MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-7

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017412	TA	3	6	22	27	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017412	AC	3	6	1240	1245	50 %	0 %	0 %	50 %	387826750
3	NC_017412	AT	3	6	2139	2144	50 %	50 %	0 %	0 %	387826751
4	NC_017412	AT	3	6	2571	2576	50 %	50 %	0 %	0 %	387826751
5	NC_017412	TA	3	6	4290	4295	50 %	50 %	0 %	0 %	387826751
6	NC_017412	AT	3	6	4340	4345	50 %	50 %	0 %	0 %	387826751
7	NC_017412	AT	4	8	4447	4454	50 %	50 %	0 %	0 %	387826751
8	NC_017412	AT	3	6	4502	4507	50 %	50 %	0 %	0 %	387826751
9	NC_017412	TC	3	6	4525	4530	0 %	50 %	0 %	50 %	387826751
10	NC_017412	AT	3	6	5389	5394	50 %	50 %	0 %	0 %	387826753
11	NC_017412	AT	3	6	5746	5751	50 %	50 %	0 %	0 %	387826754
12	NC_017412	AT	3	6	5859	5864	50 %	50 %	0 %	0 %	387826754
13	NC_017412	AT	3	6	5944	5949	50 %	50 %	0 %	0 %	387826754
14	NC_017412	AT	3	6	5985	5990	50 %	50 %	0 %	0 %	387826754
15	NC_017412	TA	3	6	6326	6331	50 %	50 %	0 %	0 %	387826754
16	NC_017412	TC	3	6	6568	6573	0 %	50 %	0 %	50 %	387826755
17	NC_017412	TA	3	6	6637	6642	50 %	50 %	0 %	0 %	387826755
18	NC_017412	TA	3	6	7273	7278	50 %	50 %	0 %	0 %	387826756
19	NC_017412	TA	3	6	7386	7391	50 %	50 %	0 %	0 %	387826756
20	NC_017412	AT	3	6	7481	7486	50 %	50 %	0 %	0 %	387826756
21	NC_017412	TA	3	6	7954	7959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017412	AT	3	6	8267	8272	50 %	50 %	0 %	0 %	387826757
23	NC_017412	TC	3	6	8722	8727	0 %	50 %	0 %	50 %	387826757
24	NC_017412	TA	3	6	10320	10325	50 %	50 %	0 %	0 %	387826757
25	NC_017412	TC	3	6	10507	10512	0 %	50 %	0 %	50 %	387826757
26	NC_017412	TA	3	6	12152	12157	50 %	50 %	0 %	0 %	387826759
27	NC_017412	GA	3	6	13573	13578	50 %	0 %	50 %	0 %	387826762
28	NC_017412	TG	3	6	16564	16569	0 %	50 %	50 %	0 %	387826766
29	NC_017412	CA	4	8	17340	17347	50 %	0 %	0 %	50 %	387826767
30	NC_017412	AC	3	6	17515	17520	50 %	0 %	0 %	50 %	387826767
31	NC_017412	TA	3	6	17553	17558	50 %	50 %	0 %	0 %	387826767
32	NC_017412	TC	3	6	17612	17617	0 %	50 %	0 %	50 %	387826767
33	NC_017412	TA	3	6	17814	17819	50 %	50 %	0 %	0 %	387826767
34	NC_017412	AT	3	6	18414	18419	50 %	50 %	0 %	0 %	387826769
35	NC_017412	AG	3	6	19076	19081	50 %	0 %	50 %	0 %	387826769
36	NC_017412	GA	3	6	19588	19593	50 %	0 %	50 %	0 %	387826770
37	NC_017412	GT	3	6	20079	20084	0 %	50 %	50 %	0 %	387826771
38	NC_017412	TG	3	6	20225	20230	0 %	50 %	50 %	0 %	387826771
39	NC_017412	GT	3	6	21200	21205	0 %	50 %	50 %	0 %	387826771
40	NC_017412	AT	3	6	21380	21385	50 %	50 %	0 %	0 %	387826771
41	NC_017412	TC	3	6	21773	21778	0 %	50 %	0 %	50 %	387826771
42	NC_017412	AT	3	6	24693	24698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017412	AT	3	6	24845	24850	50 %	50 %	0 %	0 %	387826776
44	NC_017412	TA	3	6	25266	25271	50 %	50 %	0 %	0 %	387826776
45	NC_017412	GA	3	6	26184	26189	50 %	0 %	50 %	0 %	387826776
46	NC_017412	AT	3	6	26579	26584	50 %	50 %	0 %	0 %	387826777
47	NC_017412	AT	3	6	26650	26655	50 %	50 %	0 %	0 %	387826777
48	NC_017412	AG	3	6	27001	27006	50 %	0 %	50 %	0 %	387826778
49	NC_017412	GT	3	6	27189	27194	0 %	50 %	50 %	0 %	387826778
50	NC_017412	AG	3	6	27248	27253	50 %	0 %	50 %	0 %	387826778
51	NC_017412	AG	3	6	28156	28161	50 %	0 %	50 %	0 %	387826779
52	NC_017412	AT	3	6	28432	28437	50 %	50 %	0 %	0 %	387826780
53	NC_017412	GT	3	6	29371	29376	0 %	50 %	50 %	0 %	387826781
54	NC_017412	TA	3	6	29866	29871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.