 %	0 %	387826757
26	NC_017412	TCTA	2	8	9307	9314	25 %	50 %	0 %	25 %	387826757
27	NC_017412	CCAA	2	8	9593	9600	50 %	0 %	0 %	50 %	387826757
28	NC_017412	TGTT	2	8	9791	9798	0 %	75 %	25 %	0 %	387826757
29	NC_017412	TTTA	2	8	10276	10283	25 %	75 %	0 %	0 %	387826757
30	NC_017412	TCGC	2	8	10307	10314	0 %	25 %	25 %	50 %	387826757
31	NC_017412	TTTG	2	8	10810	10817	0 %	75 %	25 %	0 %	387826757
32	NC_017412	GTTC	2	8	11183	11190	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017412	AAAC	2	8	11198	11205	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017412	AATT	2	8	11467	11474	50 %	50 %	0 %	0 %	387826758
35	NC_017412	ATTA	2	8	11840	11847	50 %	50 %	0 %	0 %	387826758
36	NC_017412	AATC	2	8	12457	12464	50 %	25 %	0 %	25 %	387826759
37	NC_017412	AAGT	2	8	13057	13064	50 %	25 %	25 %	0 %	387826760
38	NC_017412	AATT	2	8	13339	13346	50 %	50 %	0 %	0 %	387826761
39	NC_017412	AAAG	2	8	13528	13535	75 %	0 %	25 %	0 %	387826762
40	NC_017412	TAAA	2	8	13637	13644	75 %	25 %	0 %	0 %	387826762
41	NC_017412	TTTG	2	8	13746	13753	0 %	75 %	25 %	0 %	387826762
42	NC_017412	AACA	2	8	14009	14016	75 %	0 %	0 %	25 %	387826763
43	NC_017412	ATCT	2	8	15267	15274	25 %	50 %	0 %	25 %	387826765
44	NC_017412	ATTT	2	8	15775	15782	25 %	75 %	0 %	0 %	387826765
45	NC_017412	TTTC	2	8	15880	15887	0 %	75 %	0 %	25 %	387826766
46	NC_017412	CTTA	2	8	15890	15897	25 %	50 %	0 %	25 %	387826766
47	NC_017412	TGAA	2	8	16148	16155	50 %	25 %	25 %	0 %	387826766
48	NC_017412	GTTT	2	8	17007	17014	0 %	75 %	25 %	0 %	387826767
49	NC_017412	GCAA	2	8	17075	17082	50 %	0 %	25 %	25 %	387826767
50	NC_017412	ATTG	2	8	17849	17856	25 %	50 %	25 %	0 %	387826767
51	NC_017412	TTTC	2	8	17915	17922	0 %	75 %	0 %	25 %	387826767
52	NC_017412	AAAG	2	8	18322	18329	75 %	0 %	25 %	0 %	387826768
53	NC_017412	AATA	2	8	18476	18483	75 %	25 %	0 %	0 %	387826769
54	NC_017412	AATT	2	8	18615	18622	50 %	50 %	0 %	0 %	387826769
55	NC_017412	TTTG	2	8	18826	18833	0 %	75 %	25 %	0 %	387826769
56	NC_017412	TACC	2	8	19195	19202	25 %	25 %	0 %	50 %	387826770
57	NC_017412	TTCC	2	8	19662	19669	0 %	50 %	0 %	50 %	387826770
58	NC_017412	ATTG	2	8	21706	21713	25 %	50 %	25 %	0 %	387826771
59	NC_017412	TGCT	2	8	22374	22381	0 %	50 %	25 %	25 %	387826771
60	NC_017412	TTGT	2	8	22908	22915	0 %	75 %	25 %	0 %	387826772
61	NC_017412	GGTT	2	8	22919	22926	0 %	50 %	50 %	0 %	387826772
62	NC_017412	AAGA	2	8	22954	22961	75 %	0 %	25 %	0 %	387826772
63	NC_017412	TTAC	2	8	23758	23765	25 %	50 %	0 %	25 %	387826774
64	NC_017412	AATC	2	8	23783	23790	50 %	25 %	0 %	25 %	387826774
65	NC_017412	AATA	2	8	23847	23854	75 %	25 %	0 %	0 %	387826774
66	NC_017412	AGAT	2	8	24403	24410	50 %	25 %	25 %	0 %	387826775
67	NC_017412	ATTT	2	8	24443	24450	25 %	75 %	0 %	0 %	387826775
68	NC_017412	TACT	2	8	24512	24519	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017412	TAAA	2	8	24530	24537	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017412	CTAG	2	8	24545	24552	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017412	TGAT	2	8	25036	25043	25 %	50 %	25 %	0 %	387826776
72	NC_017412	GGAA	2	8	25978	25985	50 %	0 %	50 %	0 %	387826776
73	NC_017412	GATA	2	8	27355	27362	50 %	25 %	25 %	0 %	387826778
74	NC_017412	ATCA	2	8	27365	27372	50 %	25 %	0 %	25 %	387826778
75	NC_017412	ACAT	2	8	27864	27871	50 %	25 %	0 %	25 %	387826779
76	NC_017412	ACAA	2	8	28405	28412	75 %	0 %	0 %	25 %	387826780
77	NC_017412	TCTA	2	8	29016	29023	25 %	50 %	0 %	25 %	387826780
78	NC_017412	TTGA	2	8	29303	29310	25 %	50 %	25 %	0 %	387826781
79	NC_017412	TAAT	2	8	29511	29518	50 %	50 %	0 %	0 %	387826781
80	NC_017412	ATTC	2	8	29782	29789	25 %	50 %	0 %	25 %	387826781
81	NC_017412	ATTT	2	8	29792	29799	25 %	75 %	0 %	0 %	387826781

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.